cluster # 6919

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Schistosoma mansoni
cluster # 6919 cluster # 6919 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6919#0 length = 766 sequences # 4

consensusID : consensus_6919#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 766
fasta sequence

                              [ATTGGACAACGTATGGATCGAATTGCTAATGAATACATCAAACTTCAATTTTTCAATAAAAAGTGTCGTGGTCATCCAATTTTAAATTCATTAAAACCACGTATTAATTGGATTACAGTAAATCTTCAGGAACAATTAGAGATACGTTTAAAGGAGAGTTTCAAAGCATGTTGTTTAACAGTAATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAA-GTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTAAATTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCAGGTTCTGACATTGCATTAGCTGCT-GAGACTTTGAACTCGATGTACACCAGAGCACTGAAAGTTCTTGATTCACAACTGTATTATGTGAAAGAACAGATTATTAGATACTCACCTGAAGGCTCTGAACCTTTATCGGATTTCGATTGTCTAGTCGGTGGATTTTGGCCTGAAACAATTGATCTTATCTGTAATAATCTATCGGAAATATTTTCTTCAGGTCATCCAGACAGATTCTATTCCTTATATACTATCAGCATGAATTTTATTAAAACAGTTGAAACAAAGACTTGGTCAACTAACCAACTTGTCAATTTACGCAATCATTCATCTTATTCAATGTTTATAGATAAATGGAGTTTACCAGTTTACTTTCAAATCAGGCTCCAAGAAATAGCTGGAAATGTTG]

[+] EMBL CD193620             [ATTGGACAACGTATGGATCGAATTGCTAATGAATACATCAAACTTCAATTTTTCAATAAAAAGTGTCGTGGTCATCCAATTTTAAATTCATTAAAACCACGTATTAATTGGATTACAGTAAATCTTCAGGAACAATTAGAGATACGTTTAAAGGAGAGTTTCAAAGCATGTTGTTTAACAGTAATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAA GTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTANATTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCNAGTTCTGACATTGCATTAGCTGCTNGAGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD183697             [                                                                                                                                       TTAGAGATACGTTTAAAGGAGAGTTTCAAAGCATGTTGTTTAACAGTAATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAA GTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTAAATTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCAGGTTCTGACATTGCATTAGCTGCT GAGACTTTGAACTCGATGTACACCAGAGCACTGAAAGTTCTTGATTCACAACTGTATTATGTGAAAGAACAGATTATTAGATACTCACCTGAAGGCTCTGAACCTTTATCGGATTTCGATTGTCTAGTCGGTGGATTTTGGCCTGAAACAATTGATCTTATCTGTAATAATCTATCGGAAATATTTTC                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD157447             [                                                                                                                                                CGTTTAAAGGAGAGTTTCAAAGCATGTTGTTTAACAGTAATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAA GTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTAAATTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCAGGTTCTGACATTGCATTAGCTGCT GAGACTTTGAACTCGATGTACACCAGAGCACTGAAAGTTCTTGATTCACAACTGTATTATGTGAAAGAACAGATTATTAGATACTCACCTGAAGGCTCTGAACC TTATCGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD081388             [                                                                                                                                                                                      AATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAAGGTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTAAATTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCAGGTTCTGACATTGCATTAGCTGCT GAGACTTTGAACTCGATGTACACCAGAGCACTGAAAGTTCTTGATTCACAACTGTATTATGTGAAAGAACAGATTATTAGATACTCACCTGAAGGCTCTGAACCTTTATCGGATTTCGATTGTCTAGTCGGTGGATTTTGGCCTGAAACAATTGATCTTATCTGTAATAATCTATCGGAAATATTTTCTTCAGGTCATCCAGACAGATTCTATTCCTTATATACTATCAGCATGAATTTTATTAAAACAGTTGAAACAAAGACTTGGTCAACTAACCAACTTGTCAATTTACGCAATCATTCATCTTATTCAATGTTTATAGATAAATGGAGTTTACCAGTTTACTTTCAAATCAGGCTCCAAGAAATAGCTGGAAATGTTG]




>consensus_6919#0
ATTGGACAACGTATGGATCGAATTGCTAATGAATACATCAAACTTCAATTTTTCAATAAA
AAGTGTCGTGGTCATCCAATTTTAAATTCATTAAAACCACGTATTAATTGGATTACAGTA
AATCTTCAGGAACAATTAGAGATACGTTTAAAGGAGAGTTTCAAAGCATGTTGTTTAACA
GTAATTGATACAAATGTTGATTGTACAATACCTAAACATTCTATTGAACAATTAAGACAA
GTTCTTTCCATATATTTGGCTATTGATAAATTATCTGATTTATTGATACTATATCGTAAA
TTTGTACTTCATGATCAACTTAGTCAGATATTTACTCCTCGACCTGAATTGACCCATGCA
GGTTCTGACATTGCATTAGCTGCTGAGACTTTGAACTCGATGTACACCAGAGCACTGAAA
GTTCTTGATTCACAACTGTATTATGTGAAAGAACAGATTATTAGATACTCACCTGAAGGC
TCTGAACCTTTATCGGATTTCGATTGTCTAGTCGGTGGATTTTGGCCTGAAACAATTGAT
CTTATCTGTAATAATCTATCGGAAATATTTTCTTCAGGTCATCCAGACAGATTCTATTCC
TTATATACTATCAGCATGAATTTTATTAAAACAGTTGAAACAAAGACTTGGTCAACTAAC
CAACTTGTCAATTTACGCAATCATTCATCTTATTCAATGTTTATAGATAAATGGAGTTTA
CCAGTTTACTTTCAAATCAGGCTCCAAGAAATAGCTGGAAATGTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case