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Schistosoma mansoni
cluster # 7057 cluster # 7057       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7057#0 length = 773 sequences # 4  

consensusID : consensus_7057#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 773
fasta sequence
                              [GGATCCTTACTTTAATTATCGCACTACACGTTTTATGACTGACAATGGATTTTACCAATTTCATGATTGGTTCGATGATATGGCATGGTATCCACTCGGAAGGATCATNGGAGGTACAATATATCCTGGACTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTT-GTTTCCAAGTTTAACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTTTAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGGTACCATACTGTCAATGCAGATTAGTTTTGTTGGCTTCTCCCCTGTAATATCCAGTGAACATATAGGAGCTTTCGGGGTGTTTGGATTATGTCAACTTTTCTCCTTTTATACGTACCTTCGTGGGACTGTATCTTCTGAACAACTGTCAACAGTTTTGCGTGTTTTTGAGTTATCAT]

[-] EMBL CD147541             [GGATCCTTACTTTAATTATCGCACTACACGTTTTATGACTGACAATGGATTTTACCAATTTCATGATTGGTTCGATGATATGGCATGGTATCCACTCGGAAGGATCATNGGAGGTACAATATATCCTGGACTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTTGGTTTCCAAGTTTAACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD166316             [                                                                                                                                GATTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTT GTTTTCAAGTTTTACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD097161             [                                                                                                                                                                                                                                                                                CAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTGACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTTTAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGG                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD159332             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTATAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGGTACCATACTGTCAATGCAGATTAGTTTTGTTGGCTTCTCCCCTGTAATATCCAGTGAACATATAGGAGCTTTCGGGGTGTTTGGATTATGTCAACTTTTCTCCTTTTATACGTACCTTCGTGGGACTGTATCTTCTGAACAACTGTCAACAGTTTTGCGTGTTTTTGAGTTATCAT]


>consensus_7057#0 GGATCCTTACTTTAATTATCGCACTACACGTTTTATGACTGACAATGGATTTTACCAATT TCATGATTGGTTCGATGATATGGCATGGTATCCACTCGGAAGGATCATNGGAGGTACAAT ATATCCTGGACTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGT TACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTTGTTTCCAAGTTTAACAAC TTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGC TGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAA CGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAA AACCGGTTACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTC TTGGGGTGGATACGTATTTTTAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCT TACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGGTAC CATACTGTCAATGCAGATTAGTTTTGTTGGCTTCTCCCCTGTAATATCCAGTGAACATAT AGGAGCTTTCGGGGTGTTTGGATTATGTCAACTTTTCTCCTTTTATACGTACCTTCGTGG GACTGTATCTTCTGAACAACTGTCAACAGTTTTGCGTGTTTTTGAGTTATCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)