These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_71#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 816 fasta sequence [GTATTATGTCTGGCATTTCACGAGTCGGCAAACTATTACTACCACGTACTGCTTTATTGTTATGCGATATCCAAGAAAAATTTCGTCCAACTATTAGTCATTTTGATGCAATTGTCGAAACGTCTAGTCGGATGTTAACAGCTGCTCGTATGCTAGGAATGCGCATTTTAGTCACTGAAATGTACCCTAAAGGCCTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTNTATCTGTTTTTCATACAACTNTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGNTATAAGAGTATGCTATNTTATTCTATATTTCTTTTCTATGGTCAAGTATGAATTTT-ATGATCTTTGTAANNACTC-GATAC-TACTTC-GCTACTG-ATAAAA-TTTAA-TTTACTAGCTGGT-ATA-TTTTA-CT-AAATAA] [+] EMBL CD079966 [GTATTATGTCTGGCATTTCACGAGTCGGCAAACTATTACTACCACGTACTGCTTTATTGTTATGCGATATCCAAGAAAAATTTCGTCCAACTATTAGTCATTTTGATGCAATTGTCGAAACGTCTAGTCGGATGTTAACAGCTGCTCGTATGCTAGGAATGCGCATTTTAGTCACTGAAATGTACCCTAAAGGCCTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTNTATCTGTTTTTCATACAACTNTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGNTATAAGAGTATGCTATNTTATTCTATATTTCTTTTCTATGGTCAAGTATGAATTTT ATGATCTTTGTAANNACTC GATAC TACTTC GCTACTG ATAAAA TTTAA TTTACTAGCTGGT ATA TTTTA CT AAATA ] [-] EMBL CD074161 [ TGTACCNTAAAGGCNTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTTTATCTGTTTTTCATACAACTTTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGTAATAAGAGTATGCTATTTTATTCTATATTTCTTTTCTATGTTCAAGTATGAATTTTAATGATCTTTGTTAAAACTCGGATACATACTTCAGCTACTGAATAAAATTTTAATTTTACTAGCTGGTAATATTTTTACCTAAAATAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||