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Schistosoma mansoni
cluster # 73 cluster # 73       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_73#0 length = 848 sequences # 2  

consensusID : consensus_73#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 848
fasta sequence
                              [TTCGGCACGAGGGTGAGTTGGAGCCGTTCGTAAAACTGGTATTTATGATGTTCTCCGTAGTGACTGGCAAGTGCGTTGTACAGGATGGCGTTGATCGTAGTCGTTCGTTTCTTTGTCTTGAGTGATGCTTAAATGGTCCTGTAGCCTTGTGTTTCTCATCCTATAAGCGCTTATCGTGGTTCTTCGGATAGTGTGAGTGCGACTCGTTGTGCGTATTGAATTTTTCTGTTTCTGAACGAAACACAATGAGTGGTCTGTGGAAGTTAGTCTTTTTGTTCAGATTGTGTTTAGTGGGTTTTACTTATTCCAAACACATTCAGGTTGCGTCAACTCATTTTCACTGTTACTTGAATGGTTGTCCCAATCTCTATCAGTCTTCGACATTCCATGTATGTATATTAATTTTGGGTTTTGTTTTTTGTCGTAGGAGATATGGGGTTGATGGTTGCCGAAGAATGTGTGCTTTCATCATGAGGCGTGAATAACTGTTGTATCGGAAAACCCTTGAACTTCCATGACTAAGGTTAAGTGGGTTGATTGGGTTACTTTTACGAGGTGTGGTTATTGAGCCTGCAATTAGCCTTCCTCCTTTATTAAGGTTTAAAGTTGTCAGCAATCCAAGGGTGCTGCAGGCGTAGTTAAATGTCTTCCCAC-AGCCGTCGTCTTTTTTATCTCCGATTATTTTAAGTATAGTTTTCGAAAATAATGTCTTCTATATACTCTGATCTTAACTTCTGTCCTACTATNTATTCAAATATTGACCCAGTGTTCGCATAAATCAACTGTCATCATTTGTTTA-TTATAATATTGGAATANCTGTTGAGTCGACCCGATTGTG-AT-AATATATC]

[+] EMBL CD079969             [TTCGGCACGAGGGTGAGTTGGAGCCGTTCGTAAAACTGGTATTTATGATGTTCTCCGTAGTGACTGGCAAGTGCGTTGTACAGGATGGCGTTGATCGTAGTCGTTCGTTTCTTTGTCTTGAGTGATGCTTAAATGGTCCTGTAGCCTTGTGTTTCTCATCCTATAAGCGCTTATCGTGGTTCTTCGGATAGTGTGAGTGCGACTCGTTGTGCGTATTGAATTTTTCTGTTTCTGAACGAAACACAATGAGTGGTCTGTGGAAGTTAGTCTTTTTGTTCAGATTGTGTTTAGTGGGTTTTACTTATTCCAAACACATTCAGGTTGCGTCAACTCATTTTCACTGTTACTTGAATGGTTGTCCCAATCTCTATCAGTCTTCGACATTCCATGTATGTATATTAATTTTGGGTTTTGTTTTTTGTCGTAGGAGATATGGGGTTGATGGTTGCCGAAGAATGTGTGCTTTCATCATGAGGCGTGAATAACTGTTGTATCGGAAAACCCTTGAACTTCCATGACTAAGGTTAAGTGGGTTGATTGGGTTACTTTTACGAGGTGTGGTTATTGAGCCTGCAATTAGCCTTCCTCCTTTATTAAGGTTTAAAGTTGTCAGCAATCCAAGGGTGCTGCAGGCGTAGTTAAATGTCTTCCCAC AGCCGTCGTCTTTTTTATCTCCGATTATTTTAAGTATAGTTTTCGAAAATAATGTCTTCTATATACTCTGATCTTAACTTCTGTCCTACTATNTATTCAAATATTGACCCAGTGTTCGCATAAATCAACTGTCATCATTTGTTTA TTATAATATTGGAATANCTGTTGAGTCGACCCGATTGTG AT AATATA  ]
[-] EMBL CD074164             [                                                                                                                                                                                                GTGAGTGCGACTCGTTGTGCGTATTGAATTTTTCTGTTTCTGAACGAAACACAATGAGTGGTCTGTGGAAGTTAGTCTTTTTGTTCAGATTGTGTTTAGTGGGTTTTACTTATTCCAAACACATTCAGGTTGCGTCAACTCATTTTCACTGTTACTTGAATGGTTGTCCCAATCTCTATCAGTCTTCGACATTCCATGTATGTATATTAATTTTGGGTTTTGTTTTTTGTCGTAGGAGATATGGGGTTGATGGTTGCCGAAGAATGTGTGCTTTCATCATGAGGCGTGAATAACTGTTGTATCGGAAAACCCTTGAACTTCCATGACTAAGGTTAAGTGGGTTGATTGGGTTACTTTTACGAGGTGTGGTTATTGAGCCTGCAATTAGCCTTCCTCCTTTATTAAGGTTTAAAGTTGTCAGCAATCCAAGGGTGCTGCAGGCGTAGTTAAATGTCTTCCCACAAGCCGTCGTCTTTTTTATCTCCGATTATTTTAAGTATAGTTTTCGAAAATAATGTCTTCTATATACTCTGATCTTAACTTCTGTCCTACTATTTATTCAAATATTGA CCAGTGTTCGCATAAATCAACTGTCATCATTTGTTTATTTATAATATTGAAGTAGCTGTGAAGTCGACCGAATTGTGAATAAATATATC]


>consensus_73#0 TTCGGCACGAGGGTGAGTTGGAGCCGTTCGTAAAACTGGTATTTATGATGTTCTCCGTAG TGACTGGCAAGTGCGTTGTACAGGATGGCGTTGATCGTAGTCGTTCGTTTCTTTGTCTTG AGTGATGCTTAAATGGTCCTGTAGCCTTGTGTTTCTCATCCTATAAGCGCTTATCGTGGT TCTTCGGATAGTGTGAGTGCGACTCGTTGTGCGTATTGAATTTTTCTGTTTCTGAACGAA ACACAATGAGTGGTCTGTGGAAGTTAGTCTTTTTGTTCAGATTGTGTTTAGTGGGTTTTA CTTATTCCAAACACATTCAGGTTGCGTCAACTCATTTTCACTGTTACTTGAATGGTTGTC CCAATCTCTATCAGTCTTCGACATTCCATGTATGTATATTAATTTTGGGTTTTGTTTTTT GTCGTAGGAGATATGGGGTTGATGGTTGCCGAAGAATGTGTGCTTTCATCATGAGGCGTG AATAACTGTTGTATCGGAAAACCCTTGAACTTCCATGACTAAGGTTAAGTGGGTTGATTG GGTTACTTTTACGAGGTGTGGTTATTGAGCCTGCAATTAGCCTTCCTCCTTTATTAAGGT TTAAAGTTGTCAGCAATCCAAGGGTGCTGCAGGCGTAGTTAAATGTCTTCCCACAGCCGT CGTCTTTTTTATCTCCGATTATTTTAAGTATAGTTTTCGAAAATAATGTCTTCTATATAC TCTGATCTTAACTTCTGTCCTACTATNTATTCAAATATTGACCCAGTGTTCGCATAAATC AACTGTCATCATTTGTTTATTATAATATTGGAATANCTGTTGAGTCGACCCGATTGTGAT AATATATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)