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Schistosoma mansoni
cluster # 7156 cluster # 7156       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7156#0 length = 1092 sequences # 4  

consensusID : consensus_7156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1092
fasta sequence
                              [ATAACTGAACCTTGTTCGTGTTGACNTAAGAAGTAGCTTTTCCGAGATGACAGTAACTTGAGGGATTAGGCGATAGTCATATAATTCACCTCCACCGAATTATGGTTTTCCCAAACATGTTCGGCAATACGGCTTCATGTACTACCGAAGCTCTTGTTACTTGAGGCAAGTAGTTAATTAAGAACTGGTCAGCATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAAAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTTGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGATATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAATAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCTGGGATCATACCAGGACGACCAATACAATTGAAGGTCGGGACGGCTTTAACTTCGAAATTTTAACATCCGGCTCTCCACTGTTTAAAGCTGAATTATTTCGTCCAACTAATTATAAGTTATGTTGGTACAGCCCAACTTTTCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG]

[-] EMBL CD189597             [ATAACTGAACCTTGTTCGTGTTGACNTAAGAAGTAGCTTTTCCGAGATGACAGTAACTTGAGGGATTAGGCGATAGTCATATAATTCACCTCCACCGAATTATGGTTTTCCCAAACATGTTCGGCAATACGGCTTCATGTACTACCGAAGCTCTTGTTACTTGAGGCAAGTAGTTAATTAAGAACTGGTCAGCATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAAAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTTGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGATATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAATAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD168084             [                                                                                                                                                                                                CATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTAGCAGAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCCTCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTCGCTGGTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGACATTGGGATAAGTAAGCTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAAAAGCATATGCTATTTTGTTACGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCTGGGATCATACCAGGACGACCAATACAATTGAAGGTCGGGACGGCTTTAACTTCGAAATTTTAACATCCGGCTCTCCACTGTTTAAAGCTGAATTATTTCGTCCAACTAATTATAAGTTATGTTGGTACAGCCCAACTTTTCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD120374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACTTTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG]
[-] EMBL CD120477             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTAGTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTACCCTGAATAGTATTCAGCA TTCAACTTTCCTATAAATCTGTNNTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTCCCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAATGAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTTCCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAATGGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCTGGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCTAGTGAAAAGTTG]


>consensus_7156#0 ATAACTGAACCTTGTTCGTGTTGACNTAAGAAGTAGCTTTTCCGAGATGACAGTAACTTG AGGGATTAGGCGATAGTCATATAATTCACCTCCACCGAATTATGGTTTTCCCAAACATGT TCGGCAATACGGCTTCATGTACTACCGAAGCTCTTGTTACTTGAGGCAAGTAGTTAATTA AGAACTGGTCAGCATGCCGTAGATTGATGTATTTACCGTTTCAAAATCAATGTATTAGTA GCAAAGCGGCTCGATACATTGCCCAAGTGAACACTCGCTGCATGACTTAAATATCAATCC TCGCTACAATTTGACTTTGACAGCTAATAATCATGTTTTGCCAAGTTTACCATGTTGCTG GTCAGAATTCAGTCAGCAAAAACACGGTGACATGGTATTAAAGATATTGGGATAAGTAAG CTCATGTCCGAACTAACAATAGGTAACTTACCGACTTCAATAGCATATGCTATTTTGTTA CGTTGAGGAAGGTGAGCTTCTCAAGTTTCACTAGCTGGGATCATACCAGGACGACCAATA CAATTGAAGGTCGGGACGGCTTTAACTTCGAAATTTTAACATCCGGCTCTCCACTGTTTA AAGCTGAATTATTTCGTCCAACTAATTATAAGTTATGTTGGTACAGCCCAACTTTTCTTA GTCAAGACTGTTACTAGTTCTCAGTAATAAGTTACCTGAATAGTATTCAGCATTTCAACT TTCCTATAAATCTGTTTTATTTGAGCATATTTGTTTGAATGTGATGGATACTCGGGCCTC CCAGGCACTGTAAATTGTTCCACGACGAAGTCCTGTTAAACTCGATCTTGCCAAACTAAT GAGTAGATTGACCACTTAGATAGGGTGGTTTTCGTGTTATAATACTGCAATCCTAGACTT CCTTCTTCATTTCCTAGAAAAACCACGTTCATTCTTTGAATAAAGTTCTGCATCTTAAAT GGAACAGGAAACGTCTACTAGACGTCGTACTTGAGAGTAATCTACAAACTCCAGCTATCT GGTACCATGCGTAACAAAACATGGTGTTCGGGATAGTTATTAACTGTCATAATCATGCCT AGTGAAAAGTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)