These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7064#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 671 fasta sequence [TGGGATGAATGTTCTGAAGACCCT-AATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGTAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAAGTGCAAGGTCAGTGAAAAAGGTGCAGGTGATGCAGTAGTGGGTGCCGTAACAGACACTTNTACATCAAGGCTAGTAGATCCTTCTCCGATTCATTTTACATTGAAGAAACT] [+] EMBL CD186827 [TGGGATGAATGTTCTGAAGACCCTAAATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGGGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATG ] [-] EMBL CD186961 [ GGGATGAATGTTCTGAAGACCCT AATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTG ] [-] EMBL CD186746 [ GACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGTAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAA ] [+] EMBL CD154242 [ TATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGGAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAAGTGCAAGGTCAGTGAAAAAGGTGCAGGTGATGCAGTAGTGGGTGCCGTAACAGACACTTNTACATCAAGGCTAGTAGATCCTTCTCCGATTCATTTTACATTGAAGAAACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||