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Schistosoma mansoni
cluster # 7219 cluster # 7219       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7219#0 length = 544 sequences # 5  

consensusID : consensus_7219#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 544
fasta sequence
                              [TGTTACTAGATACTAAATGTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC-TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA-ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTTAACTGGTT]

[+] EMBL CD134212             [TGTTACTAGATACTAAATGTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACACATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTC                       ]
[+] EMBL CD134198             [                  GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTTAACTGGTT]
[+] EMBL CD134288             [                  GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTGTACT    ]
[+] EMBL CD134297             [                  GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACACTTTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGTGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAGACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTt                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD134292             [                  GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGGTTAATTTTGAATGTCTGGTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_7219#0 TGTTACTAGATACTAAATGTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCT ACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAA TGTCTGTTGATTAAAACACTTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACA AGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACAATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCA TTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCA GTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGG ATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAA AATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGAT GTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTTAACT GGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)