These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7225#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 823 fasta sequence [GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT-ATATAAACCTCTTC-ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC-TTTTTCAAAATAATTGAC-ATGAT-AATATGATTTA] [+] EMBL CD080702 [GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT ATATAAACCTCTTC ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC TTTTTCAAAATAATTGAC ATGAT AATATGATT ] [-] EMBL CD202280 [ aAGTTAAATTGTTGTGGAGCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATC ] [-] EMBL CD074627 [ TTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACACCAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTTTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTGAACATTGTAATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTTAATAATATAAACCTCTTCAATATTGTCTTCTGGGTGTATTCTTCTCCCCCTTTTTTCAAAATAATTGACAATGATAAATATGATTTA] [+] EMBL SMRAP039 [ TCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAAC AAAACTATATGAMATAAATCTTATA ] [+] EMBL SM012 [ CAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTC GAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||