These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7337#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 592 fasta sequence [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT-GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT] [+] EMBL CD183093 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGG GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACA ] [+] EMBL CD183141 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATATT ] [+] EMBL CD182936 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATAT ] [+] EMBL CD178264 [ gcGTTGGTCGGAGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT] [+] EMBL CD195687 [ TTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTGTTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCAAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAAGTGTGTTTTATCTCTTAAATTNGCTCACAGNGGTTTATGGNTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATGGTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||