cluster # 6957

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Schistosoma mansoni
cluster # 6957 cluster # 6957 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6957#0 length = 613 sequences # 4

consensusID : consensus_6957#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 613
fasta sequence

                              [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAACTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC]

[+] EMBL CD152310             [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAACTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCCTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCT                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD152290             [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAGCTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATGGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCA                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD152236             [                                                                                                                                                                                              CATAAATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTAATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC]
[-] EMBL CD152163             [                                                                                                                                                                                                     TTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC]




>consensus_6957#0
TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGT
TTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTG
TGCCTGATCTTTGTATGAAACTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAA
AAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCT
TAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTT
GTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGT
CTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATA
ACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGC
CTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTA
CATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTA
GGATTCATCAACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case