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Schistosoma mansoni
cluster # 7228 cluster # 7228       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7228#0 length = 968 sequences # 5  
consensusID : consensus_7228#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 968
fasta sequence 
                              [TAATAAAAGATTTATGGCTTTATTCAAGTCGTAATTGGCTTCATGAAGTATATCATGTGCATGTTGACGAGTTATATCGCGTGAAGCTGAAGCTGTAGCACTTAGTAGAAGTGGTTGTTTAGTAGACGATGAAGTATCATGTGCACGACCGTATGTACCAACGGCTTTGGCTAATAAACAAAACATATCGATCTCTTGAGCTGTTAATGAATGGGAAGGGGACCAAACTAACTCTTCATGTACTTCAGTTAATCGGACATCTTCTGATTTTGATTTTAGTAAACATTGTATCTCAGACTGATAATCTGATCCGATTCTCATTGAACCTCTATCTTCTTGAAGAGTTTTCAAAGTGGGATCATATATAAGTTTATAATAAAATGCCTCATCTCTGACTAGGTAATTTGTCAATGGTTCTGCATCATTGTGTAGTGTAACAGAGCATTTACCCCTAATATGTGTAGCTGGTAGACATTCAACTTGTCGTGAAAGAAACAATTCTCGATGTTTTAACTGATGCCTTTGTTGTTCAGTGATTGCAGTATTAGAGCGTTTTAAGCCTTCTTTGGAGTTATTATCATTATTATTTGAATTGGTTATTTCATTTGTACATTCTTCATCATAATCATCATCACTGCCATAGTATTTCTCTGCCTGATTAATTAAAGCACTGGATACATCACGTCTACGGTAGTAACAGGCAACTTTAGCTTCAACAGCACCAGTGGGAGTTTTATTAAGTTCATCTATTCGACGGATTTGATATGGAGCAGTGGCTGATGATTCAAAATAAACGAAATCCCCGACTCTGTACATATTATTGGATGCCATTGGGATTCCGTCAGTTGTGTAAACGACAGCTATTTACAAGTACTCCACGAAGGATTCGAATAAACCCTGGAATTCAGAGGGATGCCAGATTTAGAAGTTGATAATCCAGTGCGCGAACGAACAGTTGATCCCTAATC]

[+] EMBL CD179485             [TAATAAAAGATTTATGGCTTTATTCAAGTCGTAATTGGCTTCATGAAGTATATCATGTGCATGTTGACGAGTTATATCGCGTGAAGCTGAAGCTGTAGCACTTAGTAGAAGTGGTTGTTTAGTAGACGATGAAGTATCATGTGCACGACCGTATGTACCAACGGCTTTGGCTAATAAACAAAACATATCGATCTCTTGAGCTGTTAATGAATGGGAAGGGGACCAAACTAACTCTTCATGTACTTCAGTTAATCGGACATCTTCTGATTTTGATTTTAGTAAACATTGTATCTCAGACTGATAATCTGATCCGATTCTCATTGAACCTCTATCTTCTTGAAGAGTTTTCAAAGTGGGATCATATATAAGTTTATAATAAAATGCCTCATCTCTGACTAGGTAATTTGTCAATGGTTCTGCATCATTGTGTAGTGTAACAGAGCATTTACCCCTAATATGTGTAGCTGGTAGACATTCAACTTGTCGTGAAAGAAACAATTCTCGATGTTTTAACTGATGCCTTTGTTGTTCAGTGATTGCAGTATTAGAGCGTTNTAAGCCTTCTTTGGAGTTATTATCATTATTATTTGAATTGGTTATTTCATTTGTACATTCTTCATCATAATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD199904             [      AAGATTTATGGCTTTATTCAAGTCGTAATTGGCTTCATGAAGTATATCATGTGCATGTTGACGAGTTATATCGCGTGAAGCTGAAGCTGTAGCACTTAGTAGAAGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD111610             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGGTTCTGCATCATTGTGTAGTGTAACAGAGCATTTACCCCTAATATGTGTAGCTGGTAGACATTCAACTTGTCGTGAAAGAAACAATTCTCGATGTTTTAACTGATGCCTTTGTTGTTCAGTGATTGCAGTATTAGAGCGTTTTAAGCCTTCTTTGGAGTTATTATCATTATTATTTGAATTGGTTATTTCATTTGTACATTCTTCATCATAATCATCATCACTGCCATAGTATTTCTCTGCCTGATTAATTAAAGCACTGGATACATCACGTCTACGGTAGTAACAGGCAACTTTAGCTTCAACAGCACCAGTGGGAGTTTTATTAAGTTCATCTATTCGACGGATTTGATATGGAGCAGTGGCTGATGATTCAAAATAAACGAAATCCCCGACTCTGTACATATTATTGGATGCCA                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD111086             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGGTTCTGCATCATTGTGTAGTGTAACAGAGCATTTACCCCTAATATGTGTAGCTGGTAGACATTCAACTTGTCGTGAAAGAAACAATTCTCGATGTTTTAACTGATGCCTTTGTTGTTCAGTGATTGCAGTATTAGAGCGTTTTAAGCCTTCTTTGGAGTTATTATCATTATTATTTGAATTGGTTATTTCATTTGTACATTCTTCATCATAATCATCATCACTGCCATAGTATTTCTCTGCCTGATTAATTAAAGCACTGGATACATCACGTCTACGGTAGTAACAGGCAACTTTAGCTTCAACAGCACCAGTGGGAGTTTTATTAAGTTCATCTATTCGACGGATTTGATATGGAGCAGTGGCTGATGATTCAAAATAAACGAAATCCCCGACTCTGTACATATTATTGGATGCCAT                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD130537             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTANCAGGCAACTTTAGCTTCAACAGCACCAGTGGGAGTTTTATTAAGTTCATCTATTCGACGGATTTGATATGGAGCAGTGGCTGATGATTCAAAATAAACGAAATCCCCGACTCTGTACATATTACTGGATGCCATTGGGATTCCGTCAGTTGTGTAAACGACAGCTATTTACAAGTACTCCACGAAGGATTCGAATAAACCCTGGAATTCAGAGGGATGCCAGATTTAGAAGTTGATAATCCAGTGCGCGAACGAACAGTTGATCCCTAATC]




>consensus_7228#0
TAATAAAAGATTTATGGCTTTATTCAAGTCGTAATTGGCTTCATGAAGTATATCATGTGC
ATGTTGACGAGTTATATCGCGTGAAGCTGAAGCTGTAGCACTTAGTAGAAGTGGTTGTTT
AGTAGACGATGAAGTATCATGTGCACGACCGTATGTACCAACGGCTTTGGCTAATAAACA
AAACATATCGATCTCTTGAGCTGTTAATGAATGGGAAGGGGACCAAACTAACTCTTCATG
TACTTCAGTTAATCGGACATCTTCTGATTTTGATTTTAGTAAACATTGTATCTCAGACTG
ATAATCTGATCCGATTCTCATTGAACCTCTATCTTCTTGAAGAGTTTTCAAAGTGGGATC
ATATATAAGTTTATAATAAAATGCCTCATCTCTGACTAGGTAATTTGTCAATGGTTCTGC
ATCATTGTGTAGTGTAACAGAGCATTTACCCCTAATATGTGTAGCTGGTAGACATTCAAC
TTGTCGTGAAAGAAACAATTCTCGATGTTTTAACTGATGCCTTTGTTGTTCAGTGATTGC
AGTATTAGAGCGTTTTAAGCCTTCTTTGGAGTTATTATCATTATTATTTGAATTGGTTAT
TTCATTTGTACATTCTTCATCATAATCATCATCACTGCCATAGTATTTCTCTGCCTGATT
AATTAAAGCACTGGATACATCACGTCTACGGTAGTAACAGGCAACTTTAGCTTCAACAGC
ACCAGTGGGAGTTTTATTAAGTTCATCTATTCGACGGATTTGATATGGAGCAGTGGCTGA
TGATTCAAAATAAACGAAATCCCCGACTCTGTACATATTATTGGATGCCATTGGGATTCC
GTCAGTTGTGTAAACGACAGCTATTTACAAGTACTCCACGAAGGATTCGAATAAACCCTG
GAATTCAGAGGGATGCCAGATTTAGAAGTTGATAATCCAGTGCGCGAACGAACAGTTGAT
CCCTAATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)