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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7294#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1548 fasta sequence
[CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN]
[-] EMBL CD073282 [CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACT ]
[+] EMBL CD137869 [ AACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATAT ]
[+] EMBL CD075153 [ TCAGTTATTTATTA TAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN]
[-] EMBL SMAA14066 [ ATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCNTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAAT AAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCAT ]
[+] EMBL CD196260 [ TATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATT AAGAACT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||