cluster # 6967

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Schistosoma mansoni
cluster # 6967 cluster # 6967 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6967#0 length = 581 sequences # 4

consensusID : consensus_6967#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 581
fasta sequence

                              [GTTCGAGGATTATTGTCTGTTGCGTTATATGATGAAGCTGTTCGTCTTTGTGAATCCTACGATCTTGATCCTGCACTTATCATTAATAGTATAAGTTTACGCTGTAGCGAGCTTGCTCAATGTGCAACTGGTAGTGTCAATTTGGTGAATTTTTCACAGCCTACGGTTAATTATGAACTTCGTCGAAAAGAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTAAATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCTGATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTTTTGATAAAGTTGGAAACGACGGTGATAATATCGGCGCTATTGAAAAATCCAGTAGCCTAAAAATAGTACCATATCATTCTAATTATAATTATTCTAGTCGATGCAGCTTACCAGAATTGTATTGGCGTCTCCTAGAAACAGTTCTCACACGTCTAGATCCTCCAAGTAAAATTAATGAGAAAAAAACAACTTTTCAAACAAAATATCATGGTCTTCTACATTTAATTGCTTGCAAAAA]

[+] EMBL CD147786             [GTTCGAGGATTATTGTCTGTTGCGTTATATGATGAAGCTGTTCGTCTTTGTGAATCCTACGATCTTGATCCTGCACTTATCATTAATAGTATAAGTTTACGCTGTAGCGAGCTTGCTCAATGTGTAACTGGTAGTGTCAATTTGGTGAATTTTTCACAGCCTACGGTTAATTATGAACTTCGTCGAAAAGAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTAAATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCTGATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTTTTGATAAAGTTGGAAACGACGGTGATAATATCGGCGCTATTGAAAAATCCAGTAGCCTAAAAATAGTACCATATCATTCTAATTATAATTATT                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD095115             [                                    GCTGTTCGTCTTTGTGAATCCTACGATCTTGATCCTGCACTTATCATTAATAGTATAAGTTTACGCTGTAGCGAGCTTGCTCAATGTGCAACTGGTAGTGTCAATTTGGTGAATTTTTCACAGCCTACGGTTAATTATGAACTTCGTCGAAAAGAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTAAATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCTGATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTTTTGATAAAGTTGGAAACGACGGTGATAATATCGGCGCTATTGAAAAATCCAGTAGCCTAAAAATAGTACCATATCATTCTAATTATAATTATTCTAGTCGATGCAGCTTACCAGAATTGTATTGGCGTCTCCTAGAAACAGTTCTCACACGTCTAGATCCTCCAAGTAAAATTAATGAGAAAAAAACAACTTTTCAAACAAAATATCATGGTCTTCTACATTTAATTGCTTGCAAAAA]
[-] EMBL CD094885             [                                     CTGTTCGTCTTTGTGAATCCTACGATCTTGATCCTGCGCTTATCATTAATAGTATAAGTTTACGCTGTAGCGAGCTTGCTCAATGTGCAACTGGTAGTGTCAATTTGGTGAATTTTTCACAGCCTACGGTTAATTATGAACTTCGTCGAAAAGAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTAAATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCTGATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTTTTGATAAAGTTGGAAACGACGGTGATAATATCGGCGCTATTGAAAAATCCAGTAGCCTAAAAATAGTACCATATCATTCTAATTATAATTATTCTAGTCGATGCAGCTTACCAGAATTGTATTGGCGTCTCCTAGAAACAGTTCTCACACGTCTAGATCCTCCAAGCAAAATTAATGAGAAAAAAACAACTTTTCAAACAAAATATCATGGTCTTCTACATTTAATTGCTTGCGAAAA]
[-] EMBL CD139710             [                                                                                                                                                                                             GAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTAAATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCTGATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTT                                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_6967#0
GTTCGAGGATTATTGTCTGTTGCGTTATATGATGAAGCTGTTCGTCTTTGTGAATCCTAC
GATCTTGATCCTGCACTTATCATTAATAGTATAAGTTTACGCTGTAGCGAGCTTGCTCAA
TGTGCAACTGGTAGTGTCAATTTGGTGAATTTTTCACAGCCTACGGTTAATTATGAACTT
CGTCGAAAAGAGGTTTACGATATTCATCGTACCACTTCTATCATCACATCAACTGGTTTA
AATCAATTCCCGGTACTACCAGGATTGGCGAATGATTCATCTCCTTTAGAACATGAAGCT
GATCTAGTTCAACAGTCTTTATCTAATTTGGCCACGTTAAGTTTTGATAAAGTTGGAAAC
GACGGTGATAATATCGGCGCTATTGAAAAATCCAGTAGCCTAAAAATAGTACCATATCAT
TCTAATTATAATTATTCTAGTCGATGCAGCTTACCAGAATTGTATTGGCGTCTCCTAGAA
ACAGTTCTCACACGTCTAGATCCTCCAAGTAAAATTAATGAGAAAAAAACAACTTTTCAA
ACAAAATATCATGGTCTTCTACATTTAATTGCTTGCAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case