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Schistosoma mansoni
cluster # 7340 cluster # 7340       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7340#0 length = 904 sequences # 5  
consensusID : consensus_7340#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 904
fasta sequence 
                              [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC-AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAATCACTGATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGNTGTACTGATACAATTCTGAACATTTTTATGCACAAATTATTCTTCAAAAATACTCTTCATGCAATACAATCACTTAATGCTTCAAGCTTCACATTTACCGTGAAAGTATCCATCAAAGGGATATTGGCCGTAACTATATTAAGAAATGGAAGGAAAGGTTGTTTAATTCAATTTATATTTAATCAATAGCATTAAAAATCTTTTTTATACATTAGCTTGTGAGTAAATATTACTTAGATAGGACTTTTGGAAATTCTCATGTTCAGCATAAATCTGGTCTGACAGTCTATTTGTG]

[+] EMBL CD088596             [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATNTCGTCGAATCACTGATATATTGACATTNGAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGNT                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD088716             [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAGTCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACANACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTNCGTCGAATCACTAATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD088670             [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGATTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCCGACTTTGGCTAGTATCTTGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD088614             [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGCGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTANATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTNTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGNTAGTAACACAAACAGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD088679             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTTCNAGTATTACTTTGATCGATNTAGCTTGTGATTTAAATTATTGT AAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTCAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAATCACTGATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGTTGTACTGATACAATTCTGAACATTTTTATGCACAAATTATTCTTCAAAAATACTCTTCATGCAATACAATCACTTAATGCTTCAAGCTTCACATTTACCGTGAAAGTATCCATCAAAGGGATATTGGCCGTAACTATATTAAGAAATGGAAGGAAAGGTTGTTTAATTCAATTTATATTTAATCAATAGCATTAAAAATCTTTTTTATACATTAGCTTGTGAGTAAATATTACTTAGATAGGACTTTTGGAAATTCTCATGTTCAGCATAAATCTGGTCTGACAGTCTATTTGTG]




>consensus_7340#0
AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAG
GCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGA
TGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGA
AATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAA
AGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCAC
TTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTCAGTATTACTTTG
ATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGT
CATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATA
GAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTC
TTCCTCATTCCGTCGAATCACTGATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACTAA
TGGTATCGNTGTACTGATACAATTCTGAACATTTTTATGCACAAATTATTCTTCAAAAAT
ACTCTTCATGCAATACAATCACTTAATGCTTCAAGCTTCACATTTACCGTGAAAGTATCC
ATCAAAGGGATATTGGCCGTAACTATATTAAGAAATGGAAGGAAAGGTTGTTTAATTCAA
TTTATATTTAATCAATAGCATTAAAAATCTTTTTTATACATTAGCTTGTGAGTAAATATT
ACTTAGATAGGACTTTTGGAAATTCTCATGTTCAGCATAAATCTGGTCTGACAGTCTATT
TGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)