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Schistosoma mansoni
cluster # 7294 cluster # 7294       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7294#0 length = 1548 sequences # 5  

consensusID : consensus_7294#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1548
fasta sequence
                              [CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN]

[-] EMBL CD073282             [CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCAACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD137869             [                                                                              AACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCAAAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCATTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGCCTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACTGTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGACTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGATTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTTCAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD075153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCAGTTATTTATTA TAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTGCACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAAATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTTTGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGCTTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTCGTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACAAATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGAAGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTAANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGACTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCAGANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATTTTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN]
[-] EMBL SMAA14066            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCNTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAAT AAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD196260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTAAATAAAACTTCAGCTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCACATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTTGACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAGCTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGCGAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAGAAATT AAGAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]


>consensus_7294#0 CCCAGATATAAATGCTAACTCAGGAATAATTGCTGGTAATCCACCATCACTTGCATGTCA ACATGTGGTTGGTTTCATAACCCACATCAACCGTGAAACCCATCAACATCTAGATGGTCA AAATTTAAAAACATTTTTACATGAATTTGGAATGAAACTAAATCGCACATTGGTAGATCA TTTTTACAACTTTACCTTCTCTGACACAGGTGGATTTGTTGCGATGCAAGATGTAACTGC CTACCGAGAAATCGCAAAGCATTTTGAGAGTCCAACTGTTAATGTTGTTTTTGATGTACT GTTTAAGCTGATGAATCTCATGCTAATTAAGCCAGAAAACGTACAACAAGTTGTTCAAGA CTATTTGCAGTCAGGAATGCCACGAGATTTGTTGATGAACTTCATTCAACTTAGGACCGA TTTTAAGTCAGCAAAGCTACAAAATGTGATACAGTTCAAATCAACAAGATAATATTTTTT CAGTTATTTATTATTAACAATTCGTGTTCTTCAAGTACTCCATAATTTCTTCATTACTTG CACCATTTTTAAACATTTCAGTTATTTTTTGTGAATATCTGTTATTAAATAAAACTTCAG CTGTTAGTGGTCCTTCCTCAACCAGCTTTGATCGCCATGAAACGTAAGGTTTTAGTTCAC ATTTATCTAAGTCATTAGGTACAATAAAATCCAAGTGTGTTTCAGGAGAAATAATTTTTT GACCATATATTTCCATGCATGTTGTTGGTTCTCTGGGAATCCAAGGGTATTTCGCACGAG CTTTGCTCTTTTTTAAGTCTAACATCCAGTGGTATCTTGTCTTATATGCAATTTTCTGGC GAAACATTAAAGGTCCCATTGCTACATTGATAGTTCGTATTGATTGTGATTTGTTGGAAG AAATTAAAGAACTTGGGACCAACCTGGTACACTGCATTACCTAGGGAATCATGTTATAAA ATCTGTAAGACGATTGTAAGCTAAGATGCAATATAATTACCACTACATAATAATAAACTT TGGGATCGCACCCGTGAACACGGAACTATTCGATAATTAAGTTTTCATAATAGATCACGC TTGACTACTGTATATTNTGTGGCTTATCACTAGATATTCATGCCCAAAATAAATTGAGTC GTCTCGNACTATAGTAAAGTTTAGTCAAATTCAGTCAAATACTACATANGACTTGTCACA AATGTGTATCACTCCAAGTTGCCCAGATANGAGCATATATGAGTGGGCACAGAAACTAGA AGTAGATTTCTCTCAAAATATAAAGATACTACGAGAAATCATGGATGGCATACAATTGTA ANNATGAGTAATGCATGCTCACTCATCGGNTGAAATCACTTACATAATGGCTGATGGCGA CTGTCAGACTCTCTTGACCGATGACACGCAAATAATGCGACANGTGACGCAGTTGCTTCA GANACACTACCGTCAATAGAAGTATTGCATTTTGGTGGGCATCTCCAGTGTGGCTGGATT TTATTGACCGTACTAGACNCAGCTCGAAAGCTATTATGACAAAAAACN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)