These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6968#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 754 fasta sequence [AAAGCTGTTCGTTACTTAATCTGCTGTATTCCCGATCTCCTATTTTGACTCTAAAGTAGAGTTGTTCAATAACTTAAGTGCTTTTGAGTCGTCTTTCATTTTTGTCAACATGCCTACGGATACTTATTATAATTTGGAGTCCATACCTGCCACCGTCGATGAAGTTGTTGTTTCTGGATTGGACAGGACACACGATTCAATTGTCAAAAAACAATTTGTGACATTGGTGAAATCTCAGAATTTGCGGGACCTTTTTGAGAATGTGAGGGTTGCCAAAGAAAAGCTCGCAAAACTTGGAGTGTTCAAAACTATTTTCGCTGTTGTGGATGTGTCTGAAGATCATTCAAAGCCGGATGCATATAAAATTACCTTCAAAGTTGAGGAAAAACGCTTCGTTACTGCCCGAATGTCAATGACTTATGGAACTGATGGAATTACAAAAGCATGTGGAAACGTTCGTCTCAATAATTTTGCTCGCCGTGCTGAATGCGCTGATATTGATGTTGAGATCGGTTCANACCAGATGGTTTCCAAGTTTGCAACTATTTCAGAGCCATTGGAGAATAACCCATACGTTCGTGTTAGTATTGGTGGGACAGAAGGGAATTGGGATCACTATTGGGCTAAATTTCTGCGACATGAATGTTCAGTTTTTACAGAAGCTCAAGCAGAATCCTCCGTTGGATTGCACAAATTTCAATGGGATGCAGTGTGGCGAGAAACAGAAGTTAAGGATCCTACTGCACCGTTAGGC] [+] EMBL CD162723 [AAAGCTGTTCGTTACTTAATCTGCTGTATTCCCGATCTCCTATTTTGACTCTAAAGTAGAGTTGTTCAATAACTTAAGTGCTTTTGAGTCGTCTTTCATTTTTGTCAACATGCCTACGGATACTTATTATAATTTGGAGTCCATACCTGCCACCGTCGATGAAGTTGTTGTTTCTGGATTGGACAGGACACACGATTCAATTGTCAAAAAACAATTTGTGACATTGGTGAAATCTCAGAATTTGCGGGACCTTTTTGAGAATGTGAGGGTTGCCAAAGAAAAGCTCGCAAAACTTGGAGTGTTCAAAACTATTTTCGCTGTTGTGGATGTGTCTGAAGATCATTCAAAGCCGGATGCATATAAAATTACCTTCAAAGTTGAGGAAAAACGCTTCGTTACTGCCCGAATGTCAATGACTTATGGAACTGATGGAATTACAAAAGCATGTGGAAACGTTCGTCTCAATAATTTTGCTCGCCGTGCTGAATGCGCTGATATTGATGTTGAGATCGGTTCANACCAGATGGTTTCCAAGTTTGCAACTATTTCAGAGCCATTGGAGAATAACCCATACGTT ] [+] EMBL CD162837 [AAAGCTGTTCGTTACTTAATCTGCTGTATTCCCGATCTCCTATTTTGACTCTAAAGTAGAGTTGTTCAATAACTTAAGTGCTTTTGAGTCGTCTTTCATTTTTGTCAACATGCCTACGGATACTTATTATAATTTGGAGTCCATACCTGCCACCGTCGATGAAGTTGTTGTTTCTGGATTGGACAGGACACACGATTCAATTGTCAAAAAACAATTTGTGACATTGGTGAAATCTCAGAATTTGCGGGACCTTTTTGAGAATGTGAGGGTTGCCAAAGAAAAGCTCGCAAAACTTGGAGTGTTCAAAACTATTTTCGCTGTTGTGGATGTGTCTGAAGATCATTCAAAGCCGGATGCATATAAAATTACCTTCAAAGTTGAGGAAAAACGCTTTGTTACTGCCCGAATGTCAATGACTTATGGAACTGATGGAATTACAAAAGCATGTGGAAACGTTCGTCTCAATAATTTTGCTCGCCGTGCTGAATGCGCTGATATTGATGTTGAGATCGGTTCANACCAGATGG ] [+] EMBL CD195783 [ GGAACTGATGGAATTACAAAAGCATGTGGAAACGTTCGTCTCAATAATTTTGCTCGCCGTGCTGAATGCGCTGATATTGATGTTGAGATCGGTTCAATCCAGATGGTTTCCAAGTTTGCAACTATTTCAAAGCCATTGGAGAATAACCCATACGTTCGTGTTAGTATTGGTG ] [-] EMBL CD118410 [ GCCGTGCTGAATGCGCTGATATTGATGTTGAGATCGGTTCAAACCAGATGGTTTCCAAGTTTGCAACTATTTCANAGCCATTGGAGAATAACCCATACGTTCGTGTTAGTATTGGTGGGACAGAAGGGAATTGGGATCACTATTGGGCTAAATTTCTGCGACATGAATGTTCAGTTTTTACAGAAGCTCAAGCAGAATCCTCCGTTGGATTGCACAAATTTCAATGGGATGCAGTGTGGCGAGAAACAGAAGTTAAGGATCCTACTGCACCGTTAGGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||