cluster # 6984

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6984 cluster # 6984 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6984#0 length = 528 sequences # 4

consensusID : consensus_6984#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 528
fasta sequence

                              [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]

[+] EMBL AI977207             [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGCTCACACTTATTGAATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]
[+] EMBL AI976854             [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTTTTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]
[+] EMBL AI977201             [                                               acGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGACGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTTAAATTTCCGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AA629493             [                                                                                                             TTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATNNTCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACNGCTAATGTTTTACATGNNTGTACAACTNAACGAATGATGAT                                           ]




>consensus_6984#0
TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAA
TTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATG
AACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAG
GGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCG
TGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTAT
GGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTC
ATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTT
ATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATG
ATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case