Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 710 cluster # 710       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_710#0 length = 607 sequences # 2  

consensusID : consensus_710#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 607
fasta sequence
                              [ACAGGATGCGCCAACTTATTGAAAGTTTGAGTTACTGGACAATACGCATGATCCAAAGTTTTCTGGGAAGTGTTCACACGTTGTCAGAGAAAACCAAAATATCCATCTCAAGTTTATGGATCTTGCCTTTTGATGAAGTTAAACAGGCTATTCAATTAAGCATTGAAGCATGTGAACGATGGATAAAATCTACTGATTTGTTAACTCAACAATTATGGCCACGTTATACACCACATCCATGGAATGGTCCATTACCGAATTTGGCATATCTAATCCAGTTTAAAAATCGATTGAATGAAATTCTTAACTTACGTGGTTTATACGAACAATTATATTATTTTACAACACCTATTGAACATAATCAATTCAAAATGGATTCTGGATTACATAATATCATATTTAATACATTAGAATTTGACAATATAAAAGACGATATAATGTCACCTATATTAAAACAATTTATTAATCCATTAGCTTATAATCCTTATACAATTGAACAATGGCAATCTGTTATACAATTAATTGATACACGTCTTCAACCAATTGAAGAATGTGCAACTAATAGATGTCGAACAAAAATATTAAGCTTATCAAATAGAGTTGATTC]

[+] EMBL AI975582             [ACAGGATGCGCCAACTTATTGAAAGTTTGAGTTACTGGACAATACGCATGATCCAAAGTTTTCTGGGAAGTGTTCACACGTTGTCAGAGAAAACCAAAATATCCATCTCAAGTTTATGGATCTTGCCTTTTGATGAAGTTAAACAGGCTATTCAATTAAGCATTGAAGCATGTGAACGATGGATAAAATCTACTGATTTGTTAACTCAACAATTATGGCCACGTTATACACCACATCCATGGAATGGTCCATTACCGAATTTGGCATATCTAATCCAGTTTAAAAATCGATTGAATGAAATTCTTAACTTACGTGGTTTATACGAACAATTATATTATTTTACAACACCTATTGAACATAATCAATTCAAAATGGATTCTGGATTACATAATATCATATTTAATACATTAGAATTTGACAATATAAAAGACGATATAATGTCACCTATATTAAAACAATTTATTAATCCATTAGCTTATAATCCTTATACAATTGAACAATGGCAATCTGTTATACAATTAATTGATACACGTCTTCAACCAATTGAAGAATGTGCAACTAATAGATGTCGAACAAAAATATTAAGCTTATCAAATAGAGTTGATTC]
[+] EMBL AI975180             [ACAGGATGCGCCAACTTATTGAAAGTTTGAGTTACTGGACAATACGCATGATCCAAAGTTTTCTGGGAAGTGTTCACACGTTGTCAGAGAAAACCAAAATATCCATCTCAAGTTTATGGATCTTGCCTTTTGATGAAGTTAAACAGGCTATTCAATTAAGCATTGAAGCATGTGAACGATGGATAAAATCTACTGATTTGTTAACTCAACAATTATGGCCACGTTATACACCACATCCATGGAATGGTCCATTACCGAATTTGGCATATCTAATCCAGTTTAAAAATCGATTGAATGAAATTCTTAACTTACGTGGTTTATACGAACAATTATATTATTTTACAACACCTATTGAACATAATCAATTCAAAATGGATTCTGGATTACATAATATCATATTTAATACATTAGAATTTGACAATATAAAAGAAGATATAATATCACCTATATTAAAACAATTTATTAATCCATTAGCTTATAATCCTTATACAATTGAACAATGGCAATCTGTTATACAATTAATTGATACACGTCTTCAACCAATTGAA                                                           ]


>consensus_710#0 ACAGGATGCGCCAACTTATTGAAAGTTTGAGTTACTGGACAATACGCATGATCCAAAGTT TTCTGGGAAGTGTTCACACGTTGTCAGAGAAAACCAAAATATCCATCTCAAGTTTATGGA TCTTGCCTTTTGATGAAGTTAAACAGGCTATTCAATTAAGCATTGAAGCATGTGAACGAT GGATAAAATCTACTGATTTGTTAACTCAACAATTATGGCCACGTTATACACCACATCCAT GGAATGGTCCATTACCGAATTTGGCATATCTAATCCAGTTTAAAAATCGATTGAATGAAA TTCTTAACTTACGTGGTTTATACGAACAATTATATTATTTTACAACACCTATTGAACATA ATCAATTCAAAATGGATTCTGGATTACATAATATCATATTTAATACATTAGAATTTGACA ATATAAAAGACGATATAATGTCACCTATATTAAAACAATTTATTAATCCATTAGCTTATA ATCCTTATACAATTGAACAATGGCAATCTGTTATACAATTAATTGATACACGTCTTCAAC CAATTGAAGAATGTGCAACTAATAGATGTCGAACAAAAATATTAAGCTTATCAAATAGAG TTGATTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)