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Schistosoma mansoni
cluster # 7225 cluster # 7225       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7225#0 length = 823 sequences # 5  

consensusID : consensus_7225#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 823
fasta sequence
                              [GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT-ATATAAACCTCTTC-ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC-TTTTTCAAAATAATTGAC-ATGAT-AATATGATTTA]

[+] EMBL CD080702             [GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGGACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTAAAT ATATAAACCTCTTC ATATTGNCTTCTGGNTGTATNCTNCTCCCCC TTTTTCAAAATAATTGAC ATGAT AATATGATT  ]
[-] EMBL CD202280             [                                           aAGTTAAATTGTTGTGGAGCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAATGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCTTGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATGCTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074627             [                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATTGATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAGGTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACACCAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAATAAATTTCTTTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAACATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTGAACATTGTAATTTAGTAACATTAAAGCGATTTATTCATCTTATTGGTTTAATAATATAAACCTCTTCAATATTGTCTTCTGGGTGTATTCTTCTCCCCCTTTTTTCAAAATAATTGACAATGATAAATATGATTTA]
[+] EMBL SMRAP039             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCAATTATAACTTCATGTAATTATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAAC AAAACTATATGAMATAAATCTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL SM012                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAAAACTATATGAAATAAATCTTATATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTC    GAGGGGTTTGTCATTTTTTATTCAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_7225#0 GGTACGAGGACCGAATAGTATCTTAATGGGTCTTATCATGATGTAGTTAAATTGTTGTGG ACCCAGAAATGGAAGTGATTTTTATCATCCAGTTAAATTTAACAGGACGGATGTTTGGAA TGGTGTAACATATACAAATTTGAAATATCCAGTACCATGTTGTAGATTTAATGGAAATCT TGAAATACAAGATGATTCATGCCCTAAAAGTTTTAAAATTTCCAATATACATAATGGATG CTTAAAACCATTACATCGACTCTTAACATATTACGTTGATATAGCAGCATATCTATCATT GATACTTTTATTATGTGAAATCATAATATTCCTAATGGCTATATTGATAAATAAAAGGAG GTAACTGGATAAAAACTGTTAAAAAAATGGATCCGTATTCAATTATAACTTCATGTAATT ATCTCATCGCTAACAGATGATATAATCAACAACAACAAAAACTATATGAAATAAATCTTA TATTGTTTATCTTTTGTTACCAACACGATTTTTCGGGGGAGGGGTTTGTCATTTTTTATT CAAAATTTTCGCTCAACTTATTTTCAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTCTCTCTTCAAAAAT AAATTTCTCTTCATAACATAACGACTATCATATAAACAATCTATATTATATATGGTTAAC ATTATAGACTCTCTCGTACACTTTAAACACTNGACATTGNTATTTAGTAACATTAAAGCG ATTTATTCATCTTATTGGTTAAATATATAAACCTCTTCATATTGNCTTCTGGNTGTATNC TNCTCCCCCTTTTTCAAAATAATTGACATGATAATATGATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)