Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7303 cluster # 7303       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7303#0 length = 1147 sequences # 5  
consensusID : consensus_7303#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1147
fasta sequence 
                              [CTTTTTTGAATTGTAGAATATATATATAATCTTATTTCAGAAATATACACAAATATATATATATATCATAAAATGAAGAATTGTACAAAGAGGAGTATGTAGATTTGGTTCGCTTCGTTTTCTTTTTTTAAATAGACATCAAG-GATGGTATAAATGACAAAGTATACGGATAGGAA-CATGTGGGATTATAATAATAGTTATAATGATCATTGTAATAATAAATATATAGGTAGGTATGAGAAAATATACATCAATGTTTTTGAATGAGAAGTACGAAAGAG-AAAAAAATACAGACACATACATACATGCACACAAACACACACACTTTTTATTCGTCATGAAGTTTGACTTTCATCAATATATTTGTCATTTGATGTTTTCACAGGTTCTAGGGATTCCAAATGTAAGTCAACATTGGAACAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTT-GTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGATCTGCTGCAATTTCTGTATGTAATATTAAATTTTTAATTTGATCAGATAAATAATCTTTTTCATTAAATAGAATAGGACATGAAAATTGTGAATTGGACAATATACTACTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTATTGTTAGTCATAGAAATATGTAATTGACGTAGACGTGGTGATGAGAAATGTGCTTTACATGATTTTGTAGATTCATGACAAGTATGATTATCATTGTCAGTGTTAGAACTATCTTGTCCTAATTTTTCGGTACGTGGACATTTTAAAACATTTTGAAGAAAGTCATCTTGATGTAATGTACGTAAATGTCCAATTAAATCAATTCGACCACCTGATCCAAAGAAAACACGACCACATGCTTGACAACCAAGTTGTTCAATATCATTATCAGGATTTAAATGTTCTAATTCCAAATGAAGATGTAATTCTTTTAAATTATCCACTTCAATATGACAATATCTACATGAAGCTGGCCTCGTGCCAAACTTTT]

[+] EMBL CD073795             [CTTTTTTGAATTGTAGAATATATATATAATCTTATTTCAGAAATATACACCAATATATATATATATCATAAAATGAAGAATTGTACAAAGAGGAGTATGTAGATTTGGTTCGCTTCGTTTTCTTTTTTTAAATAGACATCAAG GATGGTATAAATGACAAAGTATACGGATAGGAA CATGTGGGATTATAATAATAGTTATAATGATCATTGTAATAATAAATATATAGGTAGGTATGAGAAAATATACATCAATGTTTTTGAATGAGAAGTACGAAAGAG AAAAAAATACAGACACATACATACATGCACACAAACACACACACTTTTTATTCGTCATGAAGTTTGACTTTCATCAATATATTTGTCATTTGATGTTTTCACAGGTTCTAGGGATTCCAAATGTAAGTCAACATTGGAACAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTT GTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGATCTGCTGCAATTTCTGTATGTAATATTAAATTTTTAATTTGATCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD076986             [              AGAATATATACATAATCTTATTTCAGAAATATACACAAATATATATATATATCATAAAATGAAGAATTGTACAAAGAGGAGTATGTAGATTTGGTTCGCTTCGTTTTCTTTTTTTAAATAGACATCAAGAAATGGTATAAATGACAAAGTATACGGATAGGAACCATGTGGGATTATAATAATAGTTATAATGATCATTGTAATAATAAATATATAGGTAGGTATGAGAAAATATACATCAATGTTTTTGAATGAGAAGTACGAAAGAGAAAAAAAATGCAGGCACATACATACATGCACACAAACACACACACTTTTTATTCGTCATGAAGTTTGACTTTCATCAATATATTTGTCATTTGATGTTTTCACAGGTTCTAGGGATTCCAAATGTAAGTCAACATTGGAACAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTTGGTGGNTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD073293             [                AATATATATATAATCTTATTTCAGAAATATACACAAATATATATATATATCATAAAATGAAGAATTGTACAAAGAGGAGTATGTAGATTTGGTTCGCTTCGTTTTCTTTTTTTAAATAGACATCAAG GATGGTATAAATGACAAAGTATACGGATAGGAA CATGTGGGATTATAATAATAGTTATAATGATCATTGTAATAATAAATATATAGGTAGGTATGAGAAAATATACATCAATGTTTTTGAATGAGAAGTACGAAAGAG AAAAAAATACAGACACATACATACATGCACACAAACACACACACTTTTTATTCGTCATGAAGTTTGACTTTCATCAATATATTTGTCATTTGATGTTTTCACAGGTTCTAGGGATTCCAAATGTAAGTCAACATTGGAACAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTT GTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGAACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD078833             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCAAATGTAAGTCANCATGGNANCAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTT GTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGAACTGCTGCAATTTCTGTATGTAATATTAAATTTTTAATTTGATCAGATAAATAATCTTTTTCATTAAATAGAATAGGACATGAAAATTGTGAATTGGACAATATACTACTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTATTGTTAGTCATAGAAATATGTAATTGACGTAGACGTGGTGATGAGAAATGTGCTTTACATGATTTTGTAGATTCATGACAAGTATGATTATCATTGTCAGTGTTAGAACTATCTTGTCCTAATTTTTCGGTACGTGGACATTTTAAAACATTTTGAAGAAAGTCATCTTGATGTAATGTACGTAAATGTCCAATTAAATCAATTCGACCACCTGATCCAAAGAAAACACGACCACATGCTTGACAACCAAGTTGTTCAATATCAT                                                                                                         ]
[-] EMBL CD079529             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGATCGGATTCCATAGGATGTATTGATTCTTCCATATAATCACTTGTT GTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCACATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAACAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGATCTGCTGCAATTTCTGTATGTAATATTAAATTTTTAATTTGATCAGATAAATAATCTTTTTCATTAAATAGAATAGGACATGAAAATTGTGAATTGGACAATATACTACTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTATTGTTAGTCATAGAAATATGTAATTGACGTAGACGTGGTGATGAGAAATGTGCTTTACATGATTTTGTAGATTCATGACAAGTATGATTATCATTGTCAGTGTTAGAACTATCTTGTCCTAATTTTTCGGTACGTGGACATTTTAAAACATTTTGAAGAAAGTCATCTTGATGTAATGTACGTAAATGTCCAATTAAATCAATTCGACCACCTGATCCAAAGAAAACACGACCACATGCTTGACAACCAAGTTGTTCAATATCATTATCAGGATTTAAATGTTCTAATTCCAAATGAAGATGTAATTCTTTTAAATTATCCACTTCAATATGACAATATCTACATGAAGCTGGCCTCGTGCCAAACTTTT]




>consensus_7303#0
CTTTTTTGAATTGTAGAATATATATATAATCTTATTTCAGAAATATACACAAATATATAT
ATATATCATAAAATGAAGAATTGTACAAAGAGGAGTATGTAGATTTGGTTCGCTTCGTTT
TCTTTTTTTAAATAGACATCAAGGATGGTATAAATGACAAAGTATACGGATAGGAACATG
TGGGATTATAATAATAGTTATAATGATCATTGTAATAATAAATATATAGGTAGGTATGAG
AAAATATACATCAATGTTTTTGAATGAGAAGTACGAAAGAGAAAAAAATACAGACACATA
CATACATGCACACAAACACACACACTTTTTATTCGTCATGAAGTTTGACTTTCATCAATA
TATTTGTCATTTGATGTTTTCACAGGTTCTAGGGATTCCAAATGTAAGTCAACATTGGAA
CAAGGTAAATCAGAAGCTTCAGTACTATTTGGACTAGAAGCAATACTTTGATCGGATTCC
ATAGGATGTATTGATTCTTCCATATTATCACTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTACCGCTTCA
CATATACTACGATGTGATTCAAACCTAGTATGCACATTATCACCAACAAATAAACGTGAA
CAATTTGGACAACAATATGCTAATATCATTAGACCACTTTGATCTGCTGCAATTTCTGTA
TGTAATATTAAATTTTTAATTTGATCAGATAAATAATCTTTTTCATTAAATAGAATAGGA
CATGAAAATTGTGAATTGGACAATATACTACTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTATTG
TTAGTCATAGAAATATGTAATTGACGTAGACGTGGTGATGAGAAATGTGCTTTACATGAT
TTTGTAGATTCATGACAAGTATGATTATCATTGTCAGTGTTAGAACTATCTTGTCCTAAT
TTTTCGGTACGTGGACATTTTAAAACATTTTGAAGAAAGTCATCTTGATGTAATGTACGT
AAATGTCCAATTAAATCAATTCGACCACCTGATCCAAAGAAAACACGACCACATGCTTGA
CAACCAAGTTGTTCAATATCATTATCAGGATTTAAATGTTCTAATTCCAAATGAAGATGT
AATTCTTTTAAATTATCCACTTCAATATGACAATATCTACATGAAGCTGGCCTCGTGCCA
AACTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)