cluster # 7306

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Schistosoma mansoni
cluster # 7306 cluster # 7306 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7306#0 length = 538 sequences # 5

consensusID : consensus_7306#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 538
fasta sequence

                              [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTTG]

[+] EMBL CD081707             [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTTG]
[+] EMBL CD082941             [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD076803             [ AATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTT ]
[-] EMBL CD076526             [ AATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAG TTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAAT     ]
[-] EMBL CD160161             [                                                                                         TAAGACATCAACCCATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCGCAAACTAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTC                                          ]




>consensus_7306#0
CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTG
CACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATA
ATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTA
TCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATA
TATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGT
TTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTA
ATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATG
TGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCT
TATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case