Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7168 cluster # 7168       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7168#0 length = 972 sequences # 4  
consensusID : consensus_7168#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 972
fasta sequence 
                              [AAATATTCACTTGCTACTGGTAATTGGGGTGATCAGAAAAAAGCAAATCAAGCACGTCCAGGTGTCTCACAGGTGCTTAATCGTTTAACATTTGCATCAACGTTATCACATTTAAGACGACTTAATTCACCTATTGGAAGAGATGGAAAATTAGCAAGACCTAGACAATTGCACAATACTTTATGGGGTATGATTTGTCCAGCTGAAACACCTGAAGGTCATGCTGTGGGATTAGTGAAAAATCTTGCTTTGATGGCATATATTTCAGTTGGAAGTCAACCATCACCTATTTTAGAATTCTTAGAAGAGTGGAGTATGGAGAATTTGGAAGAAATAGCTCCTTCAGCTATTGGAAAGACTTGTAAAATATTTGTCAACGGCTGTTGGGTTGGTATTCATAGTTCACCAGATCATTTAATGGGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTTGATGTCATTGTCAGTGAAGTCAGTATGATTCGGGATTATCGTGATCAAGAAATACGAATCTATACAGATGCTGGTCGTATTTGTCGTCCATTGGTTATTGTTGAGAAAGGCAAATTACTATTGAAACGTAGTCATATTGAACTTTTAAAAGATAAAGCGTATAATCGTTACAGCTGGCAAGATCTTGTACTCAGTGGTGTCGTTGAATATATTGATACTTTAGAAGAAGAAACTGTTATGATTGCTATGGGTCCAGCAGAAATGCAAGCTGCTGTAAATTATTGTAAAACACATACACATTGTGAAATTCATCCAAGTATGATATTAGGTATATGTGCTAGTATTATACCATTCCCTGATCATAATCAATCACCAAGAAATACATATCAAAGTGCTATGGGTAAACAAGCTATGGGTGTATATATTAGTAATTTTCATACAAGAATGGATACATTGGCTAATGTATTATATTATCCACAAAACCATTAGTTGCTACGCGATTTATGGAGTATTTACGTTNTA]

[-] EMBL CD121865             [AAATATTCACTTGCTACTGGTAATTGGGGTGATCAGAAAAAAGCAAATCAAGCACGTCCAGGTGTCTCACAGGTGCTTAATCGTTTAACATTTGCATCAACGTTATCACATTTAAGACGACTTAATTCACCTATTGGAAGAGATGGAAAATTAGCAAGACCTAGACAATTGCACAATACTTTATGGGGTATGATTTGTCCAGCTGAAACACCTGAAGGTCATGCTGTGGGATTAGTGAAAAATCTTGCTTTGATGGCATATATTTCAGTTGGAAGTCAACCATCACCTATTTTAGAATTCTTAGAAGAGTGGAGTATGGAGAATTTGGAAGAAATAGCTCCTTCAGCTATTGGAAAGACTTGTAAAATATTTGTCGACGGCTGTTGGGCTGGTATTCATAGTTCACCAGATCATTTAATGGGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTCGATGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD121910             [                                                              TGTCTCACAGGTGCTTAATCGTTAAACATTTGCATCAACGTTATCACATTTAAGACGACTTAATTCACCTATTGGAAGAGATGGAAAATTAGCAAGACCTAGACAATTGCACAATACTTTATGGGGTATGATTTGTCCAGCTGAAACACCTGAAGGTCATGCTGTGGGATTAGTGAAAAATCTTGCTTTGATGGCATATATTTCAGTTGGAAGTCAACCATCACCTATTTTAGAATTCTTAGAAGAGTGGAGTATGGAGAATTTGGAAGAAATAGCTCCTTCTGCTATTGGAAAGACTTGTAAAATATTTGTCAACGGCTGTTGGGTTGGTATTCATAGTTCACCAGATCATTTAATGGGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTTGATGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD112642             [                                                                                                       TATCACATTTAAGACGACTTAATTCACCTATTGGAAGAGATGGAAAATTAGCAAGACCTAGACAATTGCACAATACTTTATGGGGTATGATTTGTCCAGCTGAAACACCTGAAGGTCATGCTGTGGGATTAGTGAAAAATCTTGCTTTGATGGCATATATTTCAGTTGGAAGTCAACCATCACCTATTTTAGAATTCTTAGAAGAGTGGAGTATGGAGAATTTGGAAGAAATAGCTCCTTCAGCTATTGGAAAGACTTGTAAAATATTTGTCAACGGCTGTTGGGTTGGTATTCATAGTTCACCAGATCATTTAATGGGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTTGATGTCATTGTCAGTGAAGTCAGTATGATTCGGGATTATCGTGATCAAGAAATACGAATCTATACAGATGCTGGTCGTATTTGTCGTCCATTGGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD153115             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCATAGTTCACCAGATCATTTAATGGGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTTGATGTCATTGTCAGTGAAGTCAGTATGATTCGGGATTATCGTGATCAAGAAATACGAATCTATACAGATGCTGGTCGTATTTGTCGTCCATTGGTTATTGTTGAGAAAGGCAAATTACTATTGAAACGTAGTCATATTGAACTTTTAAAAGATAAAGCGTATAATCGTTACAGCTGGCAAGATCTTGTACTCAGTGGTGTCGTTGAATATATTGATACTTTAGAAGAAGAAACTGTTATGATTGCTATGGGTCCAGCAGAAATGCAAGCTGCTGTAAATTATTGTAAAACACATACACATTGTGAAATTCATCCAAGTATGATATTAGGTATATGTGCTAGTATTATACCATTCCCTGATCATAATCAATCACCAAGAAATACATATCAAAGTGCTATGGGTAAACAAGCTATGGGTGTATATATTAGTAATTTTCATACAAGAATGGATACATTGGCTAATGTATTATATTATCCACAAAACCATTAGTTGCTACGCGATTTATGGAGTATTTACGTTNTA]




>consensus_7168#0
AAATATTCACTTGCTACTGGTAATTGGGGTGATCAGAAAAAAGCAAATCAAGCACGTCCA
GGTGTCTCACAGGTGCTTAATCGTTTAACATTTGCATCAACGTTATCACATTTAAGACGA
CTTAATTCACCTATTGGAAGAGATGGAAAATTAGCAAGACCTAGACAATTGCACAATACT
TTATGGGGTATGATTTGTCCAGCTGAAACACCTGAAGGTCATGCTGTGGGATTAGTGAAA
AATCTTGCTTTGATGGCATATATTTCAGTTGGAAGTCAACCATCACCTATTTTAGAATTC
TTAGAAGAGTGGAGTATGGAGAATTTGGAAGAAATAGCTCCTTCAGCTATTGGAAAGACT
TGTAAAATATTTGTCAACGGCTGTTGGGTTGGTATTCATAGTTCACCAGATCATTTAATG
GGTACTTTACGAAAACTGCGTCGTCAAGTTGATGTCATTGTCAGTGAAGTCAGTATGATT
CGGGATTATCGTGATCAAGAAATACGAATCTATACAGATGCTGGTCGTATTTGTCGTCCA
TTGGTTATTGTTGAGAAAGGCAAATTACTATTGAAACGTAGTCATATTGAACTTTTAAAA
GATAAAGCGTATAATCGTTACAGCTGGCAAGATCTTGTACTCAGTGGTGTCGTTGAATAT
ATTGATACTTTAGAAGAAGAAACTGTTATGATTGCTATGGGTCCAGCAGAAATGCAAGCT
GCTGTAAATTATTGTAAAACACATACACATTGTGAAATTCATCCAAGTATGATATTAGGT
ATATGTGCTAGTATTATACCATTCCCTGATCATAATCAATCACCAAGAAATACATATCAA
AGTGCTATGGGTAAACAAGCTATGGGTGTATATATTAGTAATTTTCATACAAGAATGGAT
ACATTGGCTAATGTATTATATTATCCACAAAACCATTAGTTGCTACGCGATTTATGGAGT
ATTTACGTTNTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)