Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7191 cluster # 7191       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7191#0 length = 792 sequences # 5  
consensusID : consensus_7191#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 792
fasta sequence 
                              [TTCATCCTGACTACAGGTGCGCCTCATATCATGGGCTGAAATAATATTGTCATATGGCTGCTTAGAGTTTATTTACCCGTCAATGTTGTTGTTAAGCATATCGATATATTCTTCGAGTTCAATCCTATTTTATCGTCCTAATTATTGAAGGCAGTTGTGTTACGTCAGATTATTACTCATTCCATTTGCTAACGGACCTTATCACTGACGATCGCAATTACTATAAATTTTGTTTTTTGGATATGTGCGCACTTATCAATTGTCAAAGAGCTTCCTCTAAAAAATCCAAAGCTAAAATATTTAATTATTTCTGCAAAGAGTTATCGGGTGTACTTGAATGTGATCCTGATACCATTGGGAGGGCAGATGTCACTTTTGTTGTTGGTCAAAATATTTATCATGGAAACCAAAAAACAATTTCCATATTGAGTGAGGAGCTGAAAAAATGCTTTCAGTCGGAGAGTGGGGACGTTGACTACACCTCTACACATGGTTGCATACTGAAAGTGACTAAATCAAAGTCTTCGTCTTCAGTCAAGGTGTTTATTGATGCATCTGCGGACGTTTTCGAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTTAAGGCTTACTGTGCCCGAAGAACTAATACCACACGTTTACTTCTTGTTAAAATGTCTACAGATCAAAACGTTGGAGACAACGTGCATCGAGTTTTTGATTCACAATTTATCAATCAACAGTGTTGGGGTTCTGTGTCGCTTTATTCAGTTCAGTGGGGTCTATCAAAATAGTAATGAATTTGCTACAAGTCCCA]

[+] EMBL CD150606             [TTCATCCTGACTACAGGTGCGCCTCATATCATGGGCTGAAATAATATTGTCATATGGCTGCTTAGAGTTTATTTACCCGTCAATGTTGTTGTTAAGCATATCGATATATTCTTCGAGTTCAATCCTATTTTATCGTCCTAATTATTGAAGGCAGTTGTGTTACGTCAGATTATTACTCATTCCATTTGCTAACGGACCTTATCACTGACGATCGCAATTACTATAAATGTTGTTTTTTGGATATGTGCGCACTTATCAATTGTCAAAGAGCTTCCTCTAAAAAATCCAAAGCTAAAATATTTAATTATTTCTGCAAAGAGTTATCGGGTGTACTTGAATGTGATCCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD164490             [                                                                                                                                                                                                                CGATCGCAATTACTATAAATTTTGTTTTTTGGATATGTGCGCACTTATCAATTGTCAAAGAGCTTCCTCTAAAAAATCCAAAGCTAAAATATTTAATTATTTCTGCAAAGAGTTATCGGGTGTACTTGAATGTGATCCTGATACCATTGGGAGGGCAGATGTCACTTTTGTTGTTGGTCAAAATATTTATCATGGAAACCAAAAAACAATTTCCATATTGAGTGAGGAGCTGAAAAAATGCTTTCAGTCGGAGAGTGGGGACGTTGACTACACCTCTACACATGGTTGCATACTGAAAGTGACTAAATCAAAGTCTTAGTCTTCAGTCAAGGTGTTTATTGATGCATCTGCGGACGTTTTCGAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTT                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD164465             [                                                                                                                                                                                                                CGATCGCAATTACTATAAATTTTGTTTTTTGGATATGTGCGCACTTATCAATTGTCAAAGAGCTTCCTCTAAAAAATCCAAAGCTAAAATATTTAATTATTTCTGCAAAGAGTTATCGGGTGTACTTGAATGTGATCCTGATACCATTGGGAGGGCAGATGTCACTTTTGTTGTTGGTCAAAATATTTATCATGGAAACCAAAAAACAATTTCCATATTGAGTGAGGAGCTGAAAAAATGCTTTCAGTCGGAGAGTGGGGACGTTGACTACACCTCTACACATGGTTGCATACTGAAAGTGACTAAATCAAAGTCTTCGTCTTCAGTCAAGGTGTTTATTGATGCATCTGCGGACGTTTTCGAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTT                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD182427             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCTTTCAGTCGAAGAGTGGGGACGTTGACTACACCTCTACACATGGTTGCATACTGAAAGTGACTAAATCAAAGTCTTCGTCTTCAGTCAAGGTGTTTATTGATGCATCTGCGGACGTTTTCGAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTTAAGGCTTACTGTGCCCGAAGAACTAATACCACACGTTTACTTCTTGTTAAAATGTCTACAGATCAAAACGTTGGAGACAACGTGCATCGAGTTTTTGATTCACAATTTATCAATCAACAGTGTTGGGGTTCTGTGTCGCTTTATTCAGTTCAGTGGGGTCTATCAAAATAGTAATGAATTTGCTACAAGTCCCA]
[+] EMBL CD095044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTTAAGGCTTACTGTGCCCGAAGAACTAATACCACACGTTTACTTCTTGTCAAAATGTCTACAGATCAAAACGTTGGAGACAACGTGCATCGAGTTTTTGATTCACAATTTATCAATCAACAGTGTTGGGGTTCTGTGTCGCTTTATTCAGTTCAGTGGGGTCTATCAAAATAGTA                     ]




>consensus_7191#0
TTCATCCTGACTACAGGTGCGCCTCATATCATGGGCTGAAATAATATTGTCATATGGCTG
CTTAGAGTTTATTTACCCGTCAATGTTGTTGTTAAGCATATCGATATATTCTTCGAGTTC
AATCCTATTTTATCGTCCTAATTATTGAAGGCAGTTGTGTTACGTCAGATTATTACTCAT
TCCATTTGCTAACGGACCTTATCACTGACGATCGCAATTACTATAAATTTTGTTTTTTGG
ATATGTGCGCACTTATCAATTGTCAAAGAGCTTCCTCTAAAAAATCCAAAGCTAAAATAT
TTAATTATTTCTGCAAAGAGTTATCGGGTGTACTTGAATGTGATCCTGATACCATTGGGA
GGGCAGATGTCACTTTTGTTGTTGGTCAAAATATTTATCATGGAAACCAAAAAACAATTT
CCATATTGAGTGAGGAGCTGAAAAAATGCTTTCAGTCGGAGAGTGGGGACGTTGACTACA
CCTCTACACATGGTTGCATACTGAAAGTGACTAAATCAAAGTCTTCGTCTTCAGTCAAGG
TGTTTATTGATGCATCTGCGGACGTTTTCGAAGCGGTATTAAATTATATGCTTACTTTAA
GGCTTACTGTGCCCGAAGAACTAATACCACACGTTTACTTCTTGTTAAAATGTCTACAGA
TCAAAACGTTGGAGACAACGTGCATCGAGTTTTTGATTCACAATTTATCAATCAACAGTG
TTGGGGTTCTGTGTCGCTTTATTCAGTTCAGTGGGGTCTATCAAAATAGTAATGAATTTG
CTACAAGTCCCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)