cluster # 6892

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Schistosoma mansoni
cluster # 6892 cluster # 6892 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6892#0 length = 631 sequences # 4

consensusID : consensus_6892#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 631
fasta sequence

                              [CTTGCTCTTGTCTATCAAGTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGNGCTTATCTTCTTTGTGAAAACG-TGCCTAATTTCGAGCCA]

[+] EMBL CD078842             [CTTGCTCTTGTCTATCAAGTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGGTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGATTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCATCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGATACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGATTCTGTGCT                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD082749             [                  GTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGG TTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGNGCTTATCTTCTTTGTGAAAACG TGCCTAATTTCGAGCCA]
[+] EMBL CD083609             [                                                                                      gaggATTGTTTCAAACCTACGGGTACTA TTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGTGCTTATCTTCTTTGTG AAACGTTGCCTt           ]
[-] EMBL CD179051             [                                                                                                                                                                                                     ATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAAC                                                                                   ]




>consensus_6892#0
CTTGCTCTTGTCTATCAAGTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTAT
TTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTA
TTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCT
TAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTC
TCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAA
GAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTAT
TTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGC
CCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGT
GCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCA
AGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGNGCTTATCT
TCTTTGTGAAAACGTGCCTAATTTCGAGCCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case