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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7258#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 970 fasta sequence
[AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTGGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA-TTCGC--TGATGCTGAAG-AGGAAGAAAAACGCATG-GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG]
[+] EMBL BF936679 [AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTG ]
[-] EMBL CD181812 [ cgactgacGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTTTAGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCAT ]
[-] EMBL CD114065 [ GGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACANAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAGCCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGT GGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGT GGATTGGATAAAGAATTTTCCGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACG AATGTTTCCT CCAGCAGTTGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TT ]
[-] EMBL CD180779 [ AACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACGTGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TTCGC TGATGCTGAAG AGGAAGAAAAACGCATG GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAG ]
[+] EMBL CD092923 [ CGTAAATTATTTCGCNNTGATGCTGAAGAAGGAAGAAAAACGCATGNGGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||