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Schistosoma mansoni
cluster # 7232 cluster # 7232       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7232#0 length = 563 sequences # 5  

consensusID : consensus_7232#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 563
fasta sequence
                              [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG-ATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATTT]

[+] EMBL CD201944             [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAG GCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATct]
[+] EMBL CD201873             [ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTCTGAGGAATTGTGGGATGACAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTAGCACCCCTCATTCTAAAATTCTTTGGAACGTGCCTAAAAATCCTAACATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD202144             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTACAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGCTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCGCATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGAAAATT ]
[-] EMBL CD145334             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCGCTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGGACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGAACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGTTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATAAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCTTTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGCAAATT ]
[-] EMBL CD145271             [ TCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTNTGTACCAATACTTGTGTTCAAATAATAATAACAGTAGTAA TTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTTCAATTAAACGCCGAGTTATTGCGCTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCTTTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGCCTTGGAACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGTTAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCTGATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACATCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACACGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCG ATGAATTTCTCTGGATATGCTTTCTCATATAGGCGAGTTGTAGTGAAGGCAAATT ]


>consensus_7232#0 ATCAAGTAACTTGTGTAGCGCATATTTATTCGGTGCCCCTTTGTACCAATACTTGTGTTC AAATAATAATAACAGTAGTAATTTTGAGGAATTGTGGGATGTCAAAGGTGTGTTCGATTT CAATTAAACGCCGAGTTATTGCACTGTTTAGAGCCGTTGCGCCCCTCATTCTCAAATTCT TTGGAACGTGCCTAGAAATCCTAACATGTACTCATCTTTCTGCTCTTCCAAGGTAGGTGC CTTGGCACATACATGTAAATTGGTAAATGTAGTCGGAGATACTGAGAAAAGAAGACCTGT TAGTTTTTGCTTTTTTGAGTGAATGAGCAGTTCGCTTAACATAATGTTGTCAGTCTTTCT GATGAATAAGCAACCTTCAACTCAGCATTTATCCTGTGGTTAATTATCCCAGTGATTACA TCTTTTTTGAAGTGCACATGTAAAAAGCAGGTTTTCTTTACCACTGTATCATATTTAACA CGTACATTGGTTTTGGCATACTTTTCGATGAATTTCTCTGGATATGCATTCTCATATAGG CGAGTTGTAGTGAAGGAAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)