These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7156#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1092 fasta sequence [ATAACTGAACCTTGTTCGTGTTGACNTAAGAAGTAGCTTTTCCGAGATGACAGTAACTTGAGGGATTAGGCGATAGTCATATAATTCACCTCCACCGAATTATGGTTTTCCCAAACATGTTCGGCAATACGGCTTCATGTACTACCGAAGCTCTTGTTACTTGAGGCAAGTAGTTAATTAAGAACTGGTCAGCATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAAAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTTGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGATATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAATAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCTGGGATCATACCAGGACGACCAATACAATTGAAGGTCGGGACGGCTTTAACTTCGAAATTTTAACATCCGGCTCTCCACTGTTTAAAGCTGAATTATTTCGTCCAACTAATTATAAGTTATGTTGGTACAGCCCAACTTTTCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG] [-] EMBL CD189597 [ATAACTGAACCTTGTTCGTGTTGACNTAAGAAGTAGCTTTTCCGAGATGACAGTAACTTGAGGGATTAGGCGATAGTCATATAATTCACCTCCACCGAATTATGGTTTTCCCAAACATGTTCGGCAATACGGCTTCATGTACTACCGAAGCTCTTGTTACTTGAGGCAAGTAGTTAATTAAGAACTGGTCAGCATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAAAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTTGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGATATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAATAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCT ] [+] EMBL CD168084 [ CATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAGAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTCGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGACATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAAAAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCTGGGATCATACCAGGACGACCAATACAATTGAAGGTCGGGACGGCTTTAACTTCGAAATTTTAACATCCGGCTCTCCACTGTTTAAAGCTGAATTATTTCGTCCAACTAATTATAAGTTATGTTGGTACAGCCCAACTTTTCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTC ] [-] EMBL CD120374 [ TCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG] [-] EMBL CD120477 [ TCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTACCCTGAATAGTATTCAGCA TTCAACTTTCCTATAAATCTGTNNTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||