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Schistosoma mansoni
cluster # 7064 cluster # 7064       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7064#0 length = 671 sequences # 4  

consensusID : consensus_7064#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 671
fasta sequence
                              [TGGGATGAATGTTCTGAAGACCCT-AATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGTAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAAGTGCAAGGTCAGTGAAAAAGGTGCAGGTGATGCAGTAGTGGGTGCCGTAACAGACACTTNTACATCAAGGCTAGTAGATCCTTCTCCGATTCATTTTACATTGAAGAAACT]

[+] EMBL CD186827             [TGGGATGAATGTTCTGAAGACCCTAAATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGGGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATG                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD186961             [ GGGATGAATGTTCTGAAGACCCT AATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTATGACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD186746             [                                                                                                                  GACGATTGAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGTAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAA                                                                                                               ]
[+] EMBL CD154242             [                                                                                                                                  TATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATTAATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAGAAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGAAGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATAAAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGTTATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGGAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGTATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTGAATGGTGTCTGCTCTAATAAGTGCAAGGTCAGTGAAAAAGGTGCAGGTGATGCAGTAGTGGGTGCCGTAACAGACACTTNTACATCAAGGCTAGTAGATCCTTCTCCGATTCATTTTACATTGAAGAAACT]


>consensus_7064#0 TGGGATGAATGTTCTGAAGACCCTAATTGGTGTGCTGGTAAAGGTGGGAGTAAACTTTAT GACTCGCCTGCTGAACTTCAGCACGGTAGTAATGTTTCGGATCTGTCTATCGTGACGATT GAGGGAGATTATTTTGCTCTTAAGCGTGACTTGGTTGATTTGTTGTCGACATTGCTTATT AATGAGTTTGATCCTGCAAACAGAAAGCTATTGGGAGTACTGATTGACAAATGCGTTGAG AAGGATCCCGAATTCATTCTCAAAATCTCCCTTTATTTCCATAAACTGTTAAATATTCGA AGGACAGCCAATCTGTTAGTTTCGATAGCTTGTTTTTATGTGCAGTGCCGCGTTTTCATA AAGAAGTATTTTAATGCATGCATTTGTACACCCTTCGATTGGATAGAAGTTGCCGAGTGT TATGCCTCGTTGAGCGGTGATCCTAAACTTAGAGTAATGCCAAAAGCATTGAGAAAGTGT ATGGTCTCCAAGTTTTGTGAATTTGATCAGAATCAGCTAGCTCAATGCAAGCGAAGGTTG AATGGTGTCTGCTCTAATAAGTGCAAGGTCAGTGAAAAAGGTGCAGGTGATGCAGTAGTG GGTGCCGTAACAGACACTTNTACATCAAGGCTAGTAGATCCTTCTCCGATTCATTTTACA TTGAAGAAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)