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Schistosoma mansoni
cluster # 6902 cluster # 6902       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6902#0 length = 412 sequences # 4  

consensusID : consensus_6902#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 412
fasta sequence
                              [GATCCCTGCATCTGGCATCAAGTGTAAACCACGTTTCACAACGTACAGTTGGTGCATTTGCATTAGCACCGTGTTGTAATAATAAAACGACAATATTTAGATGCCCCATGAAACATGCAACGTGTAATGGTGTTAAACCAGACTCTGTTGTAGCTTGAATCAAACAATTATATTTCAATAATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTAAAGGTGTAAATCCATTTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACATTACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAA-TTGTTGGATCGTCAATTTGTGCTCCATGTTGTAAAAGTAAACGTGCAGTATCCACGTGATCACCTTGCTG]

[+] EMBL CD061158             [GATCCCTGCATCTGGCATCAAGTGTAAACCACGTTTCACAACGTACAGTTGGTGCATTTGCATTAGCACCGTGTTGTAATAATAAAACGACAATATTTAGATGCCCCATGAAACATGCAACGTGTAATGGTGTTAAACCAGACTCTGTTGTAGCTTGAATCAAACAATTATATTTCAATAATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTAAAGGTGTAAATCCACTTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACATTACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAA TTGTTGGATCGTCAATTTGTGCTCCATGTTGTAAAAGCAAACGTGCAGTATCC                 ]
[+] EMBL CD061171             [                  CAAGTGTAAACTA G TTCACAACGTACAGTTGGTGCATTTGCTTTAGCACCGTGTTGTAATAATAAAACGACAATATTTAGATGCCCCATGAAACATGCAACGTGTAATGGTGTTAAACCAGACTCTGTTGTAGCTTGAATCAAACAATTATATTTCGATAATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTCAAGGTGTAAATCCATTTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACATTACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAA TTGTAGGATCGTCAATTTGTGCTCCATGTTGTAAAAGTAAACGT                          ]
[+] EMBL CD061123             [                               aaTTTAACACCGTTCAGTTGGTGCATTAGCATTAGCACCGAGTTGTAATAATAAAACGACAATATTTAAATGCCCCATGAAACATGCAACGTGTAATGGTGTTAAACCAAACTCTGTTGTATCTTGAATCAAACAATTATATTTCAATAATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTAAAGGTGTAAATCCATTTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACATTACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAA TTGTTGGATCGTCAATTTGTGCTCCATGTTGTAAAAGTAAACGTGCAGTATCC                 ]
[-] EMBL CD061169             [                                                                                                                                                                                 ATAATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTAAAGGTGTAAATCCATTTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACATTACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAAGTTGTTGGATCGTCAATTTGTGCTCCATGTTGTAAAAGTAAACGTGCAGTATCCACGTGATCACCTTGCTG]


>consensus_6902#0 GATCCCTGCATCTGGCATCAAGTGTAAACCACGTTTCACAACGTACAGTTGGTGCATTTG CATTAGCACCGTGTTGTAATAATAAAACGACAATATTTAGATGCCCCATGAAACATGCAA CGTGTAATGGTGTTAAACCAGACTCTGTTGTAGCTTGAATCAAACAATTATATTTCAATA ATAGTTCAACAATTTTAATTCGGTTCTTTTGACATGCAATATGTAAAGGTGTAAATCCAT TTAATGCTCTTGCATTGACATCACATCCACGCTCAAGTAATAATTTCGCTACACGTACAT TACCACAATGTGCAGCAACATGTAATGCAGTTAAATAATCAATTGTTGGATCGTCAATTT GTGCTCCATGTTGTAAAAGTAAACGTGCAGTATCCACGTGATCACCTTGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)