Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7242 cluster # 7242       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7242#0 length = 869 sequences # 5  
consensusID : consensus_7242#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 869
fasta sequence 
                              [TGATACTATTATTGGAGCGTGTACCTTCTGAATTGAATATATCTAGTTCAACTGAACAATTGAATGAATCATGTAAAGATAATCATTCTTATGGATTAGATCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA-TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG-GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG-ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG-AATTTCATAATCAAC-TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTCTTTCATGAACCGTCTTTGAATTTTTTAACACAGACATTAATAGAATGATGTTAGCGTGAATGGGATAATTTTTTAATTTATCCCAAGTAAATATCATTGAATCAATTTGTCCGTTAAATTTTAATTGGATTTGTGCATTTAATTTATTTTTACCTTTGTGCCTTCCTTTTTTGGTAGATTTATCTTTAATTTAATTATACATTGTGATTTCAGTTTGAATATTTATGCTTATTAAAAAAAAAG]

[+] EMBL CD083076             [TGATACTATTATTGGAGCGTGTACCTTCTGAATTGAATATATCTAGTTCAACTGAACAATTGAATGAATCATGTAAAGATAATCATTCTTATGGATTAGATCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD179033             [                                                                                                    TCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTCT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD110993             [                                                                                                                                                         TTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCC TACTTGTACTTCGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AW587532             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTAATTTGTTCCAGCTACAATATCTACATGCCTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAGTAATTTCATAATCAACGTAAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD076650             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGGTCAACNNNGTAT GCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTTTTTCATGAACCGTCTTTGAATTTTTTAACACAGACATTAATAGAATGATGTTAGCGTGAATGGGATAATTTTTTAATTTATCCCAAGTAAATATCATTGAATCAATTTGTCCGTTAAATTTTAATTGGATTTGTGCATTTAATTTATTTTTACCTTTGTGCCTTCCTTTTTTGGTAGATTTATCTTTAATTTAATTATACATTGTGATTTCAGTTTGAATATTTATGCTTATTAAAAAAAAAG]




>consensus_7242#0
TGATACTATTATTGGAGCGTGTACCTTCTGAATTGAATATATCTAGTTCAACTGAACAAT
TGAATGAATCATGTAAAGATAATCATTCTTATGGATTAGATCATGTACTACAAGATTTGA
TTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATA
TTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAAT
GTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTT
GCCCATTAATTGTTCCAGCTACAATATCTACATGGTATGATACAATGATGACTGAATCGA
TATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCGAT
GGCATTTTTTAACAAATTCAGAATTTCATAATCAACTTAGTAATTATTTGTTATAAGTTA
TTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATC
CTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGT
ACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTCTTTCATGAACCGTCTTTGAATTTTTTAACACAGA
CATTAATAGAATGATGTTAGCGTGAATGGGATAATTTTTTAATTTATCCCAAGTAAATAT
CATTGAATCAATTTGTCCGTTAAATTTTAATTGGATTTGTGCATTTAATTTATTTTTACC
TTTGTGCCTTCCTTTTTTGGTAGATTTATCTTTAATTTAATTATACATTGTGATTTCAGT
TTGAATATTTATGCTTATTAAAAAAAAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)