These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7294#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1548 fasta sequence [CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN] [-] EMBL CD073282 [CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACT ] [+] EMBL CD137869 [ AACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATAT ] [+] EMBL CD075153 [ TCAGTTATTTATTA TAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN] [-] EMBL SMAA14066 [ ATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCNTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAAT AAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCAT ] [+] EMBL CD196260 [ TATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATT AAGAACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||