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Schistosoma mansoni
cluster # 7216 cluster # 7216       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7216#0 length = 672 sequences # 5  

consensusID : consensus_7216#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 672
fasta sequence
                              [TACACTTGCTCTGAAGCGATTAACGTTGGCTAATAACCATCGTTCCTGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT-TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG-TCGGTTTTCTGGGCCCTG-TTTTTGTACCGAAA-GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT-GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG-TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG-AAAACAGGATCTATAA-GAATTATCCAACAGCAGT-GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG-AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT-GTGTTACAATTCAATTG-AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAACGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAAT-ATACACTNTCTGATCTATTGATTACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATTG]

[+] EMBL CD201191             [TACACTTGCTCTGAAGCGATTAACGTTGGCTAATAACCATCGTTCCTGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD083055             [                                              TGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACTTTCCCCTACTGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAACGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAAT ATACACTNTCTGATCTATTGATTACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATT ]
[+] EMBL CD078113             [                                                                              AGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AA559754             [                                                                                                                   cgcCCTTTTGGTTTCTTGTTCGGTTTTCTGGGCCCTGTTTTTTGTACCGAAAGGGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATTGGTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTGTTTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTGAAAAACAGGATCTATAANAAATTATCCAACAGCAGTGGGACGCGCAAATAGATTTGAGAAGAAATCTTATCTCAAAAGTACAATTTTGGTGTTACAATTCAATTGAAATGTTTACTTCTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD076630             [                                                                                                                                 ctgn TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAAGGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAATAATACACTTTCTGATCTATTGATGACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATTG]


>consensus_7216#0 TACACTTGCTCTGAAGCGATTAACGTTGGCTAATAACCATCGTTCCTGAAAAAGCACATT AACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCTTGGTGTTGTCTCCGCCT TTTGGTTTCTTGTCGGTTTTCTGGGCCCTGTTTTTGTACCGAAAGGACCCAACAAAATGC TCTTGTCTGTATCGATTGTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTGTTTTGGATAGGATTTT ACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTGAAAACAGGATCTATAAGAATTA TCCAACAGCAGTGGACGCGCAAATAGATTTGAGAAGAATCTTATCTCAAAAGTACAATTT TGTGTTACAATTCAATTGAATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGG AATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAA AACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATT TTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAACGTTAACATATCA GTTTTATTGATTGAATATACACTNTCTGATCTATTGATTACTAATAATAGTGATTTGTTG AAATATCTATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)