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Schistosoma mansoni
cluster # 7293 cluster # 7293       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7293#0 length = 1189 sequences # 5  

consensusID : consensus_7293#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1189
fasta sequence
                              [TATCGGGAAGTACGGCAATCTTTAATTGATATGTCGACTATGTTTGGACTATTGGAACTTGTTCCAACAGTTCGTTCCTTACCGAATGCACCAAATATACACATTGATCGCTCTAATTCATCTGTAGAATTTCGTGATGTGAAATTCACTTATTACTCCAAAGACCCTAAAGATTCTTTATTAAAACCTGGGAAATTCTTATATGATGGATTAAGTTTTAAGGTTGAACCTGGTCAACGTGTAGCTATTGTTGGTGAGAGTGGTACCGGAAAATCTACAATTGTTCGATTAGTTTATCGATTTTTTGATGTATCTGGTGGTAGTGTACTAGTTGGTGGTCAAGATGTTCGGTCAGTGAATTTGGAAAGTTTACGTCATGCAATAGCAGTGATACCACAGGATACGGTTTTGTTCCATAATACTATATTTTATAATCTCCAATACGGCAACTTGAAAGCAACTCCGGAGGAAGTTTACGAAGCCGCTCGTTTATCGAATATAGCCAATGCAATTGAACGTATGCCACATGGATACGATACACAAGTCGGAGAACGTGGTTTGAAATTGAGCGGTGGTGAAAAACAACGAATAGCGATTGCTAGAGCTCTACTGAAGAAAGCTCCAATTTTGATTTACGACGAAGCAACGTCATCGTTAGATTCAATCACTGAACATACTATTCTTCAACGATTAGCGGAAGTTACACCTGGCGTTACATCGCTTATAATCGCTCACCGTTTAAGCACAATAATTGATGCTGATGAAATCTTAGTCTTACGAAATGGTCATGTATCTGAACGTGGTACGCACTCTAGTTTATTATCGCAACCGGATTCATATTATCGACAACTTTGGAATCAACAACGAAGTGGAATCTTACCTACTACTATTACTAGTACTACTAATTTTGATAATAATAACAACAATGATTGTCATAAAATATCCAGTTCAGACAGTCAACAAACAAACACCTAAGGCACTACGTATAAATATAATGGATTAAGCTTTTCTTGAATTATGAATGTCTACACTTGTTCGATAGTTTCAGTTTTATCATTTTCTATCTGTTTTACTGACTTTTTTATACTTGAGCAGAATTCTTTTATCTTATGTTGTGTTTTCTGTTTATGCTAGATGAATAGTTAACANATTACTTAACGTATTTAATTTGTTTTCGTGGTTGTTACAT]

[+] EMBL CD187244             [TATCGGGAAGTACGGCAATCTTTAATTGATATGTCGACTATGTTTGGACTATTGGAACTTGTTCCAACAGTTCGTTCCTTACCGAATGCACCAAATATACACATTGATCGCTCTAATTCATCTGTAGAATTTCGTGATGTGAAATTCACTTATTACTCCAAAGACCCTAAAGATTCTTTATTAAAACCTGGGAAATTCTTATATGATGGATTAAGTTTTAAGGTTGAACCTGGTCAACGTGTAGCTATTGTTGGTGAGAGTGGTACCGGAAAATCTACAATTGTTCGATTAGTTTATCGATTTTTTGATGTATCTGGTGGTAGTGTACTAGTTGGTGGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD126562             [                                                                                                                                                                            ATTCTTTATTAAAACCTGGGAAATTCTTATATGATGGATTAAGTTTTAAGGTTGAACCTGGTCAACGTGTAGCTATTGTTGGTGAGAGTGGTACCGGAAAATCTACAATTGTTCGATTAGTTTATCGATTTTTTGATGTATCTGGTGGTAGTGTACTAGTTGGTGGTCAAGATGTTCGGTCAGTGAATTTGGAAAGTTTACGTCATGCAATAGCAGTGATACCACAGGATACGGTTTTGTTCCATAATACTATATTTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD128089             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCGGTCAGTGAATTTGGAAAGTTTGCGTCATGCAATAGCAGTGATACCACAGGATACGGTTTTGTTCCATAATACTATATTTTATAATCTCCAATACGGCAACTTGAAAGCAACTCCGGAGGAAGTTTACGAAGCCGCTCGTTTATCGAATATAGCCAATGCAATTGAACGTATGCCACATGGATACGATACACAAGTCGGAGAACGTGGTTTGAAATTGAGCGGTGGTGAAAAACAACGAATAGCGATTGCTAGAGCTCTACTGAAGAAAGCTCCAATTTTGATTTACGACGAAGCAACGTCATCGTTAGATTCAATCACTGAACATACTATTCTTCAACGATTAGCGGAAGTTACACCTGGCGTTACATCGCTTATAATCGCTCACCGTTTAAGCACAATAATTGATGCTGATGAAATCTTAGTCTTACGAAATGGTCATGTATCTGATCGTGGTACGCACTCTAGTTTATTATCGCAACCGGATTCATATTATCGACAACTTAGGAATCAACAACGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD131553             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAACGTCATCGTTAGATTCAATCACTGAACATACTATTCTTCAACGATTAGCGGAAGTTACACCTGGCGTTACATCGCTTATAATCGCTCACCGTTTAAGCACAATAATTGATGCTGATGAAATCTTAGTCTTACGAAATGGTCATGTATCTGAACGTGGTACGCACTCTAGTTTATTATCGCAACCGGATTCATATTATCGACAACTTTGGAATCAACAACGAAGTGGAATCTTACCTACTACTATTACTAGTACTACTAATTTTGATAATAATAACAACAATGATTGTCATAAAATATCCAGTTCAGACAGTCAACAAACAAACACCTAAGGCACTACGTATAAATATAATGGATTAAGCTTTTCTTGAATTATGAATGTCTACACTTGTTCGATAGTTTCAGTTTTATCATTTTCTATCTGTTTTACTGACTTTTTTATACTTGAGCAGAATTCTTTTATCTTATGTTGTGTTTTCTGTTTATGCTAGATGAATAGTTAACANATTACTTAACGTATTTAATTTGTTTTCGTGGTTGTTACAT]
[+] EMBL CD131338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAACGTCATCGTTAGATTCAATCACTGAACATACTATTCTTCAACGATTAGCGGAAGTTACACCTGGCGTTACATCGCTTATAATCGCTCACCGTTTAAGCACAATAATTGATGCTGATGAAATCTTAGTCTTACGAAATGGTCATGTATCTGAACGTGGTACGCACTCTAGTTTATTATCGCAACCGGATTCATATTATCGACAACTTTGGAATCAACAACGAAGTGGAATCTTACCTACTACTATTACTAGTACTACTAATTTTGATAATAATAACAACAATGATTGTCATAAAATATCCAGTTCAGACAGTCAACAAACAAACACCTAAGGCACTACGTATAAATATAATGGATTAAGCTTTTCTTGAATTATGAATGTCTACACTTGTTCGATAGTTTCAGTTTTATCATTTTCTATCTGTTTTACTGACTTTTTTATACTTGAGCAGAATTCTTTTATCTTATGTTGTGTTTTCTGTTTATGCTAGATGAATAGTTAACANATTACTTAACGTATTTAATTTGTTTTCGTGGTT       ]


>consensus_7293#0 TATCGGGAAGTACGGCAATCTTTAATTGATATGTCGACTATGTTTGGACTATTGGAACTT GTTCCAACAGTTCGTTCCTTACCGAATGCACCAAATATACACATTGATCGCTCTAATTCA TCTGTAGAATTTCGTGATGTGAAATTCACTTATTACTCCAAAGACCCTAAAGATTCTTTA TTAAAACCTGGGAAATTCTTATATGATGGATTAAGTTTTAAGGTTGAACCTGGTCAACGT GTAGCTATTGTTGGTGAGAGTGGTACCGGAAAATCTACAATTGTTCGATTAGTTTATCGA TTTTTTGATGTATCTGGTGGTAGTGTACTAGTTGGTGGTCAAGATGTTCGGTCAGTGAAT TTGGAAAGTTTACGTCATGCAATAGCAGTGATACCACAGGATACGGTTTTGTTCCATAAT ACTATATTTTATAATCTCCAATACGGCAACTTGAAAGCAACTCCGGAGGAAGTTTACGAA GCCGCTCGTTTATCGAATATAGCCAATGCAATTGAACGTATGCCACATGGATACGATACA CAAGTCGGAGAACGTGGTTTGAAATTGAGCGGTGGTGAAAAACAACGAATAGCGATTGCT AGAGCTCTACTGAAGAAAGCTCCAATTTTGATTTACGACGAAGCAACGTCATCGTTAGAT TCAATCACTGAACATACTATTCTTCAACGATTAGCGGAAGTTACACCTGGCGTTACATCG CTTATAATCGCTCACCGTTTAAGCACAATAATTGATGCTGATGAAATCTTAGTCTTACGA AATGGTCATGTATCTGAACGTGGTACGCACTCTAGTTTATTATCGCAACCGGATTCATAT TATCGACAACTTTGGAATCAACAACGAAGTGGAATCTTACCTACTACTATTACTAGTACT ACTAATTTTGATAATAATAACAACAATGATTGTCATAAAATATCCAGTTCAGACAGTCAA CAAACAAACACCTAAGGCACTACGTATAAATATAATGGATTAAGCTTTTCTTGAATTATG AATGTCTACACTTGTTCGATAGTTTCAGTTTTATCATTTTCTATCTGTTTTACTGACTTT TTTATACTTGAGCAGAATTCTTTTATCTTATGTTGTGTTTTCTGTTTATGCTAGATGAAT AGTTAACANATTACTTAACGTATTTAATTTGTTTTCGTGGTTGTTACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)