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Schistosoma mansoni
cluster # 6917 cluster # 6917       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6917#0 length = 1092 sequences # 4  
consensusID : consensus_6917#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1092
fasta sequence 
                              [TGGAGCAAATACTGTAACTTAAACCAGACCTAATCGTTCAGCTTCGTGTTACAGGATCTTAAAATAATCGCACAAACGTTCCACATCTAAAGAGTAGTTAGTTAAAAACTATGGACACCTGGAATTCACGGGACATTCCCAATGAAACATTTAATCATGATGTGATTCTTATCGAATGTACTGTCAAATTATACAAGGATAATGCAATAAAGGACCCACGATACAATCTTGGTGCTGATGATCATCGCGATTTAATGATGCTGACTTATTTTATGTCTACTTTGGCTTGTGCATATACTAGCTTACCTTCTAGATTAAAAGATGAATCTCTTGGACATCCAGTAGCACATTTGCTGGATTGTATCCCTTACCAAGTTCCTGTTACTGTTCCATCTAAACAACAAAATACATGTGAAAATGTAAATGAACAGAAAAATGTAATACTCAGTAGCTCTGTTTCTATGTCCGATGTTCAGCACAATACATTAAAAATTGATTCGTTAAACACTAATAAGAATGATTCAAATCATTTGGCCTTTCGGATAATGCGCCCGGATTCTAAACTATTTGCAGAAGATTCTGCTTTTCCATCAAGTGTCGATAATTTATTAGCTTGTTTAAATGCTACTCTAGTTGCCCTTTGCGTTGTACCACGACATAATATAACTGAACCAGATTCTACTTGCATGTATCGTTGGATATCATCCAATCCGGTTTGTGAGTGTGTAGGTCTAGCGATTTGTCGCGCTGTTGATCCTACCGCTGGTGTAATTTATTTAACGACTGGTGTTTCGGAGGATGATTTGCTGAAAGTGACAGGAATTCTACGTGGTAATGTCAACTTACCCAATTGTTTTTTCCTAGATCAGCCTTTCTTTNCGACTAAAGNTTATGAAGAAACACCCTGNTTCCTNCCCTACTTGNGTCCAGNTAGTACACAGGGAAAAGGACGTGCANGTTTACCATNNCAGCGCTCTTACCTAANACATGCATACGTCACTCATCGCATGGGCACTCAGAGATCATGATTAAACTATATTTTGGAAACCTCTTATGAANGATTCATGTGTTCTTTCTCCGAATAGCTCANCT]

[+] EMBL CD155847             [TGGAGCAAATACTGTAACTTAAACCAGACCTAATCGTTCAGCTTCGTGTTACAGGATCTTAAAATAATCGCACAAACGTTCCACATCTAAAGAGTAGTTAGTTAAAAACTATGGACACCTGGAATTCACGGGACATTCCCAATGAAACATTTAATCATGATGTGATTCTTATCGAATGTACTGTCAAATTATACAAGGATAATGCAATAAAGGACCCACGATACAATCTTGGTGCTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BG932557             [                                                                                                                                        ttCCAATGAAACATTTAATCATGATGTGATTCTTATAGAATCTAATGTCAAATTATACAAGGATAATACAATAAATGACCCACGATACAATCTTGGTCCTCCTGATCATCGCGATTTAATGATGCTGACTTATTTTATGTCTACTTTGGCTTGTGCATATACTAGCTTACCTTCTAGATTAAAAGATGAATCTCTTGGACATCCAGTAGCACATTTGCTGGATTGTATCCCTTACCAAGTTCCTGTTACTGTTCCATCTAAACAACAAAATACATGTGAAAATGTAAATGAACAGAAAAATGTAATACTCAGTAGCTCTGTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD080558             [                                                                                                                                                                                                                                                     CGCGATTTAATGATGCTGACTTATTTTATGTCTACTTTGGCTTGTGCATATACTAGCTTACCTTCTAGATTAAAAGATGAATCTCTTGGACATCCAGTAGCACATTTGCTGGATTGTATCCCTTACCAAGTTCCTGTTACTGTTCCATCTAAACAACAAAATACATGTGAAAATGTAAATGAACAGAAAAATGTAATACTCAGTAGCTCTGTTTCTATGTCCGATGTTCAGCACAATACATTAAAAATTGATTCGTTAAACACTAATAAGAATGATTCAAATCATTTGGCCTTTCGGATAATGCGCCCGGATTCTAAACTATTTGCAGAAGATTCTGCTTTTCCATCAAGTGTCGATAATTTATTAGCTTGTTTAAATGCTACTCTAGTTGCCCTTTGCGTTGTACCACGACATAATATAACTGAACCAGATTCTACTTGCATGTATCGTTGGATATCATCCAATCCGGTTTGTGAGTGTGTAGGTCTAGCGATTTGTCGCGCTGTTGATCCTACCGCTGGTGTAATTTATTTAACGACTGGTGTTTCGGAGGATGATTTGCTGAAAGTGACAGGAATTCTACGTGGTAATGTCAACTTACCCAATTGTTTTTTCCTAGATCAGCCTTTCTTTNCGACTAAAGNTTATGAAGAAACACCCTGNTTCCTNCCCTACTTGNGTCCAGNTAGTACACAGGGAAAAGGACGTGCANGTTTACCATNNCAGCGCTCTTACCTAANACATGCATACGTCACTCATCGCATGGGCACTCAGAGATCATGATTAAACTATATTTTGGAAACCTCTTATGAANGATTCATGTGTTCTTTCTCCGAATAGCTCANCT]
[+] EMBL CD160008             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAATCTCTTGGACATCCAGTAGCACGTTTGCTGGATTGTATCCCTTACCAAGTTCCTGTTACTGTTCCATCTAAACAACAAAATACATGTGAAAATGTAAATGAACAGAAAAATGTAATACTCAGTAGCTCTGTTTCTATGTCCGATGTTCAGCACAATACATTAAAAATTGATTCGTTAAACACTAATAAGAATGATTCAAATCATTTGGCCTTTCGGATAATGCGCCCGGATTCTAAACTATTTGCAGAAGATTCTGCTTTTCCATCAAGTGTCGATAATTTATTAGCTTGTTTAAATGCTACTCTAGTTGCCCTTTGCGTTGTACCACGACATAATATAACTGAACCAGATTCTACTTGCATGTATCGTTGGATATCATCCAATCCGGTTTGTGAGTGTGTAGGTCTAGCGATTTGTCGCGCTGTTGATCCTACCGCTGGTGTAATTTATTTAACGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]




>consensus_6917#0
TGGAGCAAATACTGTAACTTAAACCAGACCTAATCGTTCAGCTTCGTGTTACAGGATCTT
AAAATAATCGCACAAACGTTCCACATCTAAAGAGTAGTTAGTTAAAAACTATGGACACCT
GGAATTCACGGGACATTCCCAATGAAACATTTAATCATGATGTGATTCTTATCGAATGTA
CTGTCAAATTATACAAGGATAATGCAATAAAGGACCCACGATACAATCTTGGTGCTGATG
ATCATCGCGATTTAATGATGCTGACTTATTTTATGTCTACTTTGGCTTGTGCATATACTA
GCTTACCTTCTAGATTAAAAGATGAATCTCTTGGACATCCAGTAGCACATTTGCTGGATT
GTATCCCTTACCAAGTTCCTGTTACTGTTCCATCTAAACAACAAAATACATGTGAAAATG
TAAATGAACAGAAAAATGTAATACTCAGTAGCTCTGTTTCTATGTCCGATGTTCAGCACA
ATACATTAAAAATTGATTCGTTAAACACTAATAAGAATGATTCAAATCATTTGGCCTTTC
GGATAATGCGCCCGGATTCTAAACTATTTGCAGAAGATTCTGCTTTTCCATCAAGTGTCG
ATAATTTATTAGCTTGTTTAAATGCTACTCTAGTTGCCCTTTGCGTTGTACCACGACATA
ATATAACTGAACCAGATTCTACTTGCATGTATCGTTGGATATCATCCAATCCGGTTTGTG
AGTGTGTAGGTCTAGCGATTTGTCGCGCTGTTGATCCTACCGCTGGTGTAATTTATTTAA
CGACTGGTGTTTCGGAGGATGATTTGCTGAAAGTGACAGGAATTCTACGTGGTAATGTCA
ACTTACCCAATTGTTTTTTCCTAGATCAGCCTTTCTTTNCGACTAAAGNTTATGAAGAAA
CACCCTGNTTCCTNCCCTACTTGNGTCCAGNTAGTACACAGGGAAAAGGACGTGCANGTT
TACCATNNCAGCGCTCTTACCTAANACATGCATACGTCACTCATCGCATGGGCACTCAGA
GATCATGATTAAACTATATTTTGGAAACCTCTTATGAANGATTCATGTGTTCTTTCTCCG
AATAGCTCANCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)