Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6937 cluster # 6937       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6937#0 length = 954 sequences # 4  

consensusID : consensus_6937#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 954
fasta sequence
                              [GTCGCGATTGATCGGAAAATGTCCGCTACCTCGTGCTCGTTTGTTAGAAATTAGCTACGTATTCAAAGCGTTGACAGTTATGTTAACTTCACTTCAATCTGTTCCAATACAACATGACGTGGATGATTCAATTATACTAGACCAGATTGAATCATATCCTCATATTGTTGATTGTATTCTGGTGACCGGTGGAAGTAGTCAAATAGCATTAGCTTTACATCATCTTTTACGACTTTATGGTGAATTCCTTGCTCCATCACATTTACGTCCAGGAGGCAGTAACAATATTAATAATGAAGATTACAGTGGTATTGTTCATGGCAATAATATTAACAGTATGAATATCGAGAATGATATTACCAATAATAATATCAGTCAGAATAAAACATCATTGAATGGAACATGATTGAATCATATGTTATTGGTTTTTGTGAAGAATAATTTTTTTACATTTGTGATATGTTTTATATGAATTTCTAAATTATATACTTTACTCATTTATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTTTTTTAATTTGTGCTACTTTCTATTTACAGTTTATCATATTTAGTTTTATCTTTGTCATGTTTTTTTATTACCGTCCCACGCTATTCAACTATTTTGTTTCCGACATACAAAATATCTTTTGTCCATTTCCATAATGCTGCATACCTTCCATTTTCTAATAAGTCAATTAAATTCTTAATCGATTTGTTTTTTTCAACTTATATCATATAACTTTATTGTTTGTTTTGTTTTCATTTTAATAAGAGAAAGATGAAAGTGCTGATAACTTTGTTAAATTACTTTTGATTCTTTGTGTAAAACTAATGAAGTAAATAAAACTATGATTAACTGTTATAAAATTGATTTTATTAAAGATTTG]

[+] EMBL CD083101             [GTCGCGATTGATCGGAAAATGTCCGCTACCTCGTGCTCGTTTGTTAGAAATTAGCTACGTATTCAAAGCGTTGACAGTTATGTTAACTTCACTTCAATCTGTTCCAATACAACATGACGTGGATGATTCAATTATACTAGACCAGATTGAATCATATCCTCATATTGTTGATTGTATTCTGGTGACCGGTGGAAGTAGTCAAATAGCATTAGCTTTACATCATCTTTTACGACTTTATGGTGAATTCCTTGCTCCATCACATTTACGTCCAGGAGGCAGTAACAATATTAATAATGAAGATTACAGTGGTATTGTTCATGGCAATAATATTAACAGTATGAATATCGAGAATGATATTACCAATAATAATATCAGTCAGAATAAAACATCATTGAATGGAACATGATTGAATCATATGTTATTGGTTTTTGTGAAGAATAATTTTTTTACATTTGTGATATGTTTTATATGAATTTCTAAATTATATACTTTACTCATTTATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTNTTTTAATTTGGGCTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AW017452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTATGAATATCGAGAATGATATTACCAATAATAATATCAGTCAGAATAAAACATCATTGAATGGAACATGATTGAATCATGTGTTATTGGTTTTTGTGAAGAATAATTTTTTTACATTTGTGATATGTTTTATATGAATTTCTAAATTATATACTTTACTCATTTATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTTTTTTAATTTGTGCAACTTTCTATTTACAGTTTATCATATTTAGTTTTATCTTTGTCATGTTTTTTTATTACCGTCCCACGCTATTCAACTATTTTGTTTCCGACATACAAAATATCTTTTGTCCATTTCCATAATGCTGCATACCTTCCATTTTCTAATAAGTCAATTAAATTCTTAATCGATTTGTTTTTTTCAACTTATATCATATAACTTTATTGTTTGTTTTGTTTTCATTTTAATAAGAGAAAGATGAAAGTGCTGATAACTTTGTTAAATTACTTTTGATTCTTTGTGTAAAACTAATGAAGTAAATAAAACTATGA                                   ]
[-] EMBL CD144487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTGTGATATGTTTTATATGAATTTCTAAATTATATACTTTACTCATNTATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTTTTTTAATTTGTGCTACTTTCTATTTACAGTTTATCATATTTAGTTTTATCTTTGTCATGTTTTTTTATTACCGTCCCACGCTATTCAACTATTTTGTTTCCGACATACAGAATATCTTTTGTCCATTTCCATAATGCT                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AW016968             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTTTTTTAATTTGTGCTACTTTCTATTTACAGTTTATCATATTTAGTTTTATCTTTGTCATGTTTTTTTATTACCGTCCCACGCTATTCAACTATTTTGTTTCCGACATACAAAATATCTTTTGTCCATTTCCATAATGCTGCATACCTTCCATTTTCTAATAAGTCAATTAAATTCTTAATCGATTTGTTTTTTTCAACTTATATCATATAACTTTATTGTTTGTTTTGTTTTCATTTTAATAAGAGAAAGATGAAAGTGCTGATAACTTTGTTAAATTACTTTTGATTCTTTGTGTAAAACTAATGAAGTAAATAAAACTATGATTAACTGTTATAAAATTGATTTTATTAAAGATTTG]


>consensus_6937#0 GTCGCGATTGATCGGAAAATGTCCGCTACCTCGTGCTCGTTTGTTAGAAATTAGCTACGT ATTCAAAGCGTTGACAGTTATGTTAACTTCACTTCAATCTGTTCCAATACAACATGACGT GGATGATTCAATTATACTAGACCAGATTGAATCATATCCTCATATTGTTGATTGTATTCT GGTGACCGGTGGAAGTAGTCAAATAGCATTAGCTTTACATCATCTTTTACGACTTTATGG TGAATTCCTTGCTCCATCACATTTACGTCCAGGAGGCAGTAACAATATTAATAATGAAGA TTACAGTGGTATTGTTCATGGCAATAATATTAACAGTATGAATATCGAGAATGATATTAC CAATAATAATATCAGTCAGAATAAAACATCATTGAATGGAACATGATTGAATCATATGTT ATTGGTTTTTGTGAAGAATAATTTTTTTACATTTGTGATATGTTTTATATGAATTTCTAA ATTATATACTTTACTCATTTATTATATGATGGCTGTGGGGAACTTCATGTAATCTCCTTC TCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTTCTCCTTAGTACAATAATTATCTACATTTTTTT AATTTGTGCTACTTTCTATTTACAGTTTATCATATTTAGTTTTATCTTTGTCATGTTTTT TTATTACCGTCCCACGCTATTCAACTATTTTGTTTCCGACATACAAAATATCTTTTGTCC ATTTCCATAATGCTGCATACCTTCCATTTTCTAATAAGTCAATTAAATTCTTAATCGATT TGTTTTTTTCAACTTATATCATATAACTTTATTGTTTGTTTTGTTTTCATTTTAATAAGA GAAAGATGAAAGTGCTGATAACTTTGTTAAATTACTTTTGATTCTTTGTGTAAAACTAAT GAAGTAAATAAAACTATGATTAACTGTTATAAAATTGATTTTATTAAAGATTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)