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Schistosoma mansoni
cluster # 7097 cluster # 7097       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7097#0 length = 1117 sequences # 4  

consensusID : consensus_7097#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1117
fasta sequence
                              [CTAGTGCAGTAAAGCACCAACCAGAACTTAAAGAAGCGTTGGCAGCACGGAGTGAGATTATGATTCACGGGCTACAACATCGTAATCGTGCTGTTGATGGAGATGTAGTCGTAGTACGTCTTTTACCCCGCGTTCATTGGAAAACTGTTTCATCCGATATTAGTGCTCAAGAAAACTGTGCAGCTGAATTTGTAAATGATTTATCAAATATGTCCGGAAGTAAACCTAATGAGGATTGTTTTAAGTCAGAAACAATATCACGAAGTCTACCTTGTGGCTTTGTTGTTGGTGTTATCAGTCATAATTGGCGTGATTATGTCTGTACATATGTTCCTAAATCTACTGAAAATTCATTAGATTCAAAAAGTGAAAGTGGATGGATAATAGTTACTCCATGGGATCGTCGTATTCCTCTCATTCGACTGCATACTACACAAATTTCCAAGTTAACCCGTGAACGTTTTATAGTACGAATCGATACATGGGACTCGTATTCAGCTTATCCAAGTGGTCATTTTGTCCAAACTCTAGGATGTATTGGCGATTTGGAAACAGAAACACAAACCATACTAATTGAACATAATTTAGTTATTCGAAATTTTACTGATGCACAGTTGAGTGAATTAGCACCACTAAGTGTCCAACGCCCTTGGAAAGTTGATCTGGAAGAAGTAAAGAAACGTCGAGATCTTCGGTCGCCCACTATTTCAGGAAATCCAGACTCCGAAGATATACTTATCTTCAGTATTGATCCTCCAGGATGTCAAGATGTAGATGATGCTCTGTCCGTTCAATGGTTACCACCTATCGTCGATGAATATGGGAAAGAACATAAACGTTTGCAGCTGGGAGTACACATAGCTGATGTTAGTTATTTCGTTCCGTCTGGTAGTTATATTGATAGTGAAGCTCGAAGACGTTCAACCAGCATTTATTTAGCTGATCGTCGGTATGACATGTTACCGGCTTTGTTAACGCGGAGACTTATGCTCTCTATGGAGCGGGCGTGATCGCTATGCTGCTAGCGTATTATGGGAAATAGATATGGATTCATTCGATATCTCAAATATATGGTATGGTCGCACGGTAATCCATTCAAGCTATAAGTTAACCTATG]

[+] EMBL CD156748             [CTAGTGCAGTAAAGCACCAACCAGAACTTAAAGAAGCGTTGGCAGCACGGAGTGAGATTATGATTCACGGGCTACAACATCGTAATCGTGCTGTTGATGGAGATGTAGTCGTAGTACGTCTTTTACCCCGCGTTCATTGGAAAACTGTTTCATCCGATATTAGTGCTCAAGAAAACTGTGCAGCTGAATTTGTAAATGATTTATCAAATATGTCCGGAAGTAAACCTAATGAGGATTGTTTTAAGTCAGAAACAATATCACGAAGTCTACCTTGTGGCTTTGTTGTTGGTGTTATCAGTCATAATTGGCGTGATTATGTCTGTACATATGTTCCTAAATCTACTGAAAATTCATTAGATTCAAAAAGTGAAAGTGGATGGATAATAGTTACTCCATGGGATCGTCGTATTCCTCTCATTCGACTGCATACTACACAAATTTCCAAGTTAACCCGTGAACGTTTTATAGTACGAATCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD113657             [                                                                                                                                           GAAAACTGTTTCATCCGATATTAGTGCTCAAGAAAACTGTGCAGCTGAATTTGTAAATGATTTATCAAATATGTTCGGAAGTAAACCTAATGAGGATTGTTTTAAGTCAGAAACAATATCACGAAGTCTACCTTGTGGCTTTGTTGTTGGTGTTATCAGTCATAATTGGCGTGATTATGTCTGTACATATGTTCCTAAATCTACTGAAAATTCATTAGATTCAAAAAGTGAAAGTGGATGGATAATAGTTACTCCATGGGATCGTCGTATTCCTCTCATTCGACTGCATACTACACAAATTTCCAAGTTAACCCGTGAACGTTTTATAGTACGAATCGATACATGGGACTCGTATTCAGCTTATCCAAGTGGTCATTTTGTCCAAACTCTAGGATGTATTGGCGATTTGGAAACAGAAACACAAACCATACTAATTGAACATAATTTAGTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD098172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTGCATACTACACAAATTTCCAAGTTAACCCGTGAACGTTTTATAGTACGAATCGATACATGGGGCTCGTATTCAGCTTATCCAAGTGGTCATTTTGTTCAAACTCTAGGATGTATTGGCGATTTGGAAACAGAAACACAAACCATACTAATTGAACATAATTTAGTTATTCGAAATTTTACTGATGCACAGTTGAGTGAATTAGCACCACTAAGTGTCCAACGCCCTTGGAAAGTTGATCTGGAAGAAGTAAAGAAACGTCGAGATCTTCGGTCGCCCACTATTTCAGGAAATCCAGACTCCGAAGATATACTTATCTTCAGTATTGATCCTCCAGGATGTCAAGATGTAGATGATGCTCTGTCCGTTCAATGGTTACCACCTATCGTCGATGAATATGGGAAAGAACATAAACGTTTGCAGCTGGGAGTACACATAGCTGATGTTAGTTATTTCGTTCCGTCTGGTA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD153822             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATAAACGTTTGCAGCTGGGAGTACACATAGCTGATGTTAGTTATTTCGTTCCGTCTGGTAGTTATATTGATAGTGAAGCTCGAAGACGTTCAACCAGCATTTATTTAGCTGATCGTCGGTATGACATGTTACCGGCTTTGTTAACGCGGAGACTTATGCTCTCTATGGAGCGGGCGTGATCGCTATGCTGCTAGCGTATTATGGGAAATAGATATGGATTCATTCGATATCTCAAATATATGGTATGGTCGCACGGTAATCCATTCAAGCTATAAGTTAACCTATG]


>consensus_7097#0 CTAGTGCAGTAAAGCACCAACCAGAACTTAAAGAAGCGTTGGCAGCACGGAGTGAGATTA TGATTCACGGGCTACAACATCGTAATCGTGCTGTTGATGGAGATGTAGTCGTAGTACGTC TTTTACCCCGCGTTCATTGGAAAACTGTTTCATCCGATATTAGTGCTCAAGAAAACTGTG CAGCTGAATTTGTAAATGATTTATCAAATATGTCCGGAAGTAAACCTAATGAGGATTGTT TTAAGTCAGAAACAATATCACGAAGTCTACCTTGTGGCTTTGTTGTTGGTGTTATCAGTC ATAATTGGCGTGATTATGTCTGTACATATGTTCCTAAATCTACTGAAAATTCATTAGATT CAAAAAGTGAAAGTGGATGGATAATAGTTACTCCATGGGATCGTCGTATTCCTCTCATTC GACTGCATACTACACAAATTTCCAAGTTAACCCGTGAACGTTTTATAGTACGAATCGATA CATGGGACTCGTATTCAGCTTATCCAAGTGGTCATTTTGTCCAAACTCTAGGATGTATTG GCGATTTGGAAACAGAAACACAAACCATACTAATTGAACATAATTTAGTTATTCGAAATT TTACTGATGCACAGTTGAGTGAATTAGCACCACTAAGTGTCCAACGCCCTTGGAAAGTTG ATCTGGAAGAAGTAAAGAAACGTCGAGATCTTCGGTCGCCCACTATTTCAGGAAATCCAG ACTCCGAAGATATACTTATCTTCAGTATTGATCCTCCAGGATGTCAAGATGTAGATGATG CTCTGTCCGTTCAATGGTTACCACCTATCGTCGATGAATATGGGAAAGAACATAAACGTT TGCAGCTGGGAGTACACATAGCTGATGTTAGTTATTTCGTTCCGTCTGGTAGTTATATTG ATAGTGAAGCTCGAAGACGTTCAACCAGCATTTATTTAGCTGATCGTCGGTATGACATGT TACCGGCTTTGTTAACGCGGAGACTTATGCTCTCTATGGAGCGGGCGTGATCGCTATGCT GCTAGCGTATTATGGGAAATAGATATGGATTCATTCGATATCTCAAATATATGGTATGGT CGCACGGTAATCCATTCAAGCTATAAGTTAACCTATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)