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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7326#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 842 fasta sequence
[ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG-AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTGTTTTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTCGCATTAAAACTGGACTAGATATAACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTA-TGCTA-TACTAGTGTTCATTGTATTCGATTGATTAGTTTGTATTTCTGGTTCACAATCATCAGTTGTTTCATTAAATGATGAACTCATCAATGGGAATTCTGAGCCACGATCACGTTTATGTTGTTCG]
[+] EMBL CD170766 [ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTGTTTTACTACGACATCTTACGTCGACTGCTGA ]
[+] EMBL CD170727 [ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCGATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAGAAAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATC ]
[-] EMBL CD188135 [ AGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGGTTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACT ]
[-] EMBL CD197427 [ TACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTATTTTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTCGCATTAAAACTGGACTAGATATAACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTA TGCTA TACTAGTGTTCATTGTATTCGA ]
[-] EMBL CD068193 [ TTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTTGCATTAAAACTGGACTAGATAT ACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTACTGCTACTACTAGTGTTCATTGTATTCGATTGATTAGTTTGTATTTCTGGTTCACAATCATCAGTTGTTTCATTAAATGATGAACTCATCAATGGGAATTCTGAGCCACGATCACGTTTATGTTGTTCG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||