These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7299#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1383 fasta sequence [AAATGAAAGTTGCANCCGAAAGATTTACGTTTATGGCAAGATCGTGCTACAACTGTTGAATCATCCGGGCATGTACAATTGATGGATTTAGTACAAGTTGACCCACAAACTGTCGGTGTTGTTGTTCATGTTGAACGTGATCAAGTCTCTGTGCTAACATGTTTTGGTAAAGTTGTTAATTTAAAATCGAATACAGCATTACGTCGATTAAATACTGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCAGCNAGTACAACTCCTCGTGGTGATAGTACTCCCTTACCGAGTGCATTTAATGCTGGCATGGCTACACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAAAAAACATTGAAAAAAAACACTTATGCTTTTCTTGTTGTGGTCTTTCTGTATTTGTTATTGATACCGTTGTGGTTAAATACAATGAGGTTATGTGTATTACCGTGTAACAAGCTCATGAAGTGGTGGGGGAGGGGAGATCATCACAAATACTCATGTAAATAAGCAATGTATTAACCTCAGTACTGACAATTGTTCGCTTACATGTAACTGATCTATGTAATTTATATGTAAATTCTTTACATCGATGACATTGT] [+] EMBL CD136896 [AAATGAAAGTTGCANCCGAAAGATTTACGTTTATGGCAAGATCGTGCTACAACTGTTGAATCATCCGGGCATGTACAATTGATGGATTTAGTACAAGTTGACCCACAAACTGTCGGTGTTGTTGTTCATGTTGAACGTGATCAAGTCTCTGTGCTAACATGTTTTGGTAAAGTTGTTAATTTAAAATCGAATACAGCATTACGTCGATTAAATACTGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAAGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAAGTTTTTTGGGTATTATATGTGATGC ACACCAACGCATGTAGTGCTGGAA TACATAGTCAATTT AAAAAGTGCCTGTTGCACGTGGAAATATGGCTTTGTTA ATAATGGTGGTCG ATCATG ] [+] EMBL CD078830 [ TGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCANACACCGCATGCAGCNAGTACAACTC ] [+] EMBL CD182423 [ AAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCA ] [-] EMBL CD073290 [ GGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCAGCAAGTACAACTCCTCGTGGTGATAGTACTCCCTTACCGAGTGCATTTAATGCTGGCATGGCTACACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAA ] [+] EMBL CD194805 [ CACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAAAAAACATTGAAAAAAAACACTTATGCTTTTCTTGTTGTGGTCTTTCTGTATTTGTTATTGATACCGTTGTGGTTAAATACAATGAGGTTATGTGTATTACCGTGTAACAAGCTCATGAAGTGGTGGGGGAGGGGAGATCATCACAAATACTCATGTAAATAAGCAATGTATTAACCTCAGTACTGACAATTGTTCGCTTACATGTAACTGATCTATGTAATTTATATGTAAATTCTTTACATCGATGACATTGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||