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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7225#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 823 fasta sequence
[GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT-ATATAAACCTCTTC-ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC-TTTTTCAAAATAATTGAC-ATGAT-AATATGATTTA]
[+] EMBL CD080702 [GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT ATATAAACCTCTTC ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC TTTTTCAAAATAATTGAC ATGAT AATATGATT ]
[-] EMBL CD202280 [ aAGTTAAATTGTTGTGGAGCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATC ]
[-] EMBL CD074627 [ TTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACACCAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTTTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTGAACATTGTAATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTTAATAATATAAACCTCTTCAATATTGTCTTCTGGGTGTATTCTTCTCCCCCTTTTTTCAAAATAATTGACAATGATAAATATGATTTA]
[+] EMBL SMRAP039 [ TCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAAC AAAACTATATGAMATAAATCTTATA ]
[+] EMBL SM012 [ CAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTC GAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||