These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7250#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1119 fasta sequence [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATCCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTAGACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGTGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTTTCAAACTTATCTCTGGCCTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCATTAATGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTGACTGTAATTGATCATTTTTATTCATTGTATAACTGTTACTCGTAAAATTTCGCTGATCCTCTTGTAAATCGTTTTGCCCAAATTGTTCTTCCATAGCCAATAACCATGCTAACGTAGTTTCAATTACTGTACCAAAATGATCAGGATCAGGTAGACGATTTATATCACCTGATTCGTCATCTGAATCACCTTCAATTTCATCATCAAGCCAAGAAGTTTCCGACGTACTACATGTTGATGTTGGTGAACATCGACTTTCAACTATGACATTTGGNTCTTCATTTGACTGTCCATGAATCATAGCAGCTGNTTGTATTTCGAGAATACCCTCAGAACGACGCTTCCTATCTCTTTCNACNNNGCTTACGTATTTCTAGAGATAACAGCNAGTGATCTAGCATCAATATTCTCAGGACGCATATCCACTGGNTCCAGTAGTCTTGGN] [-] EMBL CD202214 [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATCCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTA ] [-] EMBL CD153356 [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATTCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTA ] [+] EMBL CD156520 [ ATTCTCTTCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGATTTGACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTAGACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGTGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTTTCAAACTTATCTCTGGCCTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCATTAATGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTG ] [+] EMBL CD196066 [ ATTAAACGATTACCAAGACGTACACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGAGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTGTCAAACTTATCTCTGGACTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCAT ] [+] EMBL CD181453 [ TGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTGACTGTAATTGATCATTTTTATTCATTGTATAACTGTTACTCGTAAAATTTCGCTGATCCTCTTGTAAATCGTTTTGCCCAAATTGTTCTTCCATAGCCAATAACCATGCTAACGTAGTTTCAATTACTGTACCAAAATGATCAGGATCAGGTAGACGATTTATATCACCTGATTCGTCATCTGAATCACCTTCAATTTCATCATCAAGCCAAGAAGTTTCCGACGTACTACATGTTGATGTTGGTGAACATCGACTTTCAACTATGACATTTGGNTCTTCATTTGACTGTCCATGAATCATAGCAGCTGNTTGTATTTCGAGAATACCCTCAGAACGACGCTTCCTATCTCTTTCNACNNNGCTTACGTATTTCTAGAGATAACAGCNAGTGATCTAGCATCAATATTCTCAGGACGCATATCCACTGGNTCCAGTAGTCTTGGN] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||