cluster # 7280

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Schistosoma mansoni
cluster # 7280 cluster # 7280 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7280#0 length = 827 sequences # 5
consensusID : consensus_7280#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 827
fasta sequence
                              [GTGTACGAAGACTAAATTCTTTAACTATCCTCTACAAACGTTTTTTCATGTCCTCTTGGACTCTCATGTACAAACTTTGGATCATGTAACTTTAGCTTGTCGTGCTGCTCGTGTAGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT-CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT-CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATCCAATAAGAGAATAGA]

[+] EMBL CD082306             [GTGTACGAAGACTAAATTCTTTAACTATCCTCTACAAACGTTTTTTCATGTCCTCTTGGACTCTCATGTACAAACTTTGGATCATGTAACTTTAGCTTGTCGTGCTGCTCGTGTAGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCTCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTNTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTNNTCTTTGNTNCTATGGCTATGCACACACATACACACATTTNCTTTCTGTACAGATTTATTNTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCNTCCANNTAGAGAt    ]
[+] EMBL CD078812             [                                                                                                                  AGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGGTTCTATGGCTATGCACACACAT                                                                                 ]
[-] EMBL CD073272             [                                                                                                                                                                                                                                       TGGTANTAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATACAATAAGAGAAT   ]
[-] EMBL CD075908             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCTCCCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCCCAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCTCTCTTTTTCCCAGTTTTTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACCCAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATCCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATCCAATAAGAGAAT   ]
[-] EMBL AI975157             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGTTTATATGAGTTGTGNGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCGTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATACAATAAGAGAATAGA]




>consensus_7280#0
GTGTACGAAGACTAAATTCTTTAACTATCCTCTACAAACGTTTTTTCATGTCCTCTTGGA
CTCTCATGTACAAACTTTGGATCATGTAACTTTAGCTTGTCGTGCTGCTCGTGTAGCAAA
TCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATT
ATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAG
GGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTT
CACCTCCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAA
TGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATT
ATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTT
CTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACAT
GTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATT
TATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGT
TTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTC
TTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTTCTTTCTGTACAGATTTATTTTTA
AAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATCCAATAAGAGAATAGA
clustalw multiple alignements is not computed in this case