cluster # 7179

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Schistosoma mansoni
cluster # 7179 cluster # 7179 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7179#0 length = 657 sequences # 4

consensusID : consensus_7179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 657
fasta sequence

                              [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]

[+] EMBL CD178780             [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATGGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACA                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD117466             [                                                                                                                                            AATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCATCCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACCGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTC ]
[-] EMBL CD117179             [                                                                                                                                             ATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGACGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]
[-] EMBL CD117394             [                                                                                                                                                                              AAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]




>consensus_7179#0
TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAA
TCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACA
ACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGC
ATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGA
TTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATAT
TAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTC
GTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCT
GTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACA
GGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAA
TGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAA
GACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case