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Schistosoma mansoni
cluster # 7319 cluster # 7319       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7319#0 length = 946 sequences # 5  

consensusID : consensus_7319#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 946
fasta sequence
                              [GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT--GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA]

[+] EMBL CD129514             [GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT  GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGCAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD180534             [                                                                                                                                                                                           TGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACAACTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT  GGGGCCGAATCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL BG931166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATT GTGATGGATGGGGGGTCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGAa                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD113390             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTCTAATGGAGGCAACAGGATACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCAT                                                                    ]
[-] EMBL CD117467             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTCTAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGATTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAAT GATTTCTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA]


>consensus_7319#0 GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATA TAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAAT AATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAG GATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGA ACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAAC CATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGC TGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCTGGGGCCGAATCATAGGTAATTT AATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGC TGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGA GGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATA TATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGC TTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTA TAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGC AAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTC ATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAAC GTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)