These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7219#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 544 fasta sequence [TGTTACTAGATACTAAATGTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC-TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA-ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTTAACTGGTT] [+] EMBL CD134212 [TGTTACTAGATACTAAATGTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACACATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTC ] [+] EMBL CD134198 [ GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTTAACTGGTT] [+] EMBL CD134288 [ GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGGGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAAACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTCCTAAATAAATATGTTACAGTGTGCTATTGATTTTACATGGATACTCAAATGATCCCATTTTTATAAGAACTGTCTTTTAAATTCACAAAATATACACAAAAATGTAAAATCACAGAAATCATGCAAATAATTTCGCTTTCATTTTGACATTCCATCAGATGTTTCATGCAATTCATGCAATTAATTACAATCGTTTTATTCACAGCTCATTAGGTGTACT ] [+] EMBL CD134297 [ GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGTTTAATTTTGAATGTCTGTTGATTAAAACACTTTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCATTGTGATGGTTTCCAAGATTATTCAGTAAATCAATCAGTGCAGACTAGGACACGATGTCAGTGACTGATTAACTTTGCTt ] [+] EMBL CD134292 [ GTATACTGACGACGTGAATGTATATAAATAATAAAAGTACCTACATATAATACGAAATGCTTTCGTTATAGCATTTAATTATTTCGCCTGGTTAATTTTGAATGTCTGGTGATTAAAACAC TTGAAATGGAATATTTAAGCATCAATATCATATGGATCACAAGTTATAGTTTACATAAATGAACTGGTGTACA ATGAAATCACCATGTCTACAAAAAGTCAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||