Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6899 cluster # 6899       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6899#0 length = 751 sequences # 4  
consensusID : consensus_6899#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 751
fasta sequence 
                              [ATCGCCCACCTGTTCAACTTCAAACACATCCTAATATTGATAAGAAAACTTTCACGTCCACTGGTTGGATTCAAATCAACCNNGGAGGTAAACCATTTCCAAGTGATCAAAAGGTGGGAATTTTACGATGGAGATTTCAAACTTCCGATGAAGCTGCTCTTCCTATAACTGTTAATTGTTGGCCAAATGAAATACCCGGTGGCTTTGAAGTAAATGTTGAATATGAATTACAAGATCCAATATTAGAATTGGAGAATCTAGTTATGTCAATACCTTTGCCTCCTTCAACTAAACCTCCGTTAATTGGTAATTGTGATGGAGAATATGAAGTTAGTCCACGTAAAAACCAATTAGACTGGCGTATACCCATAGTTAACAATGAAAATTCATCTGGTTCCCTTGAGTTCACATTAAAAACAGAACGTGGTGCACAAGCAGAACAATTTTTCCCGTTGAAATTAAACTTTGGATCAAATAAATCATACTGTGGAATTCAGATAATAGAAGCTACTGTGAGCAATCAGGATACCCCAATTAACTTTTCATTTGAATCCAATTTTCATACGGAAAAATACGAAATTAGTTAAATGAATAGTTTCGTCCTTTTTACGTCTTCTTCAGTCTCTTTGGTGTTGTGTGTATGTGTGTGCGCGTGTGTATCAATTGGCTTTGTTATTCAGTTTGCCTAATCATCTGTGATTTGGATTATTGNNATGGNGNTNTCATTTACTTTGNTCTCTTTTAATATATG]

[+] EMBL CD079264             [ATCGCCCACCTGTTCAACTTCAAACACATCCTAATATTGATAAGAAAACTTTCACGTCCACTGGTTGGATTCAAATCAACCNNGGAGGTAAACCATTTCCAAGTGATCAAAAGGTGGGAATTTTACGATGGAGATTTCAAACTTCCGATGAAGCTGCTCTTCCTATAACTGTTAATTGTTGGCCAAATGAAATACCCGGTGGCTTTGAAGTAAATGTTGAATATGAATTACAAGATCCAATATTAGAATTGGAGAATCTAGTTATGTCAATACCTTTGCCTCCTTCAACTAAACCTCCGTTAATTGGTAATTGTGATGGAGAATATGAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD145792             [                                                                                                                        TTTTACGATGGAGATTTCAAACTTCCGATGAAGCTGCTCTTCCTATAACTGTTAATTGTTGGCCAAATGAAATACCCGGTGGCTTTGAAGTAAATGTTGAATATGAATTACAAGATCCAATATTAGAATTGGAGAATCTAGTTATGTCAATACCTTTGCCTCCTTCAACTAAACCTCCGTTAATTGGTAATTGTGATGGAGAATATGAAGTTAGTCCACGTAAAAACCAATTAGACTGGCGTATACCCATAGTTAACAATGAAAATTCATCTGGTTCCCTTGAGTTCACATTAAAAACAGAACGTGGTGCACAAGCAGAACAATTTTTCCCGTTGAAATTAAACTTTGGATCAAATAAATCATACTGTGGAATTCAGATAATAGAAGCTACTGTGAGCAATCAGGATACCCCAATTAACTTTTCATTTGAATCCAATTTTCATACGGAAAAATACGAAATTAGTTAAATGAATAGTTTCGTCCTTTTTACGTCTTCTTCAGTCTCTTTGGTGTTGTGTGTATGTGTGTGCGCGTGTGTATCAATTGGCTTTGTTATTCAGTTTGCCTAATCATCTGTGATTTGGATTATTGNNATGGNGNTNTCATTTACTTTGNTCTCTTTTA       ]
[+] EMBL CD115094             [                                                                                                                        TTTTACGATGGAGATTTCAAACTTCCGATGAAGCTGCTCTTCCTATAACTGTTAATTGTTGGCCAAATGAAATACCCGGTGGCTTTGAAGTAAATGTTGAATATGAATTACAAGATCCAATATTAGAATTGGAGAATCTAGTTATGTCAATACCTTTGCCTCCTTCAACTAAACCTCCGTTAATTGGTAATTGTGATGGAGAATATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AI067106             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAAAATTCATCTGTTTCCCTTGAGTTCACATTAAAAACAGAACGTGGTGCACAAGCAGAACAATTTTTCCCGTTGAAATTAAACTTTGGATCAAATAAATCATACTGTGGAATTCAGATAATAGAAGCTACTGTGAGCAATCAGGATACCCCAATTAACTTTTCATTTGAATCCAATTTTCATACGGAAAAATACGAAATTAGTTAAATGAATAGTTTCGTCCTTTTTTCGCCTTCTTCAGTCTCTTTGGTGTTGTGTGTATGTGTGTGCGCGTGTGTATCAATTGGCTTTGTTATTCAGTTTGCCTAATCATCTGTGATTTGGATTATTGTAATGGGGTTTTCATTTACTTTGTTCTCTTTTTATATATG]




>consensus_6899#0
ATCGCCCACCTGTTCAACTTCAAACACATCCTAATATTGATAAGAAAACTTTCACGTCCA
CTGGTTGGATTCAAATCAACCNNGGAGGTAAACCATTTCCAAGTGATCAAAAGGTGGGAA
TTTTACGATGGAGATTTCAAACTTCCGATGAAGCTGCTCTTCCTATAACTGTTAATTGTT
GGCCAAATGAAATACCCGGTGGCTTTGAAGTAAATGTTGAATATGAATTACAAGATCCAA
TATTAGAATTGGAGAATCTAGTTATGTCAATACCTTTGCCTCCTTCAACTAAACCTCCGT
TAATTGGTAATTGTGATGGAGAATATGAAGTTAGTCCACGTAAAAACCAATTAGACTGGC
GTATACCCATAGTTAACAATGAAAATTCATCTGGTTCCCTTGAGTTCACATTAAAAACAG
AACGTGGTGCACAAGCAGAACAATTTTTCCCGTTGAAATTAAACTTTGGATCAAATAAAT
CATACTGTGGAATTCAGATAATAGAAGCTACTGTGAGCAATCAGGATACCCCAATTAACT
TTTCATTTGAATCCAATTTTCATACGGAAAAATACGAAATTAGTTAAATGAATAGTTTCG
TCCTTTTTACGTCTTCTTCAGTCTCTTTGGTGTTGTGTGTATGTGTGTGCGCGTGTGTAT
CAATTGGCTTTGTTATTCAGTTTGCCTAATCATCTGTGATTTGGATTATTGNNATGGNGN
TNTCATTTACTTTGNTCTCTTTTAATATATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)