cluster # 7166

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Schistosoma mansoni
cluster # 7166 cluster # 7166 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7166#0 length = 579 sequences # 4

consensusID : consensus_7166#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 579
fasta sequence

                              [GCGACAGCGACAACAGACAACATGCAAACTGTCACTGGTATAAATAAGCTGATTATTTGCTTCGCCCCATAATAAAGCATTTGATCGGGATTGATAGAATTGATTGATTCACGGGACGAGTGGTTATGACCAAGTAAACGATTATGAGGTGCTGAACTAGATGTTGGAAGATCACCATGCGAGTGCTCTCTTGGGCTTTTGTTTGACTGTCCAAGGGGTTGAGATGAAGACGGATTGGTTGTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTTCAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTGACGATAATGGTCTCTTAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGAATTGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGTTGATAGTCATCTGACAAGTAGTTTGTTCTGGCCTTGTCAACCTTTTTAGTATCCTCGTAGATTCTCTTTGAGCGACACTAAAGTTGGTAAAGGTGGTAACGCAGATTTTCAAAAGCGTTACA]

[-] EMBL CD112617             [GCGACAGCGACAACAGACAACATGCAAACTGTCACTGGTATAAATAAGCTGATTATTTGCTTCGCCCCATAATAAAGCATTTGATCGGGATTGATAGAATTGATTGATTCACGGGACGAGTGGTTATGACCAAGTAAACGATTATGAGGTGCTGAACTAGATGTTGGAAGATCACCATGCGAGTGCTCTCTTGGGCTTTTGTTTGACTGTCCAAGGGGTTGAGATGAAGACGGATTGGTTGTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTTCAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTGACGATAATGGTCTCTTAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGGATTGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGT                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD183388             [                                               GCTGATTATTTGCTTCGCCCCATAATAAAGCATTTGATCGGGATTGATAGAATTGATTGATTCACGGGACGAGTGGTTATGACCAAGTAAACGATTATGAGGTGCTGAACTAGATGTTGGAAGATCACCATGCGAGTGCTCTCTTGGGCTTTTGTTTGACTGTCCAAGGGGTTGAGATGAAGACGGATTGGTTGTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTTCAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTGACGATAATGGTCTCTTAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGAATTGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGTTGATAGTCATCTGACAAGTAGTTTGTTCTGGCCTTGTCAACCTTTTTAGTATCCTCGTAGATTCTCTTTGAGCGACACTAAAGTTGGTAAAGGTGGTAACGCAGATTTTCAAAAGCGTTACA]
[-] EMBL CD123144             [                                                                                                                                                                                                         TTTGACTGTCCAAGGGGTTGAGATGAAGACGGATTGGTTGTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTTCAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTTACGATAATGGTCTCTTAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGAATTGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGTTGATAGTCATCTGACAAGTAGTTTGTTCTGGCCTTGTCAACCTTTTTAGTATCCTCGTAGATTCTCTTTGAGCGACACTAAAGTTGGTAAAGGTGGTAACGCAGAATTTCAAAAGC      ]
[+] EMBL CD133570             [                                                                                                                                                                                                                                TGAAGACGGATTGGTTGTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTTCAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTGACGATAATGGTCTCTTAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGAATTGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGTTGATAGTCATCTGACAAGTAGTTTGTTCTGGCCTTGTCAACCTTTTTAGTATCCTCGTAGATTCTCTTTGAGCGACACTAAAGTTG                                    ]




>consensus_7166#0
GCGACAGCGACAACAGACAACATGCAAACTGTCACTGGTATAAATAAGCTGATTATTTGC
TTCGCCCCATAATAAAGCATTTGATCGGGATTGATAGAATTGATTGATTCACGGGACGAG
TGGTTATGACCAAGTAAACGATTATGAGGTGCTGAACTAGATGTTGGAAGATCACCATGC
GAGTGCTCTCTTGGGCTTTTGTTTGACTGTCCAAGGGGTTGAGATGAAGACGGATTGGTT
GTCATTGATAAACCGATTGTAACAACAAAATCTGTATTATTTAGTAGTGAAAGTCTTTTT
CAGTTTGAAAAAGAACAGGAGGCTGTGTAGGCTATTTAAGTCCTGACGATAATGGTCTCT
TAGTTGGTCCAACTCTATTTTAAATGCGTCAATAGATGGAGCTCTTATCACGTGGTGAAT
TGGTGAGTTTCACTCGTTGATGATTCAATAGGAAAGTTGATAGTCATCTGACAAGTAGTT
TGTTCTGGCCTTGTCAACCTTTTTAGTATCCTCGTAGATTCTCTTTGAGCGACACTAAAG
TTGGTAAAGGTGGTAACGCAGATTTTCAAAAGCGTTACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case