cluster # 7266

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Schistosoma mansoni
cluster # 7266 cluster # 7266 Sequences # 5 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7266#0 length = 718 sequences # 3

consensus_7266#1 length = 657 sequences # 1
consensus_7266#2 length = 352 sequences # 1

consensusID : consensus_7266#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 718
fasta sequence

                              [ATTACACCGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAAGGATGAATAACAACTGGAAAGAATTGGAAAGGATCGGCCAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTGGTGGGTAGCCTATGCTCCTCGACGAGGGGTAACAGGCATAAGTAAGTACTGTGAATTGTTATCAATATTCTTAATACGTTAAAGTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAACATCATCTGACTAGCACAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTAGTGATTAATGTGGTCAACTTCTATTCAGTAAGTTTCAGATTCCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAGGCAACGACATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCAAGTAAGTTGAGTAAATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAATAGTAGCTCAAGCCTAAACGACAAACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATTGTGATTTTGATTGAGTTATATTCAGTGGGCTANGTGTGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTCCAG-AGACATCATCAGAACAAACTTCAGAAGGAAGTTAGCTACTTGGATTTATCCAAATATGACTAGCAGTTCGTTATGTCGACCTTGA-TAAATACTGTTCATCCCTATTTNG-CATCGCCTGCATGTN]

[+] EMBL CD202128             [ATTACACCGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAAGGATGAATAACAACTGGAAAGAATTGGAAAGGATCGGCCAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTGGTGGGTAGCCTATGCTCCTCGACGAGGGGTAACAGGCATAAGTAAGTACTGTGAATTGTTATCAATATTCTTAATACGTTAAAGTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAACATCATCTGACTAGCACAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTAGTGATTAATGTGGTCAACTTCTATTCAGTAAGTTTCAGATTCCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAGGCAACGACATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCAAGTAAGTTGAGTAAATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAATAGTAGCTCAAGCCTAAACGACANACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATTGTGATTTTGATTGAGTTATATTCAGTGGGCTANGTGTGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTCCAG AGACATCATCAGAAC AACTTCAGAAGG AGGTAGCTACTTGGGATTATC  AATATGACTAGCAAGTCGTTATGTCGACCTTGA TAAATACTGTTCATCCCTATTTNG CATCGCCTGCATGT ]
[+] EMBL CD066997             [                                                                                    ATGGAGAATGCTGGTGGGTAGCCTATGCTCCTCGACGAGGGGTAACAGGCATAAGTAAGTACTGTGAATTGTTATCAATATTCTTAATACGTTAAAGTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAACATCATCTGACTAGCACAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTAGTGATTAATGTGGCCAACTTCTATTCAGTAAGTTTCAGATTCCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAGGCAACGACATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCAAGTAAGTTGAGTAAATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAGTAGTAGCTCAAGCCTAAACGACAAACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATCGTGATTTTGATTGAGTTATATTCAGTGGGCTACGTGCGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTTCAA AGAAATCATCAAAACAAACTTTAGAAGGAAGTTGGCTACTTGGATTTATCCAAATATGACTAACAGTTCG TATTTCCAACTTGA Tta                                     ]
[+] EMBL CD145327             [                                                                                                                                                                           TACGTTAAAGTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAACATCATCTGACTAGCACAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTAGTGATTAATGTGGTCATCTTTTATTCATGAAGTATCAGATTCCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAGGCAACGACATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCAAGTAAGTTGAGTAAATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAATAGTAGCTCAAGCCTAAACGACAAACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATTGTGATTTTGATTGAGTTATATTCAGTGGGCTAGGTGTGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTCCAGAAGACATCATCAGAACAAACTTCAGAAGGAAGTTAGCTACTTGGATTTATCCAAATATGACTAGCAGTTCGTTATGTCGACCTTGATTAAATACTGTTCATCCCTATTTTGTCATCGCCTGCATGTN]




>consensus_7266#0
ATTACACCGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAAGGATGAATAACAACTGGAAAGAATTGGA
AAGGATCGGCCAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTGGTGGGTAGCCTATGCTCCTCGAC
GAGGGGTAACAGGCATAAGTAAGTACTGTGAATTGTTATCAATATTCTTAATACGTTAAA
GTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAAC
ATCATCTGACTAGCACAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTAGTGATTAATGTGGTCAAC
TTCTATTCAGTAAGTTTCAGATTCCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAGGCAACGAC
ATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCAAGTAAGTT
GAGTAAATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAATAGTAGCTCAAGCCTAAACGACAA
ACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATTGTGATTTTGATTGAGTTATATTCAGTG
GGCTANGTGTGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTCCAGAGACAT
CATCAGAACAAACTTCAGAAGGAAGTTAGCTACTTGGATTTATCCAAATATGACTAGCAG
TTCGTTATGTCGACCTTGATAAATACTGTTCATCCCTATTTNGCATCGCCTGCATGTN

consensusID : consensus_7266#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 657
fasta sequence

                              [AATCCTTTTCAGTTCCTTCCAGTTGTTATTCATCCTTTTCATATCTGCTTCTATTTTCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCCTTCCACTTTTCCGCTTCCCTTCTGGATTCCAAGTTAGGGTTTGACTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTATTGTATGTCCTATCCACTTCCAACGTCTTTTCCTAATTTCCTTTTCAGCTGGAAACTGGTTTGTCCTCTCCCATAAAACGCTGTTACTGATAGTATCCGGCCAGTGAATGTTGAGTATTTTGCGTAAACAGCTGTTTATTAATATTTGTATCTTCTTGACGATGGATGTAGTAGTTCTCCACATTATAAAATTAACAGTTTGGATATGGAATTCATGATGATGATGTATATCATCATATTTACTACTATGTTGTACTATTAAAGTATAATTTGGACAATTCAACTGTTTGTATATATAATGCTTGCTTGTTTGGTAATTGTTATGCTATGAATACCGTATTAAACATGTTATTATAATGAACGAGAACAGAAGTGGGGTACGATTGATGTATTTGAACTTTAAATACANACGTCTTAGTCAAATCANAGATCCCAGCCATAAATACTTCCAATGTCCTTNCATTTCTATACCCCAATCACTACTATTCTGGTCTTNCCTTTTCGA]

[+] EMBL CD188678             [AATCCTTTTCAGTTCCTTCCAGTTGTTATTCATCCTTTTCATATCTGCTTCTATTTTCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCCTTCCACTTTTCCGCTTCCCTTCTGGATTCCAAGTTAGGGTTTGACTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTATTGTATGTCCTATCCACTTCCAACGTCTTTTCCTAATTTCCTTTTCAGCTGGAAACTGGTTTGTCCTCTCCCATAAAACGCTGTTACTGATAGTATCCGGCCAGTGAATGTTGAGTATTTTGCGTAAACAGCTGTTTATTAATATTTGTATCTTCTTGACGATGGATGTAGTAGTTCTCCACATTATAAAATTAACAGTTTGGATATGGAATTCATGATGATGATGTATATCATCATATTTACTACTATGTTGTACTATTAAAGTATAATTTGGACAATTCAACTGTTTGTATATATAATGCTTGCTTGTTTGGTAATTGTTATGCTATGAATACCGTATTAAACATGTTATTATAATGAACGAGAACAGAAGTGGGGTACGATTGATGTATTTGAACTTTAAATACANACGTCTTAGTCAAATCANAGATCCCAGCCATAAATACTTCCAATGTCCTTNCATTTCTATACCCCAATCACTACTATTCTGGTCTTNCCTTTTCGA]




>consensus_7266#1
AATCCTTTTCAGTTCCTTCCAGTTGTTATTCATCCTTTTCATATCTGCTTCTATTTTCCG
GCGTAATGTGTTCTTTGGCCTTCCACTTTTCCGCTTCCCTTCTGGATTCCAAGTTAGGGT
TTGACTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTATTGTATGTCCTATCCACTTCCAACGTCT
TTTCCTAATTTCCTTTTCAGCTGGAAACTGGTTTGTCCTCTCCCATAAAACGCTGTTACT
GATAGTATCCGGCCAGTGAATGTTGAGTATTTTGCGTAAACAGCTGTTTATTAATATTTG
TATCTTCTTGACGATGGATGTAGTAGTTCTCCACATTATAAAATTAACAGTTTGGATATG
GAATTCATGATGATGATGTATATCATCATATTTACTACTATGTTGTACTATTAAAGTATA
ATTTGGACAATTCAACTGTTTGTATATATAATGCTTGCTTGTTTGGTAATTGTTATGCTA
TGAATACCGTATTAAACATGTTATTATAATGAACGAGAACAGAAGTGGGGTACGATTGAT
GTATTTGAACTTTAAATACANACGTCTTAGTCAAATCANAGATCCCAGCCATAAATACTT
CCAATGTCCTTNCATTTCTATACCCCAATCACTACTATTCTGGTCTTNCCTTTTCGA

consensusID : consensus_7266#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 352
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTTTTTTTTGCAACTTGATATATTTAACGCATATGGTGCATAATTTATTGATAAGAAAGTTTAGATAAACAATTAAAGTAATGGCATATTATAATTACGGGGTTTACCTTTCTTTTCTTTCCTTTTGAATTGTTCAAATGACACTAAGTACCATGTTCTGGATGAATGTAAGTGTTTATAGATAAGTGTATATGTATATATAAGTGTGTATGTGTGTTTGTATGGAACCTGGTGAATTTGGTGCATTAGTTGCTAGAGTATAGGAACCAATGACGATTTGATGTCTATTGTTTACATACATATATATATATATTTATTTACTTCCTTAATTATATATATGAGCAA]

[+] EMBL AI395838             [TTTTTTTTTTTTTTTTGCAACTTGATATATTTAACGCATATGGTGCATAATTTATTGATAAGAAAGTTTAGATAAACAATTAAAGTAATGGCATATTATAATTACGGGGTTTACCTTTCTTTTCTTTCCTTTTGAATTGTTCAAATGACACTAAGTACCATGTTCTGGATGAATGTAAGTGTTTATAGATAAGTGTATATGTATATATAAGTGTGTATGTGTGTTTGTATGGAACCTGGTGAATTTGGTGCATTAGTTGCTAGAGTATAGGAACCAATGACGATTTGATGTCTATTGTTTACATACATATATATATATATTTATTTACTTCCTTAATTATATATATGAGCAA]




>consensus_7266#2
TTTTTTTTTTTTTTTTGCAACTTGATATATTTAACGCATATGGTGCATAATTTATTGATA
AGAAAGTTTAGATAAACAATTAAAGTAATGGCATATTATAATTACGGGGTTTACCTTTCT
TTTCTTTCCTTTTGAATTGTTCAAATGACACTAAGTACCATGTTCTGGATGAATGTAAGT
GTTTATAGATAAGTGTATATGTATATATAAGTGTGTATGTGTGTTTGTATGGAACCTGGT
GAATTTGGTGCATTAGTTGCTAGAGTATAGGAACCAATGACGATTTGATGTCTATTGTTT
ACATACATATATATATATATTTATTTACTTCCTTAATTATATATATGAGCAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7266#0      ATTACACCGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAAGGATGAATAACAACTGGAAAGAATTGGA 60
consensus_7266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7266#1      --------------------AATCCTTTTCAGTTCCTTCCAGTTGTTATTCATCCTTTTC 40
                                                                                  

consensus_7266#0      AAGGATCGGCCAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTGGTGGGTAGCCTATGCTCCTCGAC 120
consensus_7266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7266#1      ATATCTGCTTCTATTTTCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCCTTCCACTTTTCCGCTTCCCT 100
                                                                                  

consensus_7266#0      GAGGGGTAACAGGCATAAGTAAGTACTGTGAATTGTTATCAATATTCTTAATACGTTAAA 180
consensus_7266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7266#1      TCTGGATTCCAAGTTAGGGTTTGACTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTATTGTATGT 160
                                                                                  

consensus_7266#0      GTCTCAAATATAAAATTTCACTTTGAAATTCAACTGATCTCTTCTGAACATTAGTCCAAC 240
consensus_7266#2      --------TTTTTTTTTTTTTTTTGCAACTTGAT--ATATTTAACGCATAT-GGTGCATA 49
consensus_7266#1      CCTATCCACTTCCAACGTCTTTTCCTAATTTCCT---TTTCAGCTGGAAACTGGTTTGTC 217
                                *      *   **   ** *       * *     * * *   **     

consensus_7266#0      ATCATCTGACTAGCA----CAACTAATAAAATGGAGTAGTAGCTTA--GTGATTAATGTG 294
consensus_7266#2      ATTTATTGATAAGAAAGTTTAGATAAACAATTAAAGTAATGGCATATTATAATTACGGGG 109
consensus_7266#1      CTCTCCC-ATAAAACGCTGTTACTGATAGTATCCGGCCAGTGAATGT--TGAGTATTTTG 274
                       *      *  *           * *     *   *     *  *    * * **    *

consensus_7266#0      -GTCAACTTCTATTCAGTAAGTTTCAGATT-CCAACTCTGCTCCACCTATCTTGGATCAG 352
consensus_7266#2      -TTTACCTTTCTTTTCTTTCCTTTTGAATTGTTCAAATGACACTAAGTACCATGTTCTGG 168
consensus_7266#1      CGTAAACAGCTGTTTATTAATATTTGTATCTTC---TTGACGATGGATGTAGTAGTTCT- 330
                        * * *     **   *    **   **           *      *    *       

consensus_7266#0      GCAACGACATAGTATCACTAGACCTAGCTTGGATTTCAATGGACTAATCTGTACTTTGCA 412
consensus_7266#2      ATGAATGTA-AGTGTTTATAGATAAG---TGTATATGTATATATAAGTGTGTA-TGTGTG 223
consensus_7266#1      -CCACATTATAAAATTAACAGTTTGGATATGGAATTCATGATGATGATGTATATCATCAT 389
                         *    * *   *    **        ** *  *           * * **   *   

consensus_7266#0      AGTAAGTTGAGTA-AATAAAACAAATACAGTAATCAGATTGAGAATAGTAGCTCAAGCCT 471
consensus_7266#2      TTTGTATGGAACCTGGTGAATTTGGTGCATTAGTT-GCTAGAGTATAGGAACCAATGACG 282
consensus_7266#1      ATTTACTACTATGTTGTACTATTAAAGTA-TAATT---TGGACAATTCAACTGTTTGTAT 445
                        *   *         *           * ** *    * **  **   *      *   

consensus_7266#0      AAACGACAAACCAATTCATTTGCGAATAGTTGGAGAATTATTGTGATTTTGATTGAGTTA 531
consensus_7266#2      ATTTGATG--TCTATT-GTTTACATACATATATATATATATTTATTTACTTCCTTAATTA 339
consensus_7266#1      ATATAATG--CTTGCTTGTTTGGTAATTGTTATGCTATGAATACCGTATTAAACATGTTA 503
                      *    *         *  ***    *    *        * *    *  *       ***

consensus_7266#0      TATTCAGTGGGCTANGTGTGCGTGGGTGGGTTCTAATGTGAAACTTTCATCGATGTTTTC 591
consensus_7266#2      TATATA-TGAGCAA---------------------------------------------- 352
consensus_7266#1      T-TATAATGAACGAGA---ACAGAAGTGGGGTACGATTGATGTATTTGAACTTTAAATAC 559
                      * *  * **  * *                                              

consensus_7266#0      CAGAGACATCATCAGAACAAACTTCAGAAGGAAGTTAGCTACTTGGATTTATCCAAATAT 651
consensus_7266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7266#1      ANACGTCTTAGTCAAATCANAGATCCCAGCCA---TAAATACTTCCAAT-GTCCTTNCAT 615
                                                                                  

consensus_7266#0      GACTAGCAGTTCGTTATGTCGACCTTGATAAATACTGTTCATCCCTATTTNGCATCGCCT 711
consensus_7266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7266#1      TTCTATACCCCAATCACTACTATTCTGGTCTTNCCTTTTCGA------------------ 657
                                                                                  

consensus_7266#0      GCATGTN 718
consensus_7266#2      -------
consensus_7266#1      -------