cluster # 7055

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Schistosoma mansoni
cluster # 7055 cluster # 7055 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7055#0 length = 572 sequences # 4

consensusID : consensus_7055#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 572
fasta sequence

                              [CACAATGGTCTTATACAAACTATACCGCATAATGAACATAACAATACTGTATCACATCAACTATCTCATACACTCAAAGAAGATACTGTTTATAATTTTAATTCAATTTGTCAGAAACAATCTAACAATTCGGATAATAGTAATCATATCACATCAGGTCAAGACAGGAATAATCTTGTTAATAATTAGCAACAACTATCATCTATTATTAGTCAGTCAACAATGCTTCCTAACCATGCTGTTACTACTACCTCCACTCCAACAACAGTTACTAATGTTATTAGTCATAATCTAAATACTTATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTAAAATCAGTTATGCCAGAATCTACAACCAATAAACCACCAGCGGAACAGTCCAAATATTCACATGAAAATTTACCTGATGGTGCAACCACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCGTCTATGTTAACAAATCAAATGAATGTTAACGGTGCACATGTTATTATGATGCTTTCCCCGTCTATCACAATCCCGACATCTCTTCATTCATC]

[+] EMBL CD150249             [CACAATGGTCTTATACAAACTATACCGCATAATGAACATAACAATACTGTATCACATCAACTATCTCATACACTCAAAGAAGATACTGTTTATAATTTTAATTCAATTTGTCAGAAACAATCTAACAATTCGGATAATAGTAATCATATCACATCAGGTCAAGACAGGAATAATCTTGTTAATAATTAGCAACAACTATCATCTATTATTAGTCAGTCAACAATGCTTCCTAACCATGCTGTTACTACTACCTCCACTCCAACAACAGTTACTAATGTTATTAGTCATAATCTAAATACTTATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTAAAATCAGTTATGCCAGAATCTACAACCAATAAACCACCAGCGGAACAGTCCAAATATTCACATGAAAATTTACCTGATGGTGCAACCACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCGTCTATGTTAACANATCANATGAATGTTAACGGTGCACATGTTATTATGATGCTTT                                     ]
[-] EMBL CD088206             [                                                                                                                                                                                                                                  TTCCTAACCATGCTGTTACTACTACCTCCACTCCAACAACAGTTACTAATGTTATTAGTCATAATCTAAATACTTATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTAAAATCAGTTATGCCAGAATCTACAACCAATAAACCACCAGCGGAACAGTCCAAATATTCACATGAAAATTTACCTGATGGTGCAACCACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCGTCTATGTTAACAAATCAAATGAATGTTAACGGTGCACATGTTATTATGATGCT                                       ]
[-] EMBL CD088283             [                                                                                                                                                                                                                                  TTCCTAACCATGCTGTTACTACTACCTCCACTCCAACAACAGTTACTAATGTTATTAGTCATAATCTAAATACTTATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTAAAATCAGTTATGCCAGAATCTACAACCAATAAACCACCACCGGAACAGTCCAAATATTCACATGAAAATTTACCTGATGGTGCAA CACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCGTCTATGTTAACAAATCAAATGAATGTTACCGGTGCACATGTTATTATGATGCT                                       ]
[-] EMBL CD152524             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTAAAATCAGTTATGCCAGAATCTACAATCAATAAACCA CAGCGGAACAGTTCAAATATTCACATGAAAATTTACCTGATGGTGCAACCACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCGTCTATGTTAACAAATCAAATGAATGTTAACGGTGCACATGTTATTATGATGCTTTCCCCGTCTATCACAATCCCGACATCTCTTCATTCATC]




>consensus_7055#0
CACAATGGTCTTATACAAACTATACCGCATAATGAACATAACAATACTGTATCACATCAA
CTATCTCATACACTCAAAGAAGATACTGTTTATAATTTTAATTCAATTTGTCAGAAACAA
TCTAACAATTCGGATAATAGTAATCATATCACATCAGGTCAAGACAGGAATAATCTTGTT
AATAATTAGCAACAACTATCATCTATTATTAGTCAGTCAACAATGCTTCCTAACCATGCT
GTTACTACTACCTCCACTCCAACAACAGTTACTAATGTTATTAGTCATAATCTAAATACT
TATGTTGATTCAAGCATCAAAAGTGATTGTAAGCATGTTTCTGTGAATTCCAGTCCTCTA
AAATCAGTTATGCCAGAATCTACAACCAATAAACCACCAGCGGAACAGTCCAAATATTCA
CATGAAAATTTACCTGATGGTGCAACCACATTATCACCATCATCATCAGTATCATCATCG
TCTATGTTAACAAATCAAATGAATGTTAACGGTGCACATGTTATTATGATGCTTTCCCCG
TCTATCACAATCCCGACATCTCTTCATTCATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case