cluster # 7333

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Schistosoma mansoni
cluster # 7333 cluster # 7333 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7333#0 length = 944 sequences # 4

consensus_7333#1 length = 458 sequences # 1

consensusID : consensus_7333#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 944
fasta sequence

                              [TGGATAATTACTATGGATCACTAATTTGTATGGCTTTTGCATTAGCCTGCTTAGGCTTTCATTGCAGTGGTGTACTGTTAAATCCTCAAGACATGGCTCCCAATCATAGTGGTCAGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATGGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCATCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTTCAATTTCGATGATCCGCATAAATTGAAAACTCCTACCTTTTTTTAAATGTTAGTATAGACCTTGTGCCTAATTCGTTCATGTGATACACTATATTTTGTAACTGATTTGATTTACTTTTGTTTTATACTATTGTCTGTGTTGGCTAATTTTAACTGTAGAGATCACTTGAAGTTATTGGAGTTTTTTGACAATGAAAAATAATATCTTATGTTGTTTTACAGTTTGTTTAATAAAGATCAACACGAGGATTTTTGCAATTGTAGACTTTGGTGATTAATCTAAAGTCGATTATTCTTGTCAATTCTCCTATTTAATTGTTAAGATTTGTCTTTAATAAATTTCA]

[+] EMBL CD078937             [TGGATAATTACTATGGATCACTAATTTGTATGGCTTTTGCATTAGCCTGCTTAGGCTTTCATTGCAGTGGTGTACTGTTAAATCCTCAAGACATGGCTCCCAATCATAGTGGTCAGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATGGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCATCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTTCAATTTCGATGATCCGCATANATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD078714             [TGGATAATTACTATGGATCACTAATTTGTATGGCTTTTGCATTAGCCTGCTTAGGCTTTCATTGCAGTGGTGTACTGTTAAATCCTCAAGACATGGCTCCCAATCATAGTGGTCAGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATGGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCATCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073392             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTTCAATTTCGATGATCCGCATAAATTGAAAACTCCTACCTTTTTTTAAATGTTAGTATAGACCTTGTGCCTAATTCGTTCATGTGATACACTATATTTTGTAACTGATTTGATTTACTTTTGTTTTATACTATTGTCTGTGTTGGCTAATTTTAACTGTAGAGATCACTTGAAGTTATTGGAGTTTTTTGACAATGAAAAATAATATCTTATGTTGTTTTACAGTTTGTTTAATAAAGATCAACACGAGGATTTTTGCAATTGTAGACTTTGGTGATTAATCTAAAGTCGATTATTCTTGTCAATTCTCCTATTTAATTGTTAAGATTTGTCTTTAATAAATTTCA]
[-] EMBL CD073177             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTTCAATTTCGATGATCCGCATAAATTGAAAACTCCTCCCTTTTTTTAAATGTTAGTATAGACCTTGTGCCTAATTCGTTCATGTGATACACTATATTTTGTAACTGATTTGATTTACTTTTGTTTTATACTATTGTCTGTGTTGGCTAATTTTAACTGTAGAGATCACTTGAAGTTATTGGAGTTTTTTGCCAATGAAAAATAATATCTTATGTTGTTTTACAGTTTGTTTAATAAAGATCAACACGAGGATTTTTGCAATTGTAGACTTTGGTGATTAATCTAAAGTCGATTATTCTTGTCAATTCTCCTATTTAATTGTTAAGATTTGTCTTTAATAAATTTCA]




>consensus_7333#0
TGGATAATTACTATGGATCACTAATTTGTATGGCTTTTGCATTAGCCTGCTTAGGCTTTC
ATTGCAGTGGTGTACTGTTAAATCCTCAAGACATGGCTCCCAATCATAGTGGTCAGTTAT
ATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATGGTTGGTT
ATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCATCAGTA
TTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAA
TTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATT
GTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAA
GTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTT
TATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATT
TTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTT
CAATTTCGATGATCCGCATAAATTGAAAACTCCTACCTTTTTTTAAATGTTAGTATAGAC
CTTGTGCCTAATTCGTTCATGTGATACACTATATTTTGTAACTGATTTGATTTACTTTTG
TTTTATACTATTGTCTGTGTTGGCTAATTTTAACTGTAGAGATCACTTGAAGTTATTGGA
GTTTTTTGACAATGAAAAATAATATCTTATGTTGTTTTACAGTTTGTTTAATAAAGATCA
ACACGAGGATTTTTGCAATTGTAGACTTTGGTGATTAATCTAAAGTCGATTATTCTTGTC
AATTCTCCTATTTAATTGTTAAGATTTGTCTTTAATAAATTTCA

consensusID : consensus_7333#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 458
fasta sequence

                              [GAGGCCAGAATCGGCACGAGGGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATNGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATAC]

[+] EMBL CD083975             [GAGGCCAGAATCGGCACGAGGGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATNGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATAC]




>consensus_7333#1
GAGGCCAGAATCGGCACGAGGGTTATATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGG
ATTTGCAGGTGTCTATATNGTTGGTTATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGAT
CTTTATAATGACTGCTCTCAGTATTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATC
AGAAATTCTCTTTTAAGTCATAATTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAAT
ACAAACAATAGTGATTTTGAATTGTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAAT
CTGTACAAATCGACAAACTTAAAGTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAAT
AATTTATGTATATTTCATGTGTTTATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTA
GAGAAAAGAAACCTTCTTGCATTTTTTGTGTATGATAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7333#0      TGGATAATTACTATGGATCACTAATTTGTATGGCTTTTGCATTAGCCTGCTTAGGCTTTC 60
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      ATTGCAGTGGTGTACTGTTAAATCCTCAAGACATGGCTCCCAATCATAGTGGTCAGTTAT 120
consensus_7333#1      ---------------------------------GAGGCCAGAATCGGCACGAG-GGTTAT 26
                                                         *  *  ****     *    *****

consensus_7333#0      ATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATGGTTGGTT 180
consensus_7333#1      ATGGAATTATGGCTACCGTTGGTACATTTCCAGGATTTGCAGGTGTCTATATNGTTGGTT 86
                      **************************************************** *******

consensus_7333#0      ATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTCATCAGTA 240
consensus_7333#1      ATATATTAGAAGCTACAAACCAATGGTCTGTGATCTTTATAATGACTGCTCTC---AGTA 143
                      *****************************************************   ****

consensus_7333#0      TTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAA 300
consensus_7333#1      TTGTGGGTTGGGTTGGATATGTGTTGTATGGATCATCAGAAATTCTCTTTTAAGTCATAA 203
                      ************************************************************

consensus_7333#0      TTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATT 360
consensus_7333#1      TTTCCTTGAAATATCAATATTTATGTTTCTTTATAATACAAACAATAGTGATTTTGAATT 263
                      ************************************************************

consensus_7333#0      GTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAA 420
consensus_7333#1      GTTACTTTTATTCTTACATCATATTTACATATCAAATCTGTACAAATCGACAAACTTAAA 323
                      ************************************************************

consensus_7333#0      GTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTT 480
consensus_7333#1      GTGAGGTGATAACTTACATATCTTAGATATTTTCAATAATTTATGTATATTTCATGTGTT 383
                      ************************************************************

consensus_7333#0      TATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATT 540
consensus_7333#1      TATTGGTTTGGATATGCAGTCGTCTGTCGAATAGTTAGAGAAAAGAAACCTTCTTGCATT 443
                      ************************************************************

consensus_7333#0      TTTTGTGTATGATACTTTCTCTTAGTAAGACATTCTTACACATCATCGAGTGAACTGTTT 600
consensus_7333#1      TTTTGTGTATGATAC--------------------------------------------- 458
                      ***************                                             

consensus_7333#0      CAATTTCGATGATCCGCATAAATTGAAAACTCCTACCTTTTTTTAAATGTTAGTATAGAC 660
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      CTTGTGCCTAATTCGTTCATGTGATACACTATATTTTGTAACTGATTTGATTTACTTTTG 720
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      TTTTATACTATTGTCTGTGTTGGCTAATTTTAACTGTAGAGATCACTTGAAGTTATTGGA 780
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      GTTTTTTGACAATGAAAAATAATATCTTATGTTGTTTTACAGTTTGTTTAATAAAGATCA 840
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      ACACGAGGATTTTTGCAATTGTAGACTTTGGTGATTAATCTAAAGTCGATTATTCTTGTC 900
consensus_7333#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7333#0      AATTCTCCTATTTAATTGTTAAGATTTGTCTTTAATAAATTTCA 944
consensus_7333#1      --------------------------------------------