cluster # 7036

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Schistosoma mansoni
cluster # 7036 cluster # 7036 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7036#0 length = 383 sequences # 4

consensusID : consensus_7036#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 383
fasta sequence

                              [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA-TTTG-TTGATAA-TTTAGTGTACAAATC-AATCAAAATAAACCTAA-TAGTGTAA-TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA-TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG-TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG-ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC]

[+] EMBL CD120184             [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTTATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATCAAATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGATTTTAG TCCNTACTGCTACAGNTCCATTCACCAATTA TTTAGNNTA CATGTAANNTATACNATTTACAGTTNATGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTA ]
[+] EMBL CD120260             [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTGNACAT AACTGTGTTTACTCAAAGCTA ]
[-] EMBL CD120386             [ AATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC]
[-] EMBL CD120027             [                                                                                                                                   AAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCATTTTGTTTGATAATTTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAATTAGTGTAATTTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC]




>consensus_7036#0
AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTG
TGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTC
TTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTG
GATCATTTGTTGATAATTTAGTGTACAAATCAATCAAAATAAACCTAATAGTGTAATTAA
TAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGATTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTC
ACCAATTATTTTAGTTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTGACAT
AAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case