These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7247#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 948 fasta sequence [CTTTGTGTTAAATTTCTAAGGTCCTATAAGCAACGTAACTTTATGACATTACCGAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAATTGGGGTCACAGTACATCACAAAATATTTGCTAGCCTGTCGTTTTCAAAGGACTGAGCAGCAATTTATTCAATCCGGTGTCAAGTGCTACCGTTCTCGCAGTTCGAAAAAGGCTATTGTTATTCATTAATAAGGTGACTTCCCCTATATATAAAAAACCACTAGTTGCAGTTTGCTATTACCAATGTCGTACTTGATACTGTACATGTTAGGTCTTCCCAAATCGTCTGTACTACCCAACTTGTTTTATTAGGTAATCGTTAATCCAGAAAGCTTTTAGTTGCGCTTAAAACTCTGGATCACGACTCCCTTGATATTTAGTCAGACAGAATTTCCTTTATGTTATATTTTATCCCTTCGATGATATTCACTTATTTTGGCAGGCTACTAATAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCCAGAAAAAAAATTAGTGTAGCAACGTATTGTCTATTAGTTTCCAGTTATTGTTATCGCTTTATGAAGTCTTTGCTC] [-] EMBL CD098174 [CTTTGTGTTAAATTTCTAAGGTCCTATAAGCAACGTAACTTTATGACATTACCGAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTACCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAA ] [+] EMBL CD167257 [ ccAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTAGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAA ] [+] EMBL CD167370 [ AAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTGTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACAT ] [+] EMBL CD081321 [ gGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAATTGGGGTCACAGTACATCACAAAATATTTGCTAGCCTGTCGTTTTCAAAGGACTGAGCAGCAATTTATTCAATCCGGTGTCAAGTGCTACCGTTCTCGCAGTTCGAAAAAGGCTATTGTTATTCATTAATAAGGTGACTTCCCCTATATATAAAAAACCACTAGTTGCAGTTTGCTATTACCAATGTCGTACTTGATACTGTACATGTTAGGTCTTCCCAAATCGTCTGTACTACCCAACTTGTTTTATTAGGTAATCGTTAATCCAGAAAGCTTTTAGTTGCGCTTAAAACTCTGGATCACGACTCCCTTGATATTTAGTCAGACAGAATTTCCTTTATGTTATATTTTATCCCTTCGATGATATTCACTTATTTTGGCAGGCTACTAATAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCCAGAAAAAAAATTAGTGT ] [+] EMBL CD068073 [ TCGATGATATTCACTTATTTT GCA GCTACTANTAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCAAGAAAAAAAATTAGTGTAGCAACGTATTGTCTATTAGTTTCCAGTTATTGTTATCGCTTTATGAAGTCTTTGCTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||