These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7057#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 773 fasta sequence [GGATCCTTACTTTAATTATCGCACTACACGTTTTATGACTGACAATGGATTTTACCAATTTCATGATTGGTTCGATGATATGGCATGGTATCCACTCGGAAGGATCATNGGAGGTACAATATATCCTGGACTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTT-GTTTCCAAGTTTAACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTTTAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGGTACCATACTGTCAATGCAGATTAGTTTTGTTGGCTTCTCCCCTGTAATATCCAGTGAACATATAGGAGCTTTCGGGGTGTTTGGATTATGTCAACTTTTCTCCTTTTATACGTACCTTCGTGGGACTGTATCTTCTGAACAACTGTCAACAGTTTTGCGTGTTTTTGAGTTATCAT] [-] EMBL CD147541 [GGATCCTTACTTTAATTATCGCACTACACGTTTTATGACTGACAATGGATTTTACCAATTTCATGATTGGTTCGATGATATGGCATGGTATCCACTCGGAAGGATCATNGGAGGTACAATATATCCTGGACTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTTGGTTTCCAAGTTTAACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGA ] [+] EMBL CD166316 [ GATTTATGATGACATCGTCTTTTATATACTCACTACTTCATGCTATAAATGTTACCATGGATATACGAAACGTATGTGTATTTTTGGCACCTTT GTTTTCAAGTTTTACAACTTTAGCAACCTTTTTACTGACAAGTGAGATTCAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCT ] [-] EMBL CD097161 [ CAGGACACTAGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTGACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTTTAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGG ] [+] EMBL CD159332 [ AGTTCTGGCCTAATAGCTGCTGCTTTGGTTGCAATTGTACCTGGTTACATTAGCCGATCAGTTGCAGGTTCTTATGATAACGAAGGAATCGCCATATTCTGCATGATATTTACGTTTTATCTGTGGATTAAAGCCGTTAAAACCGGTTACTTGTTCTGGGCTTGCGCTTGCAGCTTAGCGTACTTTTACATGGTTTCTTCTTGGGGTGGATACGTATTTATAATAAACATCATACCTATTCATGTATTAATACTCATGCTTACTGGAAGATTTTCAAGTCGTGTTTATTCTGCCTACTCTACTGTTTACGTTCTGGGTACCATACTGTCAATGCAGATTAGTTTTGTTGGCTTCTCCCCTGTAATATCCAGTGAACATATAGGAGCTTTCGGGGTGTTTGGATTATGTCAACTTTTCTCCTTTTATACGTACCTTCGTGGGACTGTATCTTCTGAACAACTGTCAACAGTTTTGCGTGTTTTTGAGTTATCAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||