Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7282 cluster # 7282       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7282#0 length = 1024 sequences # 5  
consensusID : consensus_7282#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1024
fasta sequence 
                              [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC-TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT]

[+] EMBL CD178224             [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTNTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD096653             [                                                                                                                                                                                          TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTAC TTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTCTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTC                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD147242             [                                                                                                                                                                                          TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       nACCTANTTAACATTTCAATGTAACTGTCAAC TGTCCNTACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTTTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCAC                                                                                                ]
[+] EMBL SM778                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          nTCAAATTTNGTCCGATTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATCATCCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATATAGACTATNNTACACACAGATTAAACGTATTCACTTNCAATAACTAGGCAAAAATATTNGAGAGAGANTCTTTACCACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT]




>consensus_7282#0
CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGG
ATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCAT
CTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGT
TGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACT
ATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTT
TTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTT
TACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAAT
TTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCCTAC
ATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTT
TAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACT
AGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACA
CATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAAT
TTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTA
CGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAG
CCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAA
TATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACAC
NATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGG
NTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)