cluster # 7127

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Schistosoma mansoni
cluster # 7127 cluster # 7127 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7127#0 length = 567 sequences # 4

consensusID : consensus_7127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 567
fasta sequence

                              [CGACAGATGTGACCGAGGTACTGAAGGTATTCTACCTGATTGTGTACCATGTGGTGAATGTTGGAATAACTGGGATAAAGCAATCGATAAAGTTATTAGTGAATTAGAT-CG-TTACAGAATCAAACGAGTCAACAATTACCTAAAGAATTAAAAATTATGTTTGATAGTTTAGTCAGTTTATTAGATCAAATTGAACATGTACCATGGATGACAACAGATGATACAAGATTGAATGAATTACGTGATGTATTAAAACGAAGCGAAGAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTCGCTGACAGTTTAGTAAAATGGGATGATTTAATAACAGAGAGATTAGCTCAACAGTTAGAGCGTAAAGGAGTAGTGAATGAAGCAAAAGCACGTCTTGAAACACTAAAAACACAAATGCAAAGTATAATGGATGAATCAATGAAATTGGAACATCTTGATAAAAGAGGAGCATATTTATCAATTCTACGTTCAAAAGATATCGGTGATCGAGTTATAAACACACAAACTAGTATAGAATATCAACGTGGTGGATTAGAAGCTGAATTA]

[-] EMBL CD187153             [CGACAGATGTGACCGAGGTACTGAAGGTATTCTACCTGATTGTGTACCATGTGGTGAATGTTGGAATAACTGGGATAAAGCAATCGATAAAGTTATTAGTGAATTAGAT CGTTTACAGAATCAAACGAGTCAACAATTACCTAAAGAATTAAAAATTATGTTTGATAGTTTAGTCAGTTTATTAGATCAAATTGAACATGTACCATGGATGACAACAGATGATACAAGATTGAATGAATTACGTGATGTATTAAAACGAAGCGAAGAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTCGCTGACAGTTTAGTAAAATGGGATG                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD191927             [                                  CCTGATTGTGTACCATGTGGTGAATGTTAGAATAACTGGGATAAAGCAATCGATAAAGTTATTATTGAATTATATGCG GAACAGAATCAAACGAGTCAACAATTACCTAAAGAATTAAAAATTATGTTTGATAGTTTACTCAGTTTATTAGATCAAATTGAACATGTACCATGGATGACAACAGATGATACAAGATTGAATGAATTACGTGATGTATTAAAACGAATCGAAAAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTCACTGACAGTTTAATAAAATGGGATGATTTAATAACAGAGAGATTAGCTCAACATTTAGAGCGTAAAGGAGTAGTGAATGAAGCAAAAGCACGTCTTGAAACACTAAAAACACAAATGCAAAGTATAATGGATGAATCAATGAAATTGGAACATCTTGATAAAAGAGGAGCATATTTATCAATTCTACGTTCAAAAGATATCGGTGATCGAGTTATAAACACACAAACTAGTATAGAATATCAACGTGGTGGATTAGAAGCTGAATTA]
[-] EMBL CD187521             [                                                                                                                    CAGAATCANACGGGTCAACAATTACCTAAAGAATTAAAAATTATGTTTGATAGTTTAGTCAGTTTATTAGATCAAATTGAACATGTACCATGGATGACAACAGATGATACAAGATTGAATGAATTACGTGATGTATTAAAACGAAGCGAAGAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTCGCTGACAGTTTAGTAAAATGGGATGATTTAATAACAGAGAGATTAGCTCAACAGTTAGAGCGTAAAGGAGTAGTGAATGAAGCAAAAGCACGTCTTGAAACACTAAAAACACAAATGCAAAGTATAATGGATGAATCAATGAAATTGGAACATCTTGATAAAAGAGGAGCATATTTATCAATTCTACGTTCAAAAGATATCGGTGATCGAGTTATAAACACACAAACTAGTATAGAATA                            ]
[+] EMBL CD181033             [                                                                                                                                                                                                                                          ATGAATTACGTGATGTATTAAAACGAAGCGAAGAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTCGCTGACAGTTTAGTAAAATGGGATGATTTAATAACAGAGAGATTAGCTCAACAGTTAGAGCGTAAAGGAGTAGTGAATGAAGCAAAAGCACGTCTTGAAACACTAAAAACACAAATGCAAAGTATAATGGATGAATCAATGAAATTGGAACATCTTGATAAAAGAGGAGCATATTTATCAATTCTACGTTCAAAAGATATCGGTGATCGAGTTATAAACACACAAACTAGTATA                                 ]




>consensus_7127#0
CGACAGATGTGACCGAGGTACTGAAGGTATTCTACCTGATTGTGTACCATGTGGTGAATG
TTGGAATAACTGGGATAAAGCAATCGATAAAGTTATTAGTGAATTAGATCGTTACAGAAT
CAAACGAGTCAACAATTACCTAAAGAATTAAAAATTATGTTTGATAGTTTAGTCAGTTTA
TTAGATCAAATTGAACATGTACCATGGATGACAACAGATGATACAAGATTGAATGAATTA
CGTGATGTATTAAAACGAAGCGAAGAAACTATTATGCGTTTAAGTTCACTTGATCAATTC
GCTGACAGTTTAGTAAAATGGGATGATTTAATAACAGAGAGATTAGCTCAACAGTTAGAG
CGTAAAGGAGTAGTGAATGAAGCAAAAGCACGTCTTGAAACACTAAAAACACAAATGCAA
AGTATAATGGATGAATCAATGAAATTGGAACATCTTGATAAAAGAGGAGCATATTTATCA
ATTCTACGTTCAAAAGATATCGGTGATCGAGTTATAAACACACAAACTAGTATAGAATAT
CAACGTGGTGGATTAGAAGCTGAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case