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Schistosoma mansoni
cluster # 7194 cluster # 7194       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7194#0 length = 632 sequences # 5  

consensusID : consensus_7194#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 632
fasta sequence
                              [TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC-GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG-GTTG-TGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT]

[+] EMBL CD193075             [TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTATGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATGTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATGNGTTG TGATCA                                  ]
[+] EMBL CD158655             [                                                                                                                                                                                                                                                      TTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGCTGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT]
[+] EMBL CD086601             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAATACAGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATGCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GCTG Ttga                                    ]
[-] EMBL CD086592             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATA GCCGGATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGAT                                    ]
[+] EMBL CD197420             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGATCAAGTTCCAGTCAGTGCAGAGGA             ]


>consensus_7194#0 TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCC GTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCT GCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAG CTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACT GTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTG TATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCA ACTAACATATATGCCGATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCA GGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCA TTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAA CAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATGGTTGTGATCAAG TTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)