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Schistosoma mansoni
cluster # 7337 cluster # 7337       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7337#0 length = 592 sequences # 5  

consensusID : consensus_7337#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 592
fasta sequence
                              [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT-GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT]

[+] EMBL CD183093             [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGG GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD183141             [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182936             [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD178264             [                                               gcGTTGGTCGGAGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT]
[+] EMBL CD195687             [                                                                                                                                                                                                            TTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTGTTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCAAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAAGTGTGTTTTATCTCTTAAATTNGCTCACAGNGGTTTATGGNTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATGGTC                 ]


>consensus_7337#0 TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGTGGTGA ATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACT TACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTT CAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCG CCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACG CTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCA AATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGA TTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGA ACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGG TTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)