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Schistosoma mansoni
cluster # 7299 cluster # 7299       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7299#0 length = 1383 sequences # 5  

consensusID : consensus_7299#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1383
fasta sequence
                              [AAATGAAAGTTGCANCCGAAAGATTTACGTTTATGGCAAGATCGTGCTACAACTGTTGAATCATCCGGGCATGTACAATTGATGGATTTAGTACAAGTTGACCCACAAACTGTCGGTGTTGTTGTTCATGTTGAACGTGATCAAGTCTCTGTGCTAACATGTTTTGGTAAAGTTGTTAATTTAAAATCGAATACAGCATTACGTCGATTAAATACTGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCAGCNAGTACAACTCCTCGTGGTGATAGTACTCCCTTACCGAGTGCATTTAATGCTGGCATGGCTACACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAAAAAACATTGAAAAAAAACACTTATGCTTTTCTTGTTGTGGTCTTTCTGTATTTGTTATTGATACCGTTGTGGTTAAATACAATGAGGTTATGTGTATTACCGTGTAACAAGCTCATGAAGTGGTGGGGGAGGGGAGATCATCACAAATACTCATGTAAATAAGCAATGTATTAACCTCAGTACTGACAATTGTTCGCTTACATGTAACTGATCTATGTAATTTATATGTAAATTCTTTACATCGATGACATTGT]

[+] EMBL CD136896             [AAATGAAAGTTGCANCCGAAAGATTTACGTTTATGGCAAGATCGTGCTACAACTGTTGAATCATCCGGGCATGTACAATTGATGGATTTAGTACAAGTTGACCCACAAACTGTCGGTGTTGTTGTTCATGTTGAACGTGATCAAGTCTCTGTGCTAACATGTTTTGGTAAAGTTGTTAATTTAAAATCGAATACAGCATTACGTCGATTAAATACTGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAAGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAAGTTTTTTGGGTATTATATGTGATGC ACACCAACGCATGTAGTGCTGGAA TACATAGTCAATTT AAAAAGTGCCTGTTGCACGTGGAAATATGGCTTTGTTA ATAATGGTGGTCG ATCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD078830             [                                                                                                                                                                                                                       TGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTAGACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATATTGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGTACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAACACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCANACACCGCATGCAGCNAGTACAACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD182423             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATCACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073290             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGTGGACGTGGAAAAGGTAGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAAGGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGTCAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGTATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGGACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCAGCAAGTACAACTCCTCGTGGTGATAGTACTCCCTTACCGAGTGCATTTAATGCTGGCATGGCTACACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAA                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD194805             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CACCAAAAATTAGTAATCTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGTATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATACTTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATGAAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAAAAAACATTGAAAAAAAACACTTATGCTTTTCTTGTTGTGGTCTTTCTGTATTTGTTATTGATACCGTTGTGGTTAAATACAATGAGGTTATGTGTATTACCGTGTAACAAGCTCATGAAGTGGTGGGGGAGGGGAGATCATCACAAATACTCATGTAAATAAGCAATGTATTAACCTCAGTACTGACAATTGTTCGCTTACATGTAACTGATCTATGTAATTTATATGTAAATTCTTTACATCGATGACATTGT]


>consensus_7299#0 AAATGAAAGTTGCANCCGAAAGATTTACGTTTATGGCAAGATCGTGCTACAACTGTTGAA TCATCCGGGCATGTACAATTGATGGATTTAGTACAAGTTGACCCACAAACTGTCGGTGTT GTTGTTCATGTTGAACGTGATCAAGTCTCTGTGCTAACATGTTTTGGTAAAGTTGTTAAT TTAAAATCGAATACAGCATTACGTCGATTAAATACTGTTCGTCGGCCACCACAAGCATTA GACCATAATGGAAATTCTATACAATTAAAACAAACTGTTCGCTTATTAGAGAAACCATAT TGTGGATTAATTGGTGAAGTGAAACACTTGTATCGTTCATGGGCATTCATATATTGTCGT ACACATTTAGAAAATGCTGGACTTGTTGTAGCTAAAACTCGTCAACTTTCTGCATTAAAC ACTTCACAAGGAGGTAATGAACAAAGTAATGCAGAAAATGGTATCTCAATGAAAACAATC ACACCTATCAGTGGTGCAAGAAACTTTGGCGGTAATAATGAAGGTGGACGTGGAAAAGGT AGTCGTAACGAACGTCAGCTAGTTGGCAGGACAGCTTTAATTGTTAAGGGTACATTAAAA GGTTTATTGGGTATTATATGTGATGCAACACCAACGCATGTAGTGCTGGAATTACATAGT CAATTTAAAAAAGTGCCTGTTGCACGTGAAAATATGGCTTTGTTAGATAGTGGTGGTCGT ATCATGGATACACAATATGGAGCTACTACACCTCGTATTACACCAATGCGTGAAATGCGG ACACCACAGTTGGCATATGGTGCTCAAACACCGCATGCAGCNAGTACAACTCCTCGTGGT GATAGTACTCCCTTACCGAGTGCATTTAATGCTGGCATGGCTACACCAAAAATTAGTAAT CTTGATGAACCAATGACTCCAAGTTCTAGCTTTCTATGGACTTCAAGTGATCTTCATCGT ATGTCAAATTCAAGTACTCATTCATTGTCCGATACTGAATAAATATGGAATTAATGATAC TTCGAAATACTATGATACTAATAATAACTTATTCGTTTCAAATCCATTCAGTCTGTGATG AAATAAGAATAACTGTAATAACCACAATGATTGAGATGTATACACATAAAAAACATTGAA AAAAAACACTTATGCTTTTCTTGTTGTGGTCTTTCTGTATTTGTTATTGATACCGTTGTG GTTAAATACAATGAGGTTATGTGTATTACCGTGTAACAAGCTCATGAAGTGGTGGGGGAG GGGAGATCATCACAAATACTCATGTAAATAAGCAATGTATTAACCTCAGTACTGACAATT GTTCGCTTACATGTAACTGATCTATGTAATTTATATGTAAATTCTTTACATCGATGACAT TGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)