cluster # 6950

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Schistosoma mansoni
cluster # 6950 cluster # 6950 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6950#0 length = 563 sequences # 4

consensusID : consensus_6950#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 563
fasta sequence

                              [TCCGGTGTAAGTAAGTAAGTAAGTAACACTCTATTCTATTGAAACGTCATTGTTTAATGAATANNGGGTTAAGATCCATATACAGAATTATGTTAAAGTTTGCAAAGATAAGCATATTATACATTGAGATGTGTATACACATCTACCATACATATATACTCTAAATTACAATCGAAAAGTAACATTCTACTCACAAACATAATAATAGTAATATTAACATCTCTTTCATTACGAAAATTGGATAAAAAGAAATTTACCTTCGCTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATCAATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGCTTCAAAATTCAATGATGATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGGTTTTTGCCGTTGTTCATTTCGTAAATTGTTAGTGGATTCATATTGGAAAACAATATGTACAGTTTTTTGTTGTATATGAGGTAAAAGACCAGTATTAGTGTTTATAGTAGAAGTCACAGGAGCTGTAGCAGTAACAGTAGGAGAACCACC]

[+] EMBL CD096465             [TCCGGTGTAAGTAAGTAAGTAAGTAACACTCTATTCTATTGAAACGTCATTGTTTAATGAATANNGGGTTAAGATCCATATACAGAATTATGTTAAAGTTTGCAAAGATAAGCATATTATACATTGAGATGTGTATACACATCTACCATACATATATACTCTAAATTACAATCGAAAAGTAACATTCTACTCACAAACATAATAATAGTAATATTAACATCTCTTTCATTACGAAAATTGGATAAAAAGAAATTTAGCTT ACTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATCAATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGCTTCAAAATTCAATGATGATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGACTTTTGCCGTTGTTCATTTCGTAAATTGCTAGTGGATTCATATTGGAAAACAATATGTACAGTTTTTTGTTGTATATGAGGTAAAAGACCAGTATTAGTGTTTATAGTAGAAGTCACAGGAGCTGTAGCAGTAACAGTAGGAGAACCACC]
[+] EMBL CD087374             [                                                                                                                                                                                                                                                              TACCTTCGCTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATCAATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGCTTCAAAATTCAATGATGATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGGTTTTTGCCGTTGTTCATTTCGTAAATTGTTAGTGGATTCATATTGGAAAACAATATGTACAGTT                                                                                      ]
[+] EMBL CD087373             [                                                                                                                                                                                                                                                              TACCTTCGCTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATCAATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGCTTCAAAATTCAATGATGATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGGTTTTTGCCGTTGTTCATTTCGTAAATTGTTAGTGGATTCATATTGG                                                                                                        ]
[+] EMBL CD087371             [                                                                                                                                                                                                                                                              TACCTTCGCTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATCAATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGGTTCAAAATTCAATGATGATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGGATT                                                                                                                                                   ]




>consensus_6950#0
TCCGGTGTAAGTAAGTAAGTAAGTAACACTCTATTCTATTGAAACGTCATTGTTTAATGA
ATANNGGGTTAAGATCCATATACAGAATTATGTTAAAGTTTGCAAAGATAAGCATATTAT
ACATTGAGATGTGTATACACATCTACCATACATATATACTCTAAATTACAATCGAAAAGT
AACATTCTACTCACAAACATAATAATAGTAATATTAACATCTCTTTCATTACGAAAATTG
GATAAAAAGAAATTTACCTTCGCTGTTGAATGGACAACATTTTTAATTTGTACACTAATC
AATAGATCATTGATATCGGTTATATTTAAACAATTTGCAACAGCTTCAAAATTCAATGAT
GATTTAAGTTCTAGTTCAGAACGATGTCGAACATAACGACAGCCGGTAAATGGTTTTTGC
CGTTGTTCATTTCGTAAATTGTTAGTGGATTCATATTGGAAAACAATATGTACAGTTTTT
TGTTGTATATGAGGTAAAAGACCAGTATTAGTGTTTATAGTAGAAGTCACAGGAGCTGTA
GCAGTAACAGTAGGAGAACCACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case