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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7285#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 612 fasta sequence
[ACAGAATCAATATTATTACCAGATTCATTTTCTTCTGACACAACATCAGCTGTACATGGGTATTCATCAAGACTGCCACCAAATACAATAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA-G-CGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG-TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATCAGTGGACTGTGCAAAAGTTGTGTTGGAGTAAGTGTGAATGTACCCAAACTATTATTAATTCATTGAATAAATTGTATGAACAAAACGAAGAANAAAATCAGAGTAAACCTCAACAAATATTACATTTAAAATGCGANCATAAAT]
[-] EMBL CD114323 [ACAGAATCAATATTATTACCAGATTCATTTTCTTCTGACACAACATCAGCTGTACATGGGTATTCATCAAGACTGCCACCAAATACAATAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTCCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGA ]
[+] EMBL CD193222 [ tcTTCATCAAGACTGCCACCAAATACACTAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA G CGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATCAGTGGACTGTGCAAAAGTTGTGTTGGAGTAAGTGTGAATGTACCCAAACTATTATTAATTCATTGAATAAATTGTATGAACAAAACGAAGAANAAAATCAGAGTAAACCTCAACAAATATTACATTTAAAATGCGANCATAAAT]
[-] EMBL CD167361 [ AAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTACGACGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTAGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTGCTACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATC GTGGA ]
[-] EMBL CD181997 [ GACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA G CG ]
[-] EMBL CD167449 [ TTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATTTCAGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||