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Schistosoma mansoni
cluster # 7308 cluster # 7308       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7308#0 length = 856 sequences # 5  

consensusID : consensus_7308#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 856
fasta sequence
                              [TTAAACCATGCAAAAGTCGAAAATAACTAATCGATTATGTAGACTACCTGGTCGTTTAGATGGGAAATTAGTGATTGTAACTGGAGCAAATATTGGTTGTGGACTTGAATTAAGCGGTGAATTAGCACGTCGTGGATGTATTGTAATTATGGCTTGTCGAGATTTAGAAAAAGGATTTTTAGGAAAAGAAATACTACTTGATCGATTTGGTGATCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT-TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACGAACTGCATTATATTGCACATTAATTAATGATCCAGTACCTGGTGGTTATTAT]

[+] EMBL CD078419             [TTAAACCATGCAAAAGTCGAAAATAACTAATCGATTATGTAGACTACCTGGTCGTTTAGATGGGAAATTAGTGATTGTAACTGGAGCAAATATTGGTTGTGGACTTGAATTAAGCGGTGAATTAGCACGTCGTGGATGTATTGTAATTATGGCTTGTCGAGATTTAGAAAAAGGATTTTTAGGAAAAGAAATACTACTTGATCGATTTGGTGATCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BG931963             [                                                                                                                                                                                                                     TCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAgac                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD069069             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGT                                                                               ]
[+] EMBL CD069104             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATGGATTCCGAATTACACATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACGAACTGCATTATATTGCACATTAATTAATGATCCAGTACCTGGTGGTTATTAT]
[+] EMBL CD061255             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACAAAC                                                 ]


>consensus_7308#0 TTAAACCATGCAAAAGTCGAAAATAACTAATCGATTATGTAGACTACCTGGTCGTTTAGA TGGGAAATTAGTGATTGTAACTGGAGCAAATATTGGTTGTGGACTTGAATTAAGCGGTGA ATTAGCACGTCGTGGATGTATTGTAATTATGGCTTGTCGAGATTTAGAAAAAGGATTTTT AGGAAAAGAAATACTACTTGATCGATTTGGTGATCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATC ACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGT TGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACA TCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATAT GGAAACACATGATGGATTTGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATT AACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGC ATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACA ATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGA ATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGT ACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGG TATAAGTCCATGGGAAGGTGCACGAACTGCATTATATTGCACATTAATTAATGATCCAGT ACCTGGTGGTTATTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)